[發明專利]與豬達115公斤體重背膘厚相關的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202210287763.3
• 申請日: 2022-03-22
• 公開（公告）號: CN114752678B
• 公開（公告）日: 2023-08-25
• 發明（設計）人: 趙云翔;鄭偉杰;周玉;李斌;朱琳;夏攀潔;袁仁強
• 申請（專利權）人: 廣西揚翔股份有限公司;廣西貴港秀博基因科技股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11;A01K67/02
• 代理公司: 廣州文智專利代理事務所(特殊普通合伙) 44469
• 代理人: 梁媛

本發明公開了一種與豬達115公斤體重背膘厚相關的SNP分子標記，該分子標記位于國際豬基因組Ensembl?Sscrofa?11.1版本18號染色體第10718753bp位置處的G/A堿基突變或位于SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中第61位堿基M，所述M選自堿基G或A的SNP分子標記；該分子標記能早期、快速、低成本、有效的預測豬背膘厚度，在豬種改良方面具有廣闊的應用前景，并能夠取得優異的經濟價值。

技術領域

本發明涉及分子遺產學領域，特別涉及一種與豬達115公斤體重背膘厚相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

我國是一個養豬大國和豬肉消費大國，豬肉消費量常年居于肉制品之首。市場對于豬肉產量和質量的需求日益增加，提高豬肉產量、改善豬肉胴體質量，是育種科學家長期以來不斷探索的工作。早期的育種工作主要是基于豬的表型進行選擇，可靠性低，導致遺傳進展相對緩慢。隨著遺傳標記的廣泛開發和育種新技術的不斷推陳出新。分子標記輔助選擇育種，是在分子水平上對目標性狀進行選擇，可以不受環境影響，通過遺傳背景選擇，減少連鎖累贅，從而加速育種過程及精準度。因此，分子標記輔助選擇正逐漸成為可靠而有效的選擇方法。

分子標記(Molecular?Markers)，指可遺傳并可檢測的DNA序列。目前，廣泛應用的第三代分子標記為單核苷酸多態性(SNP)，SNP是指基因組上單個核苷酸的變異，包括轉換、顛換、插入和缺失。SNP在基因組上分布廣泛，數量多，遺傳穩定性高，更適合用于對復雜性狀與疾病的遺傳解剖以及基于群體的基因識別等方面的研究。同時，由于SNP具有二態性，且單個SNP位點突變率低，易于通過芯片技術實現自動化和規模化檢測。因此，SNP廣泛應用于基因組分析、生物信息自動化檢測、簡單和復雜疾病的遺傳研究、畜牧育種標記及全球種族遺傳學等研究。

豬的背膘厚表示脂肪多少，背膘厚度越厚瘦肉率越低，相反，則瘦肉率高。由于背膘厚與豬產肉性能有強相關性，因此，研究豬的達115公斤體重背膘厚(BF)，在育種中具有重要的研究意義。利用基因芯片檢測技術對豬群體進行GWAS研究，有助于快速篩選到影響豬達115公斤體重背膘厚的有意義的分子標記，為豬的標記輔助選擇育種提供有利的工具。

發明內容

本發明的目的是提供一種與豬達115公斤體重背膘厚相關的SNP分子標記及其應用，為豬的標記輔助選擇育種提供有利的工具。

根據本發明的一個方面，提供了與豬達115公斤體重背膘厚相關的SNP分子標記，該分子標記位于國際豬基因組Ensembl?Sscrofa?11.1版本18號染色體第10718753bp位置處的G/A堿基突變。

在某些實施方式中，該SNP分子標記位于SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中第61位堿基M，所述M選自堿基G或A。

本發明的第二個方面，提供了一種位于國際豬基因組Ensembl?Sscrofa11.1版本18號染色體第10718753bp位置處的G/A堿基突變的SNP分子標記或位于SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中第61位堿基M，所述M選自堿基G或A的SNP分子標記在瘦肉型豬選育上的應用。

在某些實施方式中，上述SNP分子標記在瘦肉型豬選育上的應用方法包括：

1)對豬仔檢測所述的分子標記；

2)選留步驟1)中檢測得到的等位基因型為GG基因型的個體，進行繁育，即可得到瘦肉型豬。

本發明的第三個方面，提供了一種位于國際豬基因組Ensembl?Sscrofa11.1版本18號染色體第10718753bp位置處的G/A堿基突變的SNP分子標記或位于SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中第61位堿基M，所述M選自堿基G或A的SNP分子標記在培育瘦肉型豬品系上的應用。

在某些實施方式中，上述SNP分子標記在培育瘦肉型豬品系上的應用方法包括：