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[發明專利]用于推薦藥物的方法、電子設備和計算機存儲介質有效

專利信息
申請號: 202210245669.1 申請日: 2022-03-14
公開(公告)號: CN114334078B 公開(公告)日: 2022-06-14
發明(設計)人: 王傲迪;楊振華;俞燕飛;許甜;鄭玉鳳 申請(專利權)人: 至本醫療科技(上海)有限公司;上海至本醫學檢驗所有限公司
主分類號: G16H20/10 分類號: G16H20/10;G16H70/40;G16B20/20
代理公司: 北京市金杜律師事務所 11256 代理人: 王茂華
地址: 201203 上海市浦東新*** 國省代碼: 上海;31
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摘要:
搜索關鍵詞: 用于 推薦 藥物 方法 電子設備 計算機 存儲 介質
【說明書】:

本公開涉及一種用于推薦藥物的方法、計算設備和存儲介質。該方法包括:構建瘤種藥物藥效數據集合,藥物藥效條目用于指示基因、基因變異、腫瘤類型、藥物、藥效、以及證據等級之間的對應關系;基于待測對象的腫瘤類型信息、基因變異信息,從瘤種藥物藥效數據集合中篩選出候選藥物藥效條目;針對滿足預定條件的候選藥物藥效條目所指示的證據等級進行轉換;確定與待測對象的每一個基因變異信息所對應的最高證據等級;以及至少針對與待測對象的基因的多個基因變異所分別對應的最高證據等級進行加權,以便確定針對所述基因的最終藥物藥效表征數據,以用于推薦關于待測對象的藥物。本公開有效提高針對差異化患者推薦匹配用藥方案的效率。

技術領域

本公開總體上涉及生物信息處理,并且具體地,涉及用于推薦藥物的方法、電子設備和計算機存儲介質。

背景技術

隨著分子生物學和測序技術的發展以及腫瘤發生分子機制的深入研究,腫瘤患者的前瞻性臨床測序越來越被認為是常規癌癥護理的一個組成部分。例如,通過腫瘤測序可以為患者匹配可靶向具體變異或下游通路的治療藥物,這些變異或通路能夠驅動單個腫瘤的生長和/或進展。

傳統的推薦藥物的方法例如是基于高通量測序技術,準確監測患者腫瘤基因突變信息,然后經由臨床醫生結合已有基因變異的臨床意義描述來分析靶向藥物相關基因的突變狀態, 從而為患者篩選出最可能從中受益的靶向藥物。由于每位患者所攜帶的突變基因、突變位點不同,導致了患者對腫瘤藥物的反應各不相同。已有基因變異的臨床意義描述難以全面覆蓋患者所攜帶的突變情形。另外,基因變異的臨床意義描述(例如包括:是否可以推藥用藥等)現在主要存在于FDA、NCCN指南、專家共識、會議記錄、科學文獻等不同資源處,缺乏統一的支持工具、以及數據描述方式,有的臨床意義描述甚至存在沖突,因此對臨床醫生帶來更大的挑戰,需要臨床醫生人工花費大量的時間與精力去分別訪問、查詢不同資源,以及針對所查詢的臨床意義描述進行解釋與分析,進而使得臨床醫生難以快速針對差異化患者制定個體化匹配用藥方案。另外,在對所查詢的臨床意義描述進行解釋與分析時,受限于臨床醫生個體的主觀因素以及有限經驗,難以高效地為每個腫瘤患者做出相對最佳的用藥方案。

綜上,傳統的用于推薦藥物的方法存在的不足之處在于:難以有效提高針對差異化患者推薦匹配用藥方案的效率。

發明內容

本公開提供一種推薦藥物的方法、電子設備和計算機存儲介質,能夠有效提高針對差異化患者推薦匹配用藥方案的效率。

根據本公開的第一方面,提供了一種用于推薦藥物的方法。該方法包括:構建瘤種藥物藥效數據集合,瘤種藥物藥效數據集合包括多個藥物藥效條目,每一個藥物藥效條目用于指示基因、基因變異、腫瘤類型、藥物、藥效、以及證據等級之間的對應關系;基于待測對象的腫瘤類型信息、基因變異信息,從瘤種藥物藥效數據集合中篩選出候選藥物藥效條目,候選藥物藥效條目至少包括:與腫瘤類型信息和基因變異信息所對應的藥物藥效條目,以及與基因變異信息所對應的跨適應癥的藥物藥效條目;針對滿足預定條件的候選藥物藥效條目所指示的證據等級進行轉換;在候選藥物藥效條目中確定與待測對象的每一個基因變異信息所對應的最高證據等級;以及至少針對與待測對象的基因的多個基因變異所分別對應的最高證據等級進行加權,以便確定針對基因的最終藥物藥效表征數據,以用于推薦關于待測對象的藥物。

根據本發明的第二方面,還提供了一種計算設備,該設備包括:存儲器,被配置為存儲一個或多個計算機程序;以及處理器,耦合至存儲器并且被配置為執行一個或多個程序使裝置執行本公開的第一方面的方法。

根據本公開的第三方面,還提供了一種非瞬態計算機可讀存儲介質。該非瞬態計算機可讀存儲介質上存儲有機器可執行指令,該機器可執行指令在被執行時使機器執行本公開的第一方面的方法。

在一些實施例中,證據等級至少包括:用于指示腫瘤藥物響應水平的多個證據等級、用于指示腫瘤藥物耐藥水平的多個的證據等級。

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