[發明專利]與西瓜短下胚軸基因Clsh共分離的分子標記及應用

在審

• 申請號: 202210077047.2
• 申請日: 2022-01-19
• 公開（公告）號: CN114381546A
• 公開（公告）日: 2022-04-22
• 發明（設計）人: 楊路明;楊森;王登科;孫守如;豆峻嶺;徐志紅
• 申請（專利權）人: 河南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11
• 代理公司: 北京華際知識產權代理有限公司 11676
• 代理人: 袁瑞紅

1.與西瓜短下胚軸基因Clsh共分離的分子標記，其特征在于，擴增所述分子標記的引物對的上游引物序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物序列如SEQ ID NO.2所示。

2.根據權利要求1所述的與西瓜短下胚軸基因Clsh共分離的分子標記，其特征在于，所述分子標記為SNP標記。

3.權利要求1所述與西瓜短下胚軸基因共分離Clsh的分子標記在西瓜分子育種中的應用。

4.根據權利要求3所述的應用，其特征在于，所述分子標記用于鑒定或輔助鑒定西瓜短下胚軸性狀。

5.一種西瓜短下胚軸性狀的判定方法，其特征在于，所述判定方法包括如下步驟：

(1)提取待測西瓜基因組DNA；

(2)以步驟(1)中所提取基因組DNA為模板，利用權利要求1所述的分子標記引物對對模板進行PCR擴增，對PCR擴增產物進行測序；

(3)根據步驟(2)的測序結果進行判定，具體標準為：

使用Sanger測序對PCR擴增產物進行檢測，產物全長為580bp，若擴增產物的第245位堿基表現為單峰且為G，則說明待測西瓜為純合正常下胚軸材料；若擴增產物的第245位堿基表現為單峰且為A，則說明待測西瓜為純合短下胚軸材料；若擴增產物的第245位堿基表現為雙峰，則說明待測西瓜為雜合正常下胚軸材料。

6.一種判斷西瓜下胚軸基因型的方法，其特征在于，所述方法包括如下步驟：

(1)提取待測西瓜基因組DNA；

(2)以步驟(1)中所提取基因組DNA為模板，利用權利要求1所述的分子標記引物對對模板進行PCR擴增，對PCR擴增產物進行測序；

(3)根據步驟(2)的測序結果進行判定，具體標準為：

使用Sanger測序對PCR擴增產物進行檢測，產物全長為580bp，若擴增產物的第245位堿基表現為單峰且為G，則說明待測西瓜的基因型為ClSH/ClSH；若擴增產物的第245位堿基表現為單峰且為A，則說明待測西瓜的基因型為Clsh/Clsh；若擴增產物的第245位堿基表現為雙峰，則說明待測西瓜的基因型為ClSH/Clsh。

7.一種用于鑒定西瓜短下胚軸性狀的試劑盒，其特征在于，包含權利要求1中所述的引物對。

8.用于檢測SNP標記是否存在的試劑在西瓜短下胚軸基因Clsh定位中的應用，其特征在于，擴增所述標記的引物對的上游引物序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物序列如SEQ IDNO.2所示。