[發明專利]一種與豬胴體性狀相關的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202210065972.3
• 申請日: 2022-01-20
• 公開（公告）號: CN114350820B
• 公開（公告）日: 2023-10-20
• 發明（設計）人: 武華玉;喬木;彭先文;吳俊靜;梅書棋;周佳偉;張宇;徐忠;李梓芃;宋忠旭;孫華;李良華;趙海忠;董斌科
• 申請（專利權）人: 湖北省農業科學院畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識產權代理有限公司 11562
• 代理人: 許佳

本發明公開了一種與豬胴體性狀相關的分子標記及其應用，屬于豬分子標記制備領域。所述分子標記的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，該序列的第371bp處存在A/G堿基突變；SEQ ID NO:1所示序列的第371bp處存在AA、AG或GG三種基因型，其中A等位基因為優勢等位基因。本發明還提供了用于檢測該位點的引物對，并建立了相應的檢測方法，為豬胴體品質的遺傳改良提供了新的分子標記，實現了對豬胴體性狀進行早期選擇；檢測方法高效、準確，從而加速了豬遺傳改良的進程，提高了豬育種的經濟效益。

技術領域

本發明涉及豬分子標記制備領域，特別是涉及一種與豬胴體性狀相關的分子標記及其應用。

背景技術

豬胴體性狀一直是豬重要的經濟性狀，是遺傳改良的目標性狀之一。胴體性狀主要有屠宰率、內脂率、背膘厚、瘦肉率、眼肌面積等。屠宰率和胴體瘦肉率高的豬能帶來更高的經濟效益。由于胴體性狀無法進行活體測定，常規育種方法對這類性狀的改良無法實施個體選擇，往往采用同胞選擇進行改良，其改良效果不佳。分子標記輔助選擇(Marker-assisted sel ection,MAS)的出現大大加速了豬育種的進程，它是利用與特定性狀相關聯的分子標記作為輔助手段進行選擇育種，具有快速、準確、不受環境影響等優點，不僅能大大減少育種的人力物力消耗，而且能縮短育種時限。

用于MAS的分子標記包括蛋白質標記，微衛星標記，單核苷酸多態性(singlenucleotide polymorphism，簡稱SNP)標記等。SNP標記指由基因組單核苷酸變異引起的DNA序列多態性，包括堿基轉換、顛換、缺失或插入等。隨著豬基因組測序和高密度SNP的開發，發掘了一些與豬胴體性狀相關的基因和SNP標記，然而，仍缺少功能明確、效應顯著且可直接用于育種的與胴體性狀相關的SNP標記。因此，有必要深入挖掘與豬胴體性狀相關的SNP分子標記，以利用其選育高品質豬肉的豬種，實現我國豬育種理論和技術水平的提升。

胞質5′核苷酸酶1A(cytosolic 5'-nucleotidase 1A,NT5C1A)基因，在人的骨骼肌和小鼠的脛骨前肌表達量較高(Hunsucker et al.,2001；Sala-N ewby et al.,1999)；抗NT5C1A自身抗體可以作為包涵體肌炎(一種肌肉疾病)的標記物(Amlani et al.,2019)。迄今為止，尚無有關NT5C1A基因作為豬胴體性狀分子標記的相關報道。

發明內容

本發明的目的是提供一種與豬胴體性狀相關的分子標記及其應用，以解決上述現有技術存在的問題，為豬胴體性狀的分子標記輔助育種提供一種新的分子標記，以縮短育種進程，提高育種效率。

為實現上述目的，本發明提供了如下方案：

本發明提供一種與豬胴體性狀相關的分子標記，所述分子標記的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，該序列的第371bp處存在A/G堿基突變。

優選的是，SEQ ID NO:1所示序列的第371bp處存在AA、AG或G G三種基因型，其中A等位基因為優勢等位基因。

本發明還提供一種擴增所述的分子標記的引物對，所述引物對包括如SEQ ID NO:2所示的上游引物和如SEQ ID NO:3所示的下游引物。

本發明還提供一種檢測豬胴體性狀的試劑盒，包括所述的分子標記，或者所述的引物對。

本發明還提供一種檢測豬胴體性狀的方法，包括如下步驟：

步驟1：以待測豬個體的DNA為模板，利用權利要求3所述的引物對擴增，獲取擴增產物；

步驟2：對所述擴增產物進行測序，并使用基因分析軟件對測序結果進行基因分型。

優選的是，擴增體系為：DNA模板100ng、PCR mix 25μL、上游引物和下游引物各1μL、加ddH₂O補至總體積50μL。