[發(fā)明專利]一種用于評估蛋白質組還原烷基化效率的質控方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202111488273.1 | 申請日: | 2021-12-08 |
| 公開(公告)號: | CN113884561B | 公開(公告)日: | 2022-02-22 |
| 發(fā)明(設計)人: | 陳亮宇;閆豪杰;宋雷;李捷 | 申請(專利權)人: | 譜天(天津)生物科技有限公司 |
| 主分類號: | G01N27/62 | 分類號: | G01N27/62 |
| 代理公司: | 南京中律知識產(chǎn)權代理事務所(普通合伙) 32341 | 代理人: | 祝坤 |
| 地址: | 300308 天津*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 評估 蛋白質 還原 烷基化 效率 方法 | ||
1.一種用于評估蛋白質組還原烷基化效率的質控方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)還原烷基化之前的任一步驟,在蛋白樣品或肽段樣品中加入含有至少兩個半胱氨酸的多肽或蛋白標品,然后進行還原烷基化、酶解、除鹽和/或分離,至上機檢測;所述多肽或蛋白標品為合成的標準品,酶切后的肽段與樣品內源性肽段沒有重復;所述多肽或蛋白標品可被特定蛋白酶酶切為至少兩個肽段,其中一個至少含有兩個半胱氨酸,一個不含有半胱氨酸;
(2)質譜原始數(shù)據(jù)經(jīng)軟件分析后得到可鑒定肽段,分別找出該標品含有半胱氨酸的肽段以及不含半胱氨酸的肽段,標品還原烷基化率=(含半胱氨酸的肽段峰面積/不含半胱氨酸的肽段峰面積)*100%;
(3)根據(jù)樣品中標品還原烷基化率,評估同批次不同樣本間或者不同批次間還原烷基化的效率。
2.根據(jù)權利要求1所述的用于評估蛋白質組還原烷基化效率的質控方法,其特征在于,步驟(2)中,所述軟件為蛋白質組分析軟件。
3.根據(jù)權利要求1所述的用于評估蛋白質組還原烷基化效率的質控方法,其特征在于,步驟(2)中,所述軟件選自Spectronaut軟件。
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