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[發明專利]一種BCR-ABL基因融合檢測的校準品和參考品的制備方法及其應用在審

專利信息
申請號: 202110962099.3 申請日: 2021-08-20
公開(公告)號: CN113667751A 公開(公告)日: 2021-11-19
發明(設計)人: 程雪濤;王潔;張亞飛 申請(專利權)人: 邁杰轉化醫學研究(蘇州)有限公司
主分類號: C12Q1/6886 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 北京品源專利代理有限公司 11332 代理人: 邊人洲
地址: 215000 江蘇省蘇州市蘇州工*** 國省代碼: 江蘇;32
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 bcr abl 基因 融合 檢測 校準 參考 制備 方法 及其 應用
【說明書】:

發明提供了一種BCR?ABL基因融合檢測的校準品和參考品的制備方法及其應用,方法包括:分別制備ABL野生型裝甲RNA和BCR?ABL融合型裝甲RNA;使用保護稀釋液分別對所述ABL野生型裝甲RNA和BCR?ABL融合型裝甲RNA進行溶解;通過數字PCR對所述ABL野生型裝甲RNA和BCR?ABL融合型裝甲RNA的濃度進行檢測;使用保護稀釋液對所述ABL野生型裝甲RNA和BCR?ABL融合型裝甲RNA進行梯度稀釋,得到校準品;將ABL野生型裝甲RNA校準品和BCR?ABL融合型裝甲RNA校準品按比例混合,得到參考品。制得的校準品和參考品與WHO一級標準品溯源性好,結果準確。

技術領域

本發明屬于生物技術領域,尤其涉及一種BCR-ABL基因融合檢測的校準品和參考品的制備方法及其應用。

背景技術

慢性髓系白血病(CML)是一種以中晚幼粒細胞惡性增殖為特征的疾病,約90%~95%的CML患者中可檢測到BCR-ABL融合基因(即9號染色體上的ABL基因易位到22號染色體上的BCR基因上形成融合基因),可用于CML的分型診斷、療效評價,以及作為微小殘留病的檢測和預后評估的可靠指標。

目前,臨床常用檢測方法包括常規染色體分析、熒光原位雜交(FISH)和熒光定量PCR。NCCN指南推薦CML患者達到CCyR(完全細胞學緩解)后應該每三個月進行一次BCR-ABL熒光定量PCR檢測,用來監測殘留白血病細胞有否上升、下降或處于穩定狀態。

目前,BCR-ABL熒光定量PCR檢測已國際標準化,考慮到實驗的不同條件(如不同的參考基因、PCR引物、提取方法及熒光定量PCR體系、反轉錄體系等)的差異,各實驗室的檢測結果需和WHO一級標準品進行比對,并建立轉換系數(CF),從而將BCR-ABL的定量結果轉換成國際標準值(IS)。

然而,WHO一級標準品貨期漫長,手續繁多,且經過提取后獲得的RNA量很少,不能滿足企業的研發、驗證及質檢的需求。此外,現有技術往往不能與WHO一級參考品進行溯源,定量結果缺乏可靠性;或即使能溯源,但和理論值差異較大;或不同的參考品制備批次間存在較大的批間差異,不能保持良好的一致性。

因此,如何提供一種容易獲取的校準品及參考品,可以用于試劑的研發、驗證及質檢中,已成為亟待解決的問題。

發明內容

針對現有技術的不足和實際需求,本發明提供一種BCR-ABL基因融合檢測的校準品和參考品的制備方法及其應用,制備得到的校準品和參考品具有良好的擴增效率,批間差異小,可以與WHO一級標準品進行很好的溯源,校正系數十分接近1.0(即檢測值等同于理論值),應用價值極高。

為達此目的,本發明采用如下技術方案:

第一方面,本發明提供了一種BCR-ABL基因融合檢測的校準品和參考品的制備方法,所述制備方法包括:

分別制備ABL野生型裝甲RNA和BCR-ABL融合型裝甲RNA;

使用保護稀釋液分別對所述ABL野生型裝甲RNA和BCR-ABL融合型裝甲RNA進行溶解;

通過數字PCR對所述ABL野生型裝甲RNA和BCR-ABL融合型裝甲RNA的濃度進行檢測;

使用保護稀釋液對所述ABL野生型裝甲RNA和BCR-ABL融合型裝甲RNA進行梯度稀釋,得到校準品;將ABL野生型裝甲RNA校準品和BCR-ABL融合型裝甲RNA校準品按比例混合,得到參考品。

本發明中,選用裝甲RNA用于制備校準品及參考品,可以與WHO一級標準品在核酸層面保持一致;加入保護稀釋液,可以提高并穩定反應的擴增效率,減少或消除批間差異;選用數字PCR進行檢測,對于裝甲RNA的定量檢測更準確;制備得到的校準品和參考品能夠與WHO一級標準品進行很好的溯源,校正系數十分接近1.0。

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