[發(fā)明專利]一種鱖魚耐低氧性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記及其應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110784484.3 | 申請日： | 2021-07-12 |
| 公開（公告）號： | CN113502336B | 公開（公告）日： | 2022-12-02 |
| 發(fā)明（設(shè)計）人： | 丁煒東;曹麗萍;曹哲明;邴旭文 | 申請（專利權(quán)）人： | 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心 |
| 主分類號： | C12Q1/6888 | 分類號： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京經(jīng)緯專利商標(biāo)代理有限公司 32200 | 代理人： | 曹翠珍 |
| 地址： | 214000 江蘇省無錫*** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 一種 鱖魚 低氧 性狀 相關(guān) snp 分子 標(biāo)記 及其 應(yīng)用 | ||
1.一種用于檢測鱖魚耐低氧性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記的引物對，其特征在于，所述鱖魚耐低氧性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記包括分子標(biāo)記SNP1和分子標(biāo)記SNP2；所述分子標(biāo)記SNP1位于如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列自5’端起的第1919位，該處堿基為T或C；所述分子標(biāo)記SNP2位于如SEQ ID NO.1所示核苷酸序列自5’端起的第4784位，該處堿基為T或C；
所述引物對包括用于檢測分子標(biāo)記SNP1的引物對和用于檢測分子標(biāo)記SNP2的引物對；
所述用于檢測分子標(biāo)記SNP1的引物對，其上游引物和下游引物分別具有SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列；
所述用于檢測分子標(biāo)記SNP2的引物對，其上游引物和下游引物分別具有SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的核苷酸序列。
2.一種用于檢測鱖魚耐低氧性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒中含有如權(quán)利要求1所述的引物對。
3.權(quán)利要求1所述引物對或權(quán)利要求2所述試劑盒在鱖魚選育中的應(yīng)用。
4.一種檢測鱖魚耐低氧性狀的方法，其特征在于，通過對待測鱖魚進(jìn)行如權(quán)利要求1所述鱖魚耐低氧性狀相關(guān)SNP分子標(biāo)記的檢測，確定待測鱖魚的耐低氧能力。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種檢測鱖魚耐低氧性狀的方法，其特征在于，包括以下步驟：
步驟1)提取待測鱖魚尾鰭DNA；
步驟2)基于權(quán)利要求1所述的引物對或權(quán)利要求2所述的試劑盒，對待測鱖魚的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，以獲得PCR擴(kuò)增產(chǎn)物；
步驟3)對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序，基于測序結(jié)果，確定SNP分子標(biāo)記的基因型；
步驟4)通過基因型確定待測鱖魚的耐低氧能力：
所述分子標(biāo)記SNP1位點(diǎn)的TT基因型個體的耐低氧性狀顯著高于TC基因型個體；所述分子標(biāo)記SNP2位點(diǎn)的TC基因型個體的耐低氧性狀顯著高于TT基因型個體。
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