[發(fā)明專利]與肺癌預(yù)后相關(guān)的生物標(biāo)志物及其應(yīng)用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202110726864.1 | 申請日: | 2021-06-29 |
| 公開(公告)號: | CN113388683A | 公開(公告)日: | 2021-09-14 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 楊承剛;李雨晨 | 申請(專利權(quán))人: | 北京泱深生物信息技術(shù)有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;G01N33/574;G16H50/30 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 100176 北京市大興區(qū)*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 肺癌 預(yù)后 相關(guān) 生物 標(biāo)志 及其 應(yīng)用 | ||
1.檢測生物標(biāo)志物的試劑在制備預(yù)測肺癌預(yù)后的產(chǎn)品中的應(yīng)用,其特征在于,所述生物標(biāo)志物包括ARNTL2、ERO1A和/或FAM83A。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的應(yīng)用,其特征在于,所述生物標(biāo)志物為ARNTL2、ERO1A和FAM83A。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用,其特征在于,所述試劑包括通過數(shù)字成像技術(shù)、蛋白免疫技術(shù)、染料技術(shù)、核酸測序技術(shù)、核酸雜交技術(shù)、色譜技術(shù)、質(zhì)譜技術(shù)檢測樣本中生物標(biāo)志物表達(dá)水平的試劑。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的應(yīng)用,其特征在于,所述試劑樣本包括組織、體液。
5.一種預(yù)測肺癌預(yù)后的產(chǎn)品,其特征在于,所述產(chǎn)品包括檢測生物標(biāo)志物的試劑,所述生物標(biāo)志物包括ARNTL2、ERO1A和/或FAM83A;
優(yōu)選地,所述產(chǎn)品包括芯片、試劑盒;
優(yōu)選地,所述試劑盒包括qPCR試劑盒、免疫印跡檢測試劑盒、免疫層析檢測試劑盒、流式細(xì)胞分析試劑盒、免疫組化檢測試劑盒、ELISA試劑盒和電化學(xué)發(fā)光檢測試劑盒;
優(yōu)選地,所述試劑盒還包括用于預(yù)測肺癌預(yù)后的說明書。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的產(chǎn)品,其特征在于,所述試劑包括與所述生物標(biāo)志物基因特異性結(jié)合的引物或探針;與所述標(biāo)志物蛋白特異性結(jié)合的抗體、肽、適配體或化合物。
7.一種預(yù)測肺癌預(yù)后的系統(tǒng)/裝置,其特征在于,包括:
獲取單元,用于獲取待測樣本中生物標(biāo)志物的數(shù)據(jù),所述生物標(biāo)志物包括ARNTL2、ERO1A和/或FAM83A;
處理單元,用于將所述生物標(biāo)志物的數(shù)據(jù)輸入肺癌預(yù)后預(yù)測模型中,獲得待測樣本肺癌進(jìn)展的預(yù)測結(jié)果;
優(yōu)選地,所述預(yù)后預(yù)測模型為Cox回歸模型;
優(yōu)選地,所述Cox回歸模型為LASSOCox回歸模型;
優(yōu)選地,所述預(yù)后預(yù)測模型的公式為風(fēng)險(xiǎn)評分=C1*ExpARNTL2+C2*Exp ERO1A+C3*ExpFAM83A;
優(yōu)選地,所述C1、C2、C3分別為0.1219、0.235、0.0908。
8.一種計(jì)算機(jī)可讀存儲介質(zhì),其特征在于,其存儲有程序,所述程序用于執(zhí)行由生物標(biāo)志物ARNTL2、ERO1A和/或FAM83A構(gòu)建的肺癌預(yù)后預(yù)測模型;
優(yōu)選地,所述預(yù)后預(yù)測模型為Cox回歸模型;
優(yōu)選地,所述Cox回歸模型為LASSOCox回歸模型;
優(yōu)選地,所述預(yù)后預(yù)測模型的公式為風(fēng)險(xiǎn)評分=C1*ExpARNTL2+C2*ExpERO1A+C3*ExpFAM83A;
優(yōu)選地,所述C1、C2、C3分別為0.1219、0.235、0.0908。
9.一種電子設(shè)備,其特征在于,包括:
客戶端組件,其中所述客戶端組件包含用戶界面;
服務(wù)器組件,其中所述服務(wù)器組件包含至少一個存儲器單元,該至少一個存儲器單元被配置為接收包含從樣本中生成的生物標(biāo)志物的測序數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)輸入,所述生物標(biāo)志物包括ARNTL2、ERO1A和/或FAM83A;
與所述服務(wù)器組件可操作地耦合的所述用戶界面;以及
與所述至少一個存儲器單元可操作地耦合的計(jì)算機(jī)處理器,其中所述計(jì)算機(jī)處理器被編程為可執(zhí)行程序,可執(zhí)行程序用于運(yùn)行由生物標(biāo)志物構(gòu)建的肺癌預(yù)后預(yù)測模型;
優(yōu)選地,所述預(yù)后預(yù)測模型為Cox回歸模型;
優(yōu)選地,所述Cox回歸模型為LASSOCox回歸模型;
優(yōu)選地,所述預(yù)后預(yù)測模型的公式為風(fēng)險(xiǎn)評分=C1*ExpARNTL2+C2*ExpERO1A+C3*ExpFAM83A;
優(yōu)選地,所述C1、C2、C3分別為0.1219、0.235、0.0908。
10.檢測生物標(biāo)志物的試劑在制備藥物治療肺癌的效果評價(jià)的產(chǎn)品中的應(yīng)用,其特征在于,所述生物標(biāo)志物包括ARNTL2、ERO1A和/或FAM83A;
優(yōu)選地,所述試劑包括與所述生物標(biāo)志物基因特異性結(jié)合的引物或探針;與所述標(biāo)志物蛋白特異性結(jié)合的抗體、肽、適配體或化合物。
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