[發明專利]一種用于預測射血分數保留型心衰風險的模型在審
| 申請號: | 202110686960.8 | 申請日: | 2021-06-21 |
| 公開(公告)號: | CN113421648A | 公開(公告)日: | 2021-09-21 |
| 發明(設計)人: | 方向東;趙學彤;渠鴻竹;董蔚 | 申請(專利權)人: | 中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心) |
| 主分類號: | G16H50/50 | 分類號: | G16H50/50;G16H50/30 |
| 代理公司: | 北京精金石知識產權代理有限公司 11470 | 代理人: | 尉月麗 |
| 地址: | 100101 北京市朝陽區北辰西*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 用于 預測 分數 保留 心衰 風險 模型 | ||
1.一種預測射血分數保留型心衰風險的標志物組合,其特征在于,包括:
甲基化位點的beta值,所述的甲基化位點包括:cg06344265、cg27401945、cg25755428、cg24205914、cg23299445、cg21429551、cg21024264、cg20051875、cg17766026、cg16781992、cg13352914、cg11853697、cg10556349、cg10083824、cg08614290、cg08101977、cg07041999、cg05845376、cg05481257、cg05363438、cg03556243、cg03233656、cg00522231、cg00495303、cg00045910;
患者年齡;
是否服用利尿劑類藥物;
BMI;
尿白蛋白;
血清肌酐。
2.一種預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,所述的模型采集的信息包括以下標志物組合:
患者年齡;是否服用利尿劑類藥物;BMI;尿白蛋白;血清肌酐;甲基化位點的beta值;
所述的甲基化位點包括:cg06344265、cg27401945、cg25755428、cg24205914、cg23299445、cg21429551、cg21024264、cg20051875、cg17766026、cg16781992、cg13352914、cg11853697、cg10556349、cg10083824、cg08614290、cg08101977、cg07041999、cg05845376、cg05481257、cg05363438、cg03556243、cg03233656、cg00522231、cg00495303、cg00045910。
3.根據權利要求2所述的預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,所述的模型通過對特征篩選得到的標志物組合使用DeepFM算法執行建模。
4.根據權利要求3所述的預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,所述的模型的建立方法包括在DeepFM算法中輸入sigmoid函數,用于射血分數保留型心衰事件的早期預測,輸出為:
其中,是預測的射血分數保留型心衰事件,yFM是FM分量的輸出,yDNN是DNN分量的輸出。
5.根據權利要求4所述的預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,所述的FM分量的輸出是一個加法單位和若干個內積單位的總和,FM分量的輸出為:
其中w∈Rd、Vi∈Rk(k已知);另外的加量單位w,x反映了order-1特征的重要性,內積單元代表了order-2特征交互的影響。
6.根據權利要求4所述的預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,所述的DNN分量的輸出為:
yDNN=W|H|+1·a|H|+b|H|+1;
其中|H|為隱含層數,a(l)為嵌入層的輸出,W(l)為模型權值,b(l)為第l層的偏差。
7.根據權利要求5所述的預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,對于一個給定的深層隱含層,利用ReLU作為激活函數實現一個包含兩個隱含層(256,256)的深層神經網絡:
y=f(x)=relu(wx+b),
這里使用logloss作為目標函數,為了控制過擬合,在節點上添加L2正則化懲罰,參數設置為0.0001。
8.根據權利要求2所述的所述的預測射血分數保留型心衰風險的模型,其特征在于,所述的DeepFM模型的性能評估采用三折交叉驗證,使用Adam作為優化算法,學習率設置為0.0001,epoch設置為400,dropout設置為60%。
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