[發明專利]基于納米孔測序平臺的組織樣本宏基因組建庫和檢測方法

有效

• 申請號: 202110650442.0
• 申請日: 2021-06-10
• 公開（公告）號: CN113249440B
• 公開（公告）日: 2022-03-22
• 發明（設計）人: 周水蓮;程彪;潘吾思;趙成娜;戶銀芝;李詩濛;任用
• 申請（專利權）人: 南京先聲醫學檢驗實驗室有限公司;北京先聲醫學檢驗實驗室有限公司;江蘇先聲診斷技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6806
• 分類號: C12Q1/6806;C40B50/06
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.一種用于納米孔測序平臺的組織樣本宏基因組建庫的組織樣本處理方法，其特征在于，所述方法包括：

步驟1）組織樣本破碎；所述破碎采用MP的Lysing Matrix A管進行破碎；

步驟2）組織樣本病原體破壁；所述組織樣本病原體破壁采用Proteinase K消化后再加入Lysing Matrix E管處理；

所述步驟1）組織樣本破碎具體步驟為：取組織樣本和PBS加至Lysing Matrix A管；6-8m/s震蕩30-40s，運行1-3次，離心處理；

所述步驟2）組織樣本病原體破壁具體步驟為：向沉淀樣本中加入裂解液和ProteinaseK；震蕩孵育后轉移至Lysing Matrix E管；6-8m/s，30-40s 運行1-3次；離心轉移備用。

2.權利要求1所述的組織樣本處理方法，其特征在于，所述步驟1）中的震蕩為6m/s震蕩40s，設置1次。

3.權利要求1-2任一所述的組織樣本處理方法，其特征在于，所述步驟2）中；所述Proteinase K為Oryzogen的Proteinase K; 所述震蕩孵育后轉移至Lysing Matrix E管；6m/s，40s 運行1次。

4.權利要求1-3任一所述組織樣本處理方法，其特征在于，步驟2）樣本病原體破壁前進一步包括組織樣本的去宿主步驟；所述去宿主采用常規去宿主試劑盒進行宿主去除。

5.一種組織樣本宏基因組核酸提取方法，其特征在于，所述方法包括權利要求1-4任一所述組織樣本處理方法，并進一步包括常規核酸提取步驟。

6.一種組織樣本宏基因組建庫方法，其特征在于，所述方法包括權利要求5所述組織樣本宏基因組核酸提取方法，并進一步包括基于提取核酸進行常規建庫步驟。