[發明專利]結直腸癌代謝基因預后預測模型

有效

• 申請號: 202110581928.3
• 申請日: 2021-05-25
• 公開（公告）號: CN113151483B
• 公開（公告）日: 2022-08-12
• 發明（設計）人: 甘露;袁藝洮;孫珣;劉夢玲;劉天舒
• 申請（專利權）人: 復旦大學附屬中山醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 上海卓陽知識產權代理事務所(普通合伙) 31262
• 代理人: 周春洪

本發明涉及一種結直腸癌代謝基因預后預測模型，涉及生物標志物UGT2A、ACAA2、PKM、GPX3、PAFAH1B3、SOX9，本發明還包括檢測所述標志物表達量的試劑在制備評估結直腸癌預后生存的試劑盒中的應用。本發明基于該診斷標志物以及相應的預測模型(即根據6個代謝相關基因的表達量與其系數的乘積之和，同時合并患者的臨床特征，)來判斷患者的預后性，具有高效、精準預測結直腸癌患者預后的優點，為臨床醫師對結直腸癌患者的治療決策提供有效的指導意見，減少無效治療的發生，從而降低患者的治療成本和不適體驗。

技術領域

本發明涉及生物醫學技術領域，具體地說，是結直腸癌代謝基因預后預測模型。

背景技術

結直腸癌是發生在結腸和直腸的惡性腫瘤，早期無癥狀，或癥狀不明顯，僅感不適、消化不良、大便潛血等。隨著癌腫發展，癥狀逐漸出現，表現為大便習慣改變、腹痛、便血、腹部包塊、腸梗阻等，伴或不伴貧血、發熱和消瘦等全身癥狀。腫瘤因轉移、浸潤可引起受累器官的改變。因其發部位不同而表現出不同的臨床癥狀及體征。檢查方式通常包括：實驗室檢查(如血常規、生化全項等)、內鏡檢查以及活體組織檢查和脫落細胞學檢查，治療方式一般包括：手術治療、綜合治療以及放射治療等。

目前CRC患者的預后預測主要依賴于TNM分期系統，但這仍有一定的局限性，即使TNM分期相同的CRC患者，其預后差異也很大。不少研究證實利用基因表達譜可用來對腫瘤進行精確分子分類、預測腫瘤進展，腫瘤轉移、復發及預后等多個方面。代謝重編程是癌癥中被廣泛觀察到一個重要標志，雖然已有數百個代謝基因的改變與腫瘤的發生和發展有關，但這些代謝基因的重要預后作用仍不清楚。同時，現有研究大部分僅限于單個基因層面，對結直腸癌代謝相關的基因特征缺少整體認識。

考慮到上述缺陷，本發明重在探究腫瘤代謝相關的基因特征與患者預后的相關性，為臨床上對患者預后預測提供依據。關于本發明結直腸癌代謝基因預后預測模型目前還未見報道。

發明內容

本發明的目的是針對現有技術的不足，提供一種結直腸癌代謝基因預后預測模型及其應用。

為實現上述目的，本發明采取的技術方案是：

第一方面，本發明提供了診斷標志物組合在構建結直腸癌預后預測模型中的應用，所述診斷標志物組合為UGT2A、ACAA2、PKM、GPX3、PAFAH1B3和SOX9。

優選地，所述預測模型還包括檢測UGT2A、ACAA2、PKM、GPX3、PAFAH1B3和SOX9表達量的試劑。

優選地，所述模型包括如下內容：Risk score＝(-0.0238858734550774*UGT2Aexpression)+(-0.0202490519677621*ACAA2 expression)+(0.00249902116300055*PKM expression)+(0.016732446126655*GPX3 expression)+(-0.0169630246913455*PAFAH1B3expression)+(-0.00816612242034761*SOX9 expression)，當Risk score-0.76時，判斷為高風險狀態，高風險組的患者預后比低風險組患者的預后差，同時根據給出的列線圖，通過對患者Risk score，TNM分期，與風險評分進行積分量表評分，進一步計算樣本的總評分，并使用轉換函數估計每個患者在三個時間點(1年，3年和5年)的生存概率。