[發明專利]一種雞脛長性狀相關的SNP分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202110472799.4
• 申請日: 2021-04-29
• 公開（公告）號: CN113215270B
• 公開（公告）日: 2023-03-17
• 發明（設計）人: 羅文;林澤桐;張細權;聶慶華
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 朱繼超

本發明公開了一種雞脛長性狀相關的SNP分子標記及其應用。所述SNP分子標記位于galGal6版雞基因組1號染色體的第135355110位核苷酸，對應于雞TMEM182基因中的突變位點g.602GA，所述SNP分子標記的基因型為AA、GA和GG。其中AA基因型個體脛長和脛直徑顯著長于GA和GG基因型個體。本發明的SNP分子標記，即雞TMEM182基因內含子1序列中的突變位點g.602GA與脛長性狀相關，是一個新的分子標記，通過確定該雞SNP位點的基因型對雞脛長性狀進行早期選擇，可以節省生產成本并加快遺傳進展，更好地應用于雞選育中，具有很大的經濟應用價值和科研價值。

技術領域

本發明涉及遺傳工程技術領域，特別涉及一種雞脛長性狀相關的SNP分子標記及其應用。

背景技術

消費市場很大程度上決定了雞的育種方向。在我國，因雞爪富含膠原蛋白、磷脂、銅等營養物質，具有降脂降壓、促進身體各組織系統發育修復等功效，同時風味獨特、料理方式豐富，深受消費者(尤其是南方地區、東部沿海地區群眾)喜愛。但由于國外家禽品種多為白羽快大型，其雞爪大，膠原蛋白多，外觀整潔、光亮，所以大中型批發市場上供應的雞爪多為進口貨，深受國內經銷商及部分消費者的青睞，而國產雞爪相比偏小，而脛長是影響消費者采購雞爪的重要因素之一。

然而傳統的育種方式是采用雜交育種的方式，將父母本雜交，形成不同的遺傳多樣性，再通過對雜交后代的篩選，獲得脛長較優的后代。但是其育種過程緩慢，需要耗費大量時間。育種的結果復雜而不可預期，需要大量的選種、制種工作。

發明內容

本發明目的在于提供一種雞脛長性狀相關的SNP分子標記及其應用，以解決現有技術中所存在的一個或多個技術問題，至少提供一種有益的選擇或創造條件。

本發明第一方面提供了一種SNP分子標記。所述SNP分子標記位于galGal6版雞基因組1號染色體的第135355102位核苷酸，對應于雞TMEM182基因內含子1序列中的突變位點g.594GA，所述SNP分子標記的基因型為AA、GA和GG。

本發明第二方面提供特異性擴增上述SNP分子標記的引物對，優選為上游引物PCR-F和下游引物PCR-R，具體為：

上游引物PCR-F：5′–ACAAGACGACCTTCAA–3′(SEQ ID No.1)，

下游引物PCR-R：5′–ACACCATTCCCACCT–3′(SEQ ID No.2)。

本發明第三方面提供所述SNP分子標記在雞脛長性狀相關育種中的應用。

具體的應用包括利用所述SNP分子標記的基因型對雞脛長性狀進行早期選擇。

在本發明的一些應用實施方式中，所述方法包括如下步驟：

1)提取待測雞的DNA；

2)以待測雞的DNA為模板，利用核苷酸序列分別如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的上游引物、下游引物進行PCR擴增，獲得含雞TMEM182基因片段的PCR產物；

3)檢測雞TMEM182基因片段的突變位點g.594GA的基因型；

4)基于步驟3)檢測所得的基因型對待測雞的脛長性狀進行早期選擇，其中AA基因型個體脛長和脛直徑顯著長于GA和GG基因型個體。

在本發明的一些應用實施例中，步驟2)檢測所得PCR產物的核苷酸序列如SEQ IDNo.3所示。該所述PCR產物的長度為762bp，所述SNP分子標記位于所述PCR產物的第153位堿基。

與現有技術相比，本發明具有以下有益效果：