[發明專利]一種胰腺癌預后判定方法及裝置

有效

• 申請號: 202110364809.2
• 申請日: 2021-04-06
• 公開（公告）號: CN112760384B
• 公開（公告）日: 2021-06-25
• 發明（設計）人: 張守偉;趙義;方璐;何驥
• 申請（專利權）人: 臻和（北京）生物科技有限公司;臻和精準醫學檢驗實驗室無錫有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12M1/34;C12M1/00;G16B40/20
• 代理公司: 江蘇瑞途律師事務所 32346
• 代理人: 王珒;王琳琳

本申請公開了一種胰腺癌預后判定方法及裝置，屬于醫學檢測技術領域。本申請的方法包括檢測胰腺癌患者的腫瘤組織DNA樣本中關于胰腺癌的顯著相關性基因，并確定所述顯著相關性基因的拷貝數變異數值；根據所述的顯著相關性基因的拷貝數變異數值及預后檢測模型，確定胰腺癌患者的風險分數；根據所述的風險分數確定胰腺癌患者預后情況；本申請的裝置包括基因檢測模塊、風險分數確定模塊、預后評估模塊。利用本申請所提出的方法及裝置，基于胰腺癌腫瘤組織DNA樣本測序獲得原始數據，降低了對樣本質量的要求，客觀性較強，具有較高的臨床應用價值。

技術領域

本申請屬于醫學檢測技術領域，具體涉及一種胰腺癌預后判定方法及裝置。

背景技術

胰腺癌在中國是一種較為高發且難治的癌癥，據2015年的中國癌癥數據統計顯示，胰腺癌的發病率在癌癥領域排名第9，而死亡率排名第6。為了提高胰腺癌的精準診療水平以及治愈率，如何對胰腺癌患者的預后狀態進行判斷就顯得尤為重要。

目前，針對胰腺癌的預后判斷存在很多技術方案，但這些技術方案存在不同的缺陷。首先，一類技術方案是基于單一臨床因素對胰腺癌患者的預后進行判斷，包括ECOG表現狀態（Eastern Cooperative Oncology Group Performance Status）、腫瘤標志物CA 19-9水平和年齡等，但是基于單一臨床因素進行的預后判斷效能不夠，易受其他因素影響。第二，一類技術方案是基于多個臨床因素計算預后分數，根據分數的高低對患者預后進行判斷，但該類方案在針對不同臨床因素對應分數的設定上存在較大的主觀因素，影響預后判斷的準確性。第三，一類技術方案是基于胰腺癌高頻突變基因（KRAS/TP53/SMAD4/CDKN2A）的突變狀態對患者進行預后判斷，但是高頻突變基因的突變狀態和中國胰腺癌患者的預后不具有顯著相關性。第四，一類技術方案是基于腫瘤組織的轉錄譜篩選基因并構建預后檢測模型對胰腺癌患者的預后進行判斷，但該類方案在獲取數據時對腫瘤組織的質量要求較高，限制了該方案的臨床應用。因此，通過對現有技術的分析可以看出，目前對胰腺癌的預后判斷技術并不理想。

發明內容

技術問題：針對現有對胰腺癌預后判斷的技術不佳的問題，本申請提供一種胰腺癌預后預測方法及裝置，從而能夠對胰腺癌患者進行準確的預后判斷。

技術方案：本申請一方面提供一種胰腺癌預后判定方法，包括：

檢測胰腺癌患者的腫瘤組織DNA樣本中關于胰腺癌的顯著相關性基因，并確定所述顯著相關性基因的拷貝數變異數值；

根據所述的顯著相關性基因的拷貝數變異數值及預后檢測模型，確定胰腺癌患者的風險分數；

根據所述的風險分數確定胰腺癌患者預后情況。

進一步地，還包括根據所述的顯著相關性基因的拷貝數變異數值構建預后檢測模型。

進一步地，根據所述的顯著相關性基因的拷貝數變異數值構建預后檢測模型的方法包括：

收集若干例胰腺癌患者的腫瘤組織DNA樣本，構建胰腺癌腫瘤數據集，并按比例劃分為訓練集和測試集；

針對每個腫瘤組織DNA樣本選取若干個與胰腺癌有關的基因，用于預后檢測模型構建；

計算每個基因的拷貝數變異數值；

基于每個基因的拷貝數變異數值，采用Cox回歸分析方法進行預后檢測模型構建，并利用彈性網絡方法篩選出所述的相關性基因，并經過留一交叉驗證構建出最終預后檢測模型。

進一步地，基于所述顯著性基因構建的預后檢測模型為：

風險分數=－0.1136*RAD50+0.6140*AKT1+0.5643*CSF1R－0.3089*JAK2－0.2088*ABL1