[發明專利]一種基于鎖核酸修飾的RMA法檢測ApoE和SLCO1B1基因多態性的試劑盒

在審

• 申請號: 202110229073.8
• 申請日: 2021-03-02
• 公開（公告）號: CN112852951A
• 公開（公告）日: 2021-05-28
• 發明（設計）人: 陳大為;陳龍;張瑤
• 申請（專利權）人: 濟南國益生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6844;C12N15/11
• 代理公司: 濟南信在專利代理事務所(特殊普通合伙) 37271
• 代理人: 殷盛江

1.一種基于鎖核酸修飾的RMA法檢測ApoE和SLCO1B1基因多態性的引物探針組，其特征在于，所述引物探針組分為兩組，A組為檢測ApoE 388TC和526CT的引物對、野生型探針和突變型探針；B組為檢測SLCO1B1388AG和521TC的引物對、野生型探針和突變型探針，其中，A組的ApoE 388TC引物和探針序列為：

上游引物：5’-AGACGCGGGCACGGCTGTCCAAGGAGCTGCA-3’；

下游引物：5’-TCGGTGCTCTGGCCGAGCATGGCCTGCACCT-3’；

野生型探針：

5’-AGGCCCGGCTGGGCGCGGACATGGAGGACG(FAM-dT)GTGCGGCCGCC(THF)GG(BHQ-dT)GCA(C3spacer)-3’；

突變型探針：

5’-AGGCCCGGCTGGGCGCGGACATGGAGGACG(ROX-dT)GCGCGGCCGCC(THF)GG(BHQ-dT)GCA(C3spacer)-3’；

A組的ApoE 526CT引物和探針序列為：

上游引物：5’-AGGCCATGCTCGGCCAGAGCACCGAGGAGCT-3’；

下游向引物：5’-TTGGCGCGCACCTCCGCCACCTGCTCCTTCA-3’；

野生型探針：

5’-TCCTCCGCGATGCCGATGACC(HEX-dT)GCAGAAGCGCC(THF)GGCAG(BHQ-dT)GTACCAG(C3spacer)-3’；

突變型探針：

5’-TCCTCCGCGATGCCGATGACC(CY5-dT)GCAGAAGTGCC(THF)GGCAG(BHQ-dT)GTACCAG(C3spacer)-3’。

B組的SLCO1B1388AG引物和探針序列為：

上游引物：5’-TGCTGGGAAATTGACAGAAAGTACTCTGGTAA-3’；

下游引物：5’-AACCTGTGTTGTTAATGGGCGAACTGTGTATA-3’；

野生型探針：

5’-AGTTACAGGTATTCTAAAGAAACTAATA(FAM-dT)CAA(THF)(BHQ-dT)CATCAGAAAATTCA(C3spacer)-3’；

突變型探針：

5’-AGTTACAGGTATTCTAAAGAAACTAATA(ROX-dT)CGA(THF)(BHQ-dT)CATCAGAAAATTCA(C3spacer)-3’；

B組的SLCO1B1521TC引物和探針序列為：

上游引物：5’-CAGCCATGAGGAACTATGAGTCCATTAGACC-3’；

下游引物：5’-ATGGTACTATGGGAGTCTCCCCTATTCCAC-3’；

野生型探針：

5’-AGGAATCTGGGTCATACATGTGGATATA(HEX-dT)GTG(THF)(BHQ-dT)CATGGGTAATATGCT(C3spacer)-3’；

突變型探針：

5’-AGGAATCTGGGTCATACATGTGGATATA(CY5-dT)GCG(THF)(BHQ-dT)CATGGGTAATATGCT(C3spacer)-3’。

2.如權利要求1所述的一種基于鎖核酸修飾的RMA法檢測ApoE和SLCO1B1基因多態性的引物探針組，其特征在于，所述探針上修飾有熒光基團和猝滅基團，所述猝滅基團修飾在THF 3’端的T堿基上，熒光基團修飾在SNP位點的5’端T堿基上或SNP位點互補堿基的5’端T堿基上。