[發明專利]用于檢測拉蒂諾病毒、莫巴拉病毒和莫佩亞病毒的引物探針、靶標組合、試劑盒和方法有效
| 申請號: | 202110096385.6 | 申請日: | 2021-01-25 |
| 公開(公告)號: | CN112662817B | 公開(公告)日: | 2022-07-08 |
| 發明(設計)人: | 李建東;杜珊珊;李阿茜;梁米芳;李德新;王世文;黃曉霞;李川;王芹;孫麗娜;蕪為 | 申請(專利權)人: | 中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京路浩知識產權代理有限公司 11002 | 代理人: | 孫怡 |
| 地址: | 102206 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 檢測 拉蒂諾 病毒 莫巴拉 莫佩亞 引物 探針 靶標 組合 試劑盒 方法 | ||
1.用于檢測拉蒂諾病毒、莫巴拉病毒和莫佩亞病毒的引物探針組合,其特征在于,含有三對特異性引物和三條特異性探針,其中,所述特異性引物的序列如SEQ ID NO.1-6所示,所述特異性探針的序列如SEQ ID NO.7-9所示。
2.根據權利要求1所述的引物探針組合,其特征在于,所述特異性探針分別標記產生不同熒光色的熒光基團,所述熒光基團包括熒光報告基團和熒光猝滅基團;
所述熒光報告基團為選自FAM、HEX、Texas Red、CY5、TET、JOE、CY3、TAMRA、ROX、LCRED640、LC RED705中的任一種;所述熒光猝滅基團為選自BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcyl中的任一種。
3.根據權利要求1或2所述的引物探針組合,其特征在于,序列如SEQ ID NO.7所示的特異性探針的5’端標記FAM熒光報告基團,3’端標記BHQ1熒光淬滅基團;序列如SEQ ID NO.8所示的特異性探針的5’端標記HEX熒光報告基團,3’端標記BHQ1熒光淬滅基團;序列如SEQID NO.9所示的特異性探針的5’端標記Texas Red熒光報告基團,3’端標記BHQ2熒光淬滅基團。
4.用于檢測拉蒂諾病毒、莫巴拉病毒和莫佩亞病毒的病毒基因組保守區靶標組合,其特征在于,含有三條靶標,其中,靶標的序列如SEQ ID NO.10-12所示。
5.權利要求1~3任一項所述的引物探針組合或權利要求4所述的病毒基因組保守區靶標組合在制備用于檢測拉蒂諾病毒、莫巴拉病毒和莫佩亞病毒的試劑盒中的應用。
6.用于拉蒂諾病毒、莫巴拉病毒和莫佩亞病毒單獨或同時檢測的試劑盒,其特征在于,包含權利要求1~3任一項所述的引物探針組合,和/或,權利要求4所述的病毒基因組保守區靶標組合。
7.根據權利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒進行實時熒光定量RT-PCR檢測時的反應程序為:50℃逆轉錄30min;95℃預變性10min,95℃變性15s、60℃退火60s,運行40個循環。
8.根據權利要求6或7所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒在進行實時熒光定量RT-PCR檢測時,每25μL反應體系為:2×緩沖液12.5μL,10μM上游引物0.5μL,10μM下游引物0.5μL,10μM探針0.25μL,酶1μL,模板5μL,用無RNA水解酶的純凈水補足至25μL。
9.一種非疾病診斷目的利用實時熒光定量RT-PCR分別檢測拉蒂諾病毒、莫巴拉病毒和莫佩亞病毒的方法,其特征在于,以待測樣品的RNA為檢測模板,利用如SEQ ID NO.1-6所示的特異性引物和如SEQ ID NO.7-9所示的特異性探針進行實時熒光定量RT-PCR檢測,根據擴增曲線判斷待測樣品中是否含有相應病毒。
10.根據權利要求9所述的方法,其特征在于,所述實時熒光定量RT-PCR的反應程序為:50℃逆轉錄30min;95℃預變性10min,95℃變性15s、60℃退火60s,運行40個循環;
所述實時熒光定量RT-PCR的每25μL反應體系為:2×緩沖液12.5μL,10μM上游引物0.5μL,10μM下游引物0.5μL,10μM探針0.25μL,酶1μL,模板5μL,RNase Free Water補足至25μL。
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