[發(fā)明專利]一種小麥抗條銹病基因yrZ15-1370及其分子標(biāo)記和應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011463614.5
• 申請日: 2020-12-11
• 公開（公告）號: CN112481275B
• 公開（公告）日: 2022-04-08
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 劉登才;張明虎;張連全;柳欣;黃林;郝明;梁東玉;袁中偉;甯順腙;姜博;陳雪姣
• 申請（專利權(quán)）人: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
• 主分類號: C12N15/29
• 分類號: C12N15/29;C12N15/11;C12Q1/6895;C12Q1/6858
• 代理公司: 北京眾合誠成知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11246
• 代理人: 趙浩竹

本發(fā)明公開了一種小麥抗條銹病基因yrZ15?1370及其分子標(biāo)記和應(yīng)用。小麥抗條銹病基因為yrZ15?1370位于小麥6A染色體長臂上，在RefSeqv1.0基因組版本的物理位置為601.47Mb?603.30Mb。所述分子標(biāo)記其SNP位點位于yrZ15?1370區(qū)間內(nèi)，多態(tài)性為A/G，該分子標(biāo)記能準(zhǔn)確跟蹤小麥抗條銹病基因yrZ15?1370。本發(fā)明還公開了一種鑒定小麥抗條銹病基因yrZ15?1370的引物組，利用本發(fā)明所提供的引物組能夠快速篩選出具有小麥抗條銹病基因yrZ15?1370的小麥品種或品系用于育種，可大大加快小麥抗病品種的選育進程。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種小麥抗條銹病基因yrZ15-1370及其分子標(biāo)記和應(yīng)用。

背景技術(shù)

小麥條銹病是由小麥條銹菌引起的世界性重要病害。我國歷史上出現(xiàn)過多次條銹病大流行，嚴(yán)重的年份可導(dǎo)致小麥減產(chǎn)40％以上，甚至絕收。由于條銹菌生理小種的變異頻繁，新的毒性生理小種的出現(xiàn)，常導(dǎo)致小麥品種抗性快速“喪失”，引發(fā)條銹病大流行，威脅小麥安全生產(chǎn)。小麥條銹病的持續(xù)有效防控是一個長期的國際難題。因此，發(fā)掘和利用新的抗條銹病基因，增加抗條銹病基因的多樣性，培育推廣抗條銹病小麥品種是有效控制該病害最經(jīng)濟安全和環(huán)保的措施。

單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)指的是基因組內(nèi)DNA某一特定核苷酸位置上存在轉(zhuǎn)換、顛換、插入、缺失等變化而引起的DNA序列多態(tài)性。其技術(shù)是利用己知序列信息來比對尋找SNP位點，再利用發(fā)掘的變異位點設(shè)計特異性的引物來對基因組DNA或cDNA進行PCR擴增，得到基于SNP位點的特定的多態(tài)性產(chǎn)物，最后利用電泳技術(shù)分析產(chǎn)物的多態(tài)性。SNP標(biāo)記的優(yōu)點是數(shù)量多，分布廣泛；在單個基因和整個基因組中分布不均勻；SNP等位基因頻率容易估計。

KASP是由LGC公司(Laboratory of the Government Chemist)(http://www.lgcgenomics.com)研發(fā)的競爭性等位基因特異性PCR技術(shù)(Kompetitive AlleleSpecific PCR,KASP)具有低成本、高通量特點的新型基因分型技術(shù)，通過引物末端堿基的特異匹配來對SNP以及InDel位點進行精準(zhǔn)的雙等位基因分型，在水稻、小麥、大豆等作物的分子標(biāo)記輔助選擇中得到廣泛應(yīng)用。

野生一粒小麥(Triticum boeoticum,2n＝2x＝14,A^bA^b)是栽培一粒小麥(Triticum monococcum L.ssp.monococcum,2n＝2x＝14,A^mA^m)的祖先種，是普通小麥應(yīng)對各種生物和非生物脅迫的重要基因源。雖然很久以前人們就已經(jīng)認(rèn)識到野生物種改良小麥很大的潛力，但是野生物種的遺傳多樣性至今仍未被有效開發(fā)和利用。目前為止，從野生一粒小麥導(dǎo)入普通小麥的抗性基因非常有限，包括抗白粉病基因PmTb7A.1和PmTb7A.2,Pm25，抗稈銹病基因Sr22。目前，僅在野生一粒小麥pau5088的5A^b上定位了一個成株抗條銹病QTL(QYrtm.pau-5A)，且已利用硬粒小麥為橋梁將該抗性QTL成功轉(zhuǎn)入了普通小麥中。已有研究表明，大多數(shù)的野生一粒小麥高抗條銹病。因此，將更多的野生一粒小麥的條銹病抗性基因轉(zhuǎn)入普通小麥?zhǔn)欠浅Ｖ匾摹?/p>

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種小麥抗條銹病基因yrZ15-1370，以及與該基因緊密連鎖的分子標(biāo)記及其應(yīng)用，該分子標(biāo)記能準(zhǔn)確跟蹤小麥抗條銹病基因yrZ15-1370，預(yù)測小麥品種是否含抗條銹病基因yrZ15-1370的特性，進而方便進行分子設(shè)計育種。

為了達到上述技術(shù)目的，本發(fā)明具體通過以下技術(shù)方案實現(xiàn)：