[發明專利]數字病理圖像分析方法、系統、設備及存儲介質在審
| 申請號: | 202011279541.4 | 申請日: | 2020-11-16 |
| 公開(公告)號: | CN112419253A | 公開(公告)日: | 2021-02-26 |
| 發明(設計)人: | 李偉忠;楊歡;柯尊富;陳麗麗 | 申請(專利權)人: | 中山大學 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/11 |
| 代理公司: | 廣州三環專利商標代理有限公司 44202 | 代理人: | 胡楓;曹萬菊 |
| 地址: | 510275 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 數字 病理 圖像 分析 方法 系統 設備 存儲 介質 | ||
1.一種數字病理圖像分析方法,其特征在于,包括:
獲取數字病理圖像;
從所述數字病理圖像中提取感興趣區域;
根據所述感興趣區域構建自適應的滑動窗口,并通過所述滑動窗口從所述感興趣區域中截取興趣塊;
對所述興趣塊進行過濾處理;
將所述興趣塊輸入病理模型以進行分析處理。
2.如權利要求1所述的數字病理圖像分析方法,其特征在于,所述根據感興趣區域構建自適應的滑動窗口并通過滑動窗口從感興趣區域中截取興趣塊的步驟包括:
判斷所述感興趣區域的最小外接矩形的邊長是否小于滑動窗口的邊長,判斷為是時,則刪除所述感興趣區域,判斷為否時,則保留所述感興趣區域;
根據所述感興趣區域、各類別感興趣區域及總體感興趣區域之間的關系,確定所述感興趣區域對應的滑動窗口的滑動步長;
根據所述滑動窗口的邊長及滑動步長,采用所述滑動窗口法遍歷所述感興趣區域以提取興趣塊。
3.如權利要求2所述的數字病理圖像分析方法,其特征在于,所述根據感興趣區域、各類別感興趣區域及總體感興趣區域之間的關系,確定感興趣區域對應的滑動窗口的滑動步長的步驟包括:
計算總體感興趣區域的數量N,其中,N=N1+N2+…Ni+…+Nk,i∈(1,2,…,k),Ni為每個類別的感興趣區域數量,k為類別數量;
計算各感興趣區域的面積sj,其中,sj=wj·hj,wj為第j個感興趣區域的最小外接矩的寬,hj為第j個感興趣區域的最小外接矩的高;
計算各類別感興趣區域的面積均值其中,
計算各類別感興趣區域的面積均值與總體感興趣區域平均面積的組間系數ωi,其中,
計算各感興趣區域的面積sj與各類別感興趣區域的面積均值的組內系數ωj,其中,
根據所述組間系數ωi、組內系數ωj及初始化滑動步長l0,計算第j個感興趣區域對應的滑動窗口的滑動步長lj,其中,lj=ωi·ωj·l0。
4.如權利要求1所述的數字病理圖像分析方法,其特征在于,所述對興趣塊進行過濾處理的步驟包括:
采用閾值算法分別計算每個興趣塊的病理組織覆蓋比;
判斷所述興趣塊的病理組織覆蓋比是否低于預設閾值,
判斷為是時,則刪除所述興趣塊,
判斷為否時,則保留所述興趣塊。
5.如權利要求1所述的數字病理圖像分析方法,其特征在于,所述從數字病理圖像中提取感興趣區域的步驟包括:
針對無注釋的數字病理圖像,將組織覆蓋的區域提取為感興趣區域;
針對帶注釋的數字病理圖像,根據注釋文件提取感興趣區域。
6.一種數字病理圖像分析系統,其特征在于,包括:
獲取模塊,用于獲取數字病理圖像;
提取模塊,用于從所述數字病理圖像中提取感興趣區域;
截取模塊,用于根據所述感興趣區域構建自適應的滑動窗口,并通過所述滑動窗口從所述感興趣區域中截取興趣塊;
過濾模塊,用于對所述興趣塊進行過濾處理;
分析模塊,用于將所述興趣塊輸入病理模型以進行分析處理。
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