[發(fā)明專利]一種基于深度學(xué)習(xí)的肺大泡病灶檢測方法及系統(tǒng)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010985176.2 | 申請日: | 2020-09-18 |
| 公開(公告)號: | CN112132801B | 公開(公告)日: | 2023-05-05 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 李惠萍;鄔學(xué)寧 | 申請(專利權(quán))人: | 上海市肺科醫(yī)院 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/11 |
| 代理公司: | 上海元好知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31323 | 代理人: | 張靜潔;徐雯瓊 |
| 地址: | 200433 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 深度 學(xué)習(xí) 肺大泡 病灶 檢測 方法 系統(tǒng) | ||
1.一種基于深度學(xué)習(xí)的肺大泡病灶檢測方法,其特征在于,包含步驟:
S1、讀取若干肺大泡患者的胸部CT序列圖像并進(jìn)行預(yù)處理,獲得若干預(yù)處理后的第一CT圖像;
S2、抽取若干第一CT圖像并標(biāo)注肺部區(qū)域和肺大泡病灶區(qū)域,基于標(biāo)注的第一CT圖像生成訓(xùn)練集和驗(yàn)證集;
S3、通過所述訓(xùn)練集和驗(yàn)證集預(yù)訓(xùn)練第一、第二深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型;所述第一深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型用于從輸入的CT圖像中識(shí)別肺部區(qū)域;所述第二深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型用于從已識(shí)別有肺部區(qū)域的CT圖像中識(shí)別肺大泡病灶區(qū)域;所述第一、第二深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型采用相同的AttentionSEResUNet神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型;
所述AttentionSEResUnet神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型包括依序連接的輸入卷積層、第一至第四下采樣層、殘差模塊、第一至第四上采樣層、輸出卷積層;第i層下采樣層與第5-i層上采樣層之間按通道拼接,1≤i≤4;第一至第四下采樣層為注意力機(jī)制池化層;所述輸入卷積層具有3×3的卷積核;所述輸出卷積層具有1×1的卷積核;
所述注意力機(jī)制池化層包含擠壓激發(fā)模塊/殘差模塊,以及連接所述擠壓激發(fā)模塊/殘差模塊的最大池化層;
第一至第四上采樣層為殘差模塊加反卷積層或者擠壓激發(fā)模塊加反卷積層;
S4、將待檢測患者的CT圖像序列輸入訓(xùn)練好的第一、第二深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,識(shí)別該患者CT圖像序列中的每個(gè)CT圖像所包含的肺部區(qū)域和肺大泡病灶區(qū)域;計(jì)算得到該患者肺大泡病灶在其肺中的占比;
步驟S4包含:
S41、將待檢測患者的CT圖像序列輸入訓(xùn)練好的第一深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,識(shí)別得到該CT圖像序列中包含肺部區(qū)域的若干第五CT圖像;
S42、將所有第五CT圖像中肺部區(qū)域的面積進(jìn)行累加,得到面積值S;
S43、將所述第五CT圖像輸入訓(xùn)練好的第二深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型,識(shí)別該第五CT圖像序列中包含的肺大泡區(qū)域;將所有第五CT圖像中肺大泡區(qū)域的面積進(jìn)行累加,得到面積值s;
S44、計(jì)算得到該待檢測患者肺大泡病灶在其肺中的占比
2.如權(quán)利要求1所述的基于深度學(xué)習(xí)的肺大泡病灶檢測方法,其特征在于,步驟S1所述進(jìn)行預(yù)處理包含:
S11、依據(jù)預(yù)設(shè)肺窗窗寬和肺窗窗位,對肺大泡患者的胸部CT序列圖像進(jìn)行肺窗處理;
S12、對肺窗處理后的所述CT序列圖像的每個(gè)CT圖像進(jìn)行重采樣,將該CT圖像裁剪為設(shè)定的分辨率大小,獲得對應(yīng)的第一CT圖像。
3.如權(quán)利要求2所述的基于深度學(xué)習(xí)的肺大泡病灶檢測方法,其特征在于,步驟S11中所述肺窗處理包含:
S111、對所述CT序列圖像中每個(gè)CT圖像的每個(gè)像素的CT值進(jìn)行調(diào)整,使每個(gè)像素的CT值位于所述窗寬和所述窗位界定的CT值范圍內(nèi);
S112、將像素的CT值歸一化至[0,255]之間。
4.如權(quán)利要求1所述的基于深度學(xué)習(xí)的肺大泡病灶檢測方法,其特征在于,步驟S2包含:
S21、為每個(gè)肺大泡患者抽取相同數(shù)量的所述第一CT圖像,且抽取的第一CT圖像包含肺部圖像和肺大泡病灶;
S22、采用不同顏色填充的語義分割方式標(biāo)注第一CT圖像中的肺部區(qū)域和肺大泡病灶區(qū)域;
S23、通過水平翻轉(zhuǎn)第一CT圖像生成對應(yīng)的第二CT圖像;通過縮放第一、第二CT圖像得到對應(yīng)的第三、第四CT圖像;從第一至第四CT圖像中選取部分CT圖像建立訓(xùn)練集,其余CT圖像歸于驗(yàn)證集。
5.如權(quán)利要求1所述的基于深度學(xué)習(xí)的肺大泡病灶檢測方法,其特征在于,所述AttentionSEResUNet神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的損失函數(shù)為dice函數(shù),梯度下降器為Adam函數(shù);輸出卷積層的激活函數(shù)采用sigmoid函數(shù);當(dāng)損失函數(shù)的計(jì)算值小于設(shè)定的第一閾值或迭代次數(shù)達(dá)到預(yù)設(shè)的第二閾值,AttentionSEResUnet神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型停止迭代更新。
該專利技術(shù)資料僅供研究查看技術(shù)是否侵權(quán)等信息,商用須獲得專利權(quán)人授權(quán)。該專利全部權(quán)利屬于上海市肺科醫(yī)院,未經(jīng)上海市肺科醫(yī)院許可,擅自商用是侵權(quán)行為。如果您想購買此專利、獲得商業(yè)授權(quán)和技術(shù)合作,請聯(lián)系【客服】
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