[發明專利]一種基于擴繁群體的蝦類選擇育種方法

有效

• 申請號: 202010969822.6
• 申請日: 2020-09-15
• 公開（公告）號: CN112021224B
• 公開（公告）日: 2022-02-18
• 發明（設計）人: 欒生;孔杰;楊國梁;隋娟;羅坤;孟憲紅;代平;陳寶龍;曹家旺
• 申請（專利權）人: 中國水產科學研究院黃海水產研究所;江蘇數豐水產種業有限公司
• 主分類號: A01K61/59
• 分類號: A01K61/59
• 代理公司: 青島聯智專利商標事務所有限公司 37101
• 代理人: 李升娟

1.一種基于擴繁群體的蝦類選擇育種方法，其特征在于，所述方法包括下述步驟：

（1）構建當前世代的核心群體：根據家系選擇指數、家系內個體選擇指數和個體間的親緣關系，從上一世代核心群體全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系及個體，設計交配方案，控制近交率不超過1%，構建當前世代的核心群體；

（2）確定當前世代的核心群體的選擇指數：獲得所述當前世代的核心群體的個體育種目標性狀的測定值，結合個體的系譜信息，計算個體的育種值，通過多性狀選擇指數制定方法計算當前世代的個體選擇指數和家系選擇指數；

（3）構建當前世代的擴繁群體：根據上一世代核心群體的家系選擇指數、個體選擇指數和個體間的親緣關系，從上一世代核心群體全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系及個體，設計交配方案，控制近交率不超過5%，構建當前世代的擴繁群體；

（4）選擇候選親本：在所述當前世代的核心群體中，依據當前世代的核心群體的家系選擇指數，從全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系作為入選家系，從所述入選家系中依據個體選擇指數選擇排名在前的指定數量的個體作為當前世代的核心群體的候選親本；在所述當前世代的擴繁群體中，依據當前世代的擴繁群體個體選擇指數，從全部個體中選擇排名在前的指定數量的個體作為當前世代的擴繁群體的候選親本；

（5）構建候選親本間的基因組親緣關系矩陣：獲取當前世代的核心群體的候選親本及當前世代的擴繁群體的候選親本的DNA，利用高通量SNP分型技術鑒定出SNP基因型信息，結合系譜信息構建當前世代的核心群體的候選親本及當前世代的擴繁群體的候選親本間的基因組親緣關系矩陣；

（6）構建下一世代的核心群體：根據當前世代的核心群體的候選親本及當前世代的擴繁群體的候選親本的個體選擇指數和當前世代的核心群體的候選親本及當前世代的擴繁群體的候選親本間的所述基因組親緣關系矩陣，設計交配方案，控制近交率不超過1%，構建下一世代的核心群體；

（7）確定下一世代的核心群體的選擇指數：獲得所述下一世代的核心群體的個體育種目標性狀的測定值，結合個體的系譜信息和其親本的SNP基因型信息，計算個體的育種值，通過多性狀選擇指數制定方法計算下一世代的個體選擇指數和家系選擇指數；

重復上述步驟（3）-（7），完成多個世代的選擇育種；

其中，排名均為按照選擇指數由大到小進行排序。

2.根據權利要求1所述的基于擴繁群體的蝦類選擇育種方法，其特征在于，在所述步驟（1）中，從上一世代核心群體全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系及個體，設計交配方案，具體包括：

從上一世代核心群體全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系及個體，入選家系數量占全部家系數量的比例不超過80%，利用優化貢獻選擇方法設計交配方案。

3.根據權利要求1所述的基于擴繁群體的蝦類選擇育種方法，其特征在于，在所述步驟（3）中，從上一世代核心群體全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系及個體，設計交配方案，具體包括：

從上一世代核心群體全部家系中選擇排名在前的指定數量的家系及個體，入選家系數量占全部家系數量的比例不超過20%，利用優化貢獻選擇方法設計交配方案。

4.根據權利要求1所述的基于擴繁群體的蝦類選擇育種方法，其特征在于，在所述步驟（6）中，根據當前世代的核心群體的候選親本及當前世代的擴繁群體的候選親本的個體選擇指數和當前世代的核心群體的候選親本及當前世代的擴繁群體的候選親本間的所述基因組親緣關系矩陣，設計交配方案，具體包括：

利用優化貢獻選擇方法設計交配方案，入選親本中來自擴繁群體的候選親本的數量占全部入選親本的數量的比例不超過30%。