[發(fā)明專利]抗體/抗體片段的選擇

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010695677.7
• 申請(qǐng)日: 2020-07-17
• 公開（公告）號(hào): CN112242181A
• 公開（公告）日: 2021-01-19
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: C·本德;J·韋爾克
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 拜耳股份公司
• 主分類號(hào): G16B20/30
• 分類號(hào): G16B20/30;G16B40/00
• 代理公司: 中國(guó)專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 任曉華;邵長(zhǎng)準(zhǔn)

1.一種方法，包括以下步驟：

-接收涉及V_L基因和V_H基因的特征，其中V_L基因和V_H基因?qū)贵w和/或抗體片段的輕鏈和重鏈的可變區(qū)進(jìn)行編碼，其中這些抗體和/或抗體片段源自選擇方法，其中該選擇方法包括多個(gè)彼此相繼的選擇循環(huán)，其中每一個(gè)選擇循環(huán)的結(jié)果為具有抗體和/或抗體片段的池，

-對(duì)于這些池中的V_L基因和V_H基因?qū)?lái)構(gòu)造特征向量，其中每一對(duì)的V_L基因和V_H基因?qū)儆谕粋€(gè)抗體和/或抗體片段的可變區(qū)進(jìn)行編碼，其中一個(gè)池的每個(gè)特征向量至少包括以下特征：

·V_L基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_H基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_L基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_H基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_H基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度與V_L基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度之間的絕對(duì)差值，

·V_H基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度與V_L基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度之間的絕對(duì)差值，

-鑒別這些池的這些特征向量中的富集模式，其中富集模式表示在該選擇方法中用相應(yīng)的V_L基因和V_H基因富集該抗體和/或抗體片段的強(qiáng)度，

-基于該富集模式來(lái)獲得V_L基因和V_H基因?qū)Φ姆謹(jǐn)?shù)值，其中將這些分?jǐn)?shù)值與相應(yīng)的富集強(qiáng)度相關(guān)聯(lián)，

-對(duì)用戶輸出這些分?jǐn)?shù)值。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中鑒別富集模式包括以下子步驟：

-執(zhí)行在至少三個(gè)彼此接連的池中的V_L基因和V_H基因?qū)Φ乃刑卣飨蛄康慕稻S，并且同時(shí)獲得在相應(yīng)池中的V_L基因和V_H基因?qū)Φ囊蜃樱?/p>

-通過(guò)將這些因子沿彼此接連的池的坐標(biāo)值變化量化，獲得V_L基因和V_H基因?qū)Φ姆謹(jǐn)?shù)值。

3.根據(jù)權(quán)利要求1或2之一所述的方法，包括以下步驟：

-接收涉及V_L基因和V_H基因的特征，其中V_L基因和V_H基因?qū)贵w和/或抗體片段的輕鏈和重鏈的可變區(qū)進(jìn)行編碼，其中這些抗體和/或抗體片段源自選擇方法，其中該選擇方法包括多個(gè)彼此相繼的選擇循環(huán)，其中每一個(gè)選擇循環(huán)的結(jié)果為具有抗體和/或抗體片段的池，

-基于這些特征，對(duì)于這些池中的V_L基因和V_H基因?qū)?lái)構(gòu)造特征向量，其中每一對(duì)的V_L基因和V_H基因?qū)儆谕粋€(gè)抗體和/或抗體片段的可變區(qū)進(jìn)行編碼，其中一個(gè)池的每個(gè)特征向量至少包括以下特征：

·V_L基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_H基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_L基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_H基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度，

·V_H基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度與V_L基因在相應(yīng)池中的出現(xiàn)頻度之間的絕對(duì)差值，

·V_H基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度與V_L基因在前一個(gè)池中的出現(xiàn)頻度之間的絕對(duì)差值，

-基于這些特征向量來(lái)獲得在一個(gè)池中的這些V_L基因和V_H基因?qū)Φ囊蜃樱渲羞@些因子用比特征向量更少數(shù)量的變量來(lái)描述在一個(gè)池中的這些對(duì)的特性，

-基于這些因子來(lái)獲得V_L基因和V_H基因?qū)Φ姆謹(jǐn)?shù)值，

-任選地：基于這些分?jǐn)?shù)值來(lái)獲得V_L基因和V_H基因?qū)Φ呐判蛄斜恚?/p>

-對(duì)用戶輸出這些分?jǐn)?shù)值和/或排序列表。