[發(fā)明專利]用于解剖樹結(jié)構(gòu)的疾病量化建模的方法及系統(tǒng)在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010559567.8 | 申請日: | 2020-06-18 |
| 公開(公告)號: | CN111754476A | 公開(公告)日: | 2020-10-09 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 王昕;尹游兵;白軍杰;宋麒;曹坤琳;陸易;高峰 | 申請(專利權(quán))人: | 北京昆侖醫(yī)云科技有限公司 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/66;G06N3/04;G06N3/08;G16H30/40;G16H50/70 |
| 代理公司: | 北京金信知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11225 | 代理人: | 董領(lǐng)遜;夏東棟 |
| 地址: | 100005 北京市東*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 解剖 結(jié)構(gòu) 疾病 量化 建模 方法 系統(tǒng) | ||
1.一種計算機(jī)實(shí)現(xiàn)的用于解剖樹結(jié)構(gòu)的疾病量化建模的方法,包括:
從訓(xùn)練圖像獲得解剖樹結(jié)構(gòu)的中心線;
由處理器基于圖生成圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其中,每個節(jié)點(diǎn)對應(yīng)于中心線點(diǎn),并且邊由中心線定義,每個節(jié)點(diǎn)的輸入為相應(yīng)的中心線點(diǎn)的疾病相關(guān)特征或2D/3D圖像塊,每個節(jié)點(diǎn)的輸出為疾病量化參數(shù);
獲得一組節(jié)點(diǎn)的標(biāo)簽數(shù)據(jù),該組節(jié)點(diǎn)的節(jié)點(diǎn)數(shù)小于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)的總數(shù);以及
由處理器基于該組節(jié)點(diǎn)的標(biāo)簽數(shù)據(jù)通過在該組節(jié)點(diǎn)和其他節(jié)點(diǎn)之間傳遞信息來訓(xùn)練所述圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,該組節(jié)點(diǎn)至少包括在所述解剖樹結(jié)構(gòu)的入口處的第一節(jié)點(diǎn);或者,該組節(jié)點(diǎn)包括在解剖樹結(jié)構(gòu)的入口處的第一節(jié)點(diǎn)以及1-3個附加節(jié)點(diǎn)。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述方法還包括:
接收包含檢測解剖樹結(jié)構(gòu)的檢測圖像;
由所述處理器提取所述檢測解剖樹結(jié)構(gòu)的檢測中心線;
由處理器根據(jù)檢測圖生成訓(xùn)練好的檢測圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其中,每個檢測節(jié)點(diǎn)對應(yīng)于檢測中心線點(diǎn),邊由檢測中心線定義,每個檢測節(jié)點(diǎn)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)單元都遵循訓(xùn)練好的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的每個節(jié)點(diǎn)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)單元的圖模板設(shè)置;
針對每個檢測中心線點(diǎn)提取疾病相關(guān)特征或2D/3D圖像塊;以及
通過使用訓(xùn)練好的檢測圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),基于提取的疾病相關(guān)特征或2D/3D圖像塊,預(yù)測沿著檢測中心線的疾病量化參數(shù)。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述疾病相關(guān)特征包括以下至少之一:結(jié)構(gòu)特征,強(qiáng)度特征和派生特征。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)包括圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其被配置為為每個節(jié)點(diǎn)考慮到其空間上接近的相鄰節(jié)點(diǎn)的情況下執(zhí)行圖卷積運(yùn)算。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法,其特征在于,所述圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸出是其輸入和鄰接矩陣的函數(shù),所述鄰接矩陣是固定的并且由中心線確定。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,每個邊是無向的或有向的,用于在由所述邊鏈接的節(jié)點(diǎn)之間傳播信息。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法,其特征在于,所述信息在所述節(jié)點(diǎn)之間的傳播包含門機(jī)制,每個圖單元包含輸入門和輸出門、記憶單元和隱藏狀態(tài),所述圖單元包括門控循環(huán)單元(GRU)、長短期記憶(LSTM)單元、卷積LSTM(CLSTM)單元和卷積GRU(CGRU)單元中的任何一個。
9.根據(jù)權(quán)利要求8所述的方法,其特征在于,每個圖單元針對每個子節(jié)點(diǎn)包含一個遺忘門。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,使用基于梯度的方法如下執(zhí)行圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練:通過最小化該組節(jié)點(diǎn)的目標(biāo)函數(shù)來優(yōu)化圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的參數(shù);并將該組節(jié)點(diǎn)的梯度和/或誤差傳遞給其他節(jié)點(diǎn)。
11.一種用于解剖樹結(jié)構(gòu)的疾病量化建模的系統(tǒng),包括:
接口,被配置為接收包含解剖樹結(jié)構(gòu)的訓(xùn)練圖像;
處理器,被配置為,針對每個訓(xùn)練圖像:
從訓(xùn)練圖像獲得解剖樹結(jié)構(gòu)的中心線;
基于圖生成圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其中,每個節(jié)點(diǎn)對應(yīng)于中心線點(diǎn),并且邊由中心線定義,每個節(jié)點(diǎn)的輸入為相應(yīng)的中心線點(diǎn)的疾病相關(guān)特征或2D/3D圖像塊,每個節(jié)點(diǎn)的輸出為疾病量化參數(shù);
獲得一組節(jié)點(diǎn)的標(biāo)簽數(shù)據(jù),該組節(jié)點(diǎn)的節(jié)點(diǎn)數(shù)小于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)的總數(shù);以及
基于該組節(jié)點(diǎn)的標(biāo)簽數(shù)據(jù)通過在該組節(jié)點(diǎn)和其他節(jié)點(diǎn)之間傳遞信息來訓(xùn)練所述圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。
12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的系統(tǒng),其特征在于,該組節(jié)點(diǎn)至少包括在所述解剖樹結(jié)構(gòu)的入口處的第一節(jié)點(diǎn);或者,該組節(jié)點(diǎn)包括在解剖樹結(jié)構(gòu)的入口處的第一節(jié)點(diǎn)以及1-3個附加節(jié)點(diǎn)。
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