[發明專利]冠心病患者死亡風險相關的DNA甲基化組合物及其篩選方法和用途

有效

• 申請號: 202010510421.4
• 申請日: 2020-06-05
• 公開（公告）號: CN111850108B
• 公開（公告）日: 2023-09-05
• 發明（設計）人: 鐘詩龍;陳慧;秦敏
• 申請（專利權）人: 廣東省人民醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11;G06F17/18;G16B5/00;G16B20/30;G16B20/40
• 代理公司: 廣州三環專利商標代理有限公司 44202
• 代理人: 顏希文

1.甲基化標志物在制備冠心病生存預后風險的模型中的應用，其特征在于：

所述甲基化標志物由以下基因所對應的甲基化位點組成：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5；

所述chr3:101901234所對應的甲基化位點為cg12992827；所述基因SEMA3B所對應的甲基化位點為cg12999941；所述基因CORO2B所對應的甲基化位點為cg03714754；所述基因SLC39A8所對應的甲基化位點為cg24524837；所述chr7:27235733所對應的甲基化位點為cg10643049；所述chr10:3086002所對應的甲基化位點為cg04833391；所述chr2:164594200所對應的甲基化位點為cg08280341；所述基因RNASEH1所對應的甲基化位點為cg12263535；所述chr10:134897731所對應的甲基化位點為cg06355908；所述基因ABCA3所對應的甲基化位點為cg21484914；所述基因ZNF444所對應的甲基化位點為cg09782621；所述基因UBE2E2所對應的甲基化位點為cg20015729；所述基因DAZAP1所對應的甲基化位點為cg00013733；所述基因NAT10所對應的甲基化位點為cg19045191；所述基因DDAH1所對應的甲基化位點為cg22211198；所述基因FKBP5所對應的甲基化位點為cg03546163；

所述模型為以下計算公式：

MRS=（公式3）

其中MRS為甲基化風險評分，根據所述模型獲得甲基化風險評分的中位數，根據所述中位數評估冠心病患者生存預后風險；公式3中所述甲基化水平為以下基因所在位點的甲基化水平：chr3:101901234、SEMA3B、CORO2B、SLC39A8、chr7:27235733、chr10:3086002、chr2:164594200、RNASEH1、chr10:134897731、ABCA3、ZNF444、UBE2E2、DAZAP1、NAT10、DDAH1和FKBP5；

所述模型的數學表達式具體如下：MRS=cg00013733×(-0.217)+cg03714754×(-0.513)+cg04833391×(-0.520)+cg06355908×1.155+cg08280341×(-0.031)+cg09782621×(-0.382)+cg10643049×(-0.075)+cg12263535×0.328+cg12992827×(-0.168)+cg12999941×(-0.259)+cg20015729×0.313+cg21484914×0.326+cg24524837×0.538+cg19045191×0.224+cg22211198×0.277+cg03546163×(-0.269)；根據所述模型獲得的中位數為5.598，當MRS5.598時冠心病患者為高風險，生存顯著差；當MRS≤5.598時冠心病患者為低風險，生存較好。