[發(fā)明專利]一種基于高通量測(cè)序分析人類血型基因型的方法及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010323008.7
• 申請(qǐng)日: 2020-04-22
• 公開（公告）號(hào): CN111534602A
• 公開（公告）日: 2020-08-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 梁延連;洪文旭;齊彥偉;徐筠娉;史家海;唐雄馳;蘇宇清;吳凡;梁爽
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 深圳市血液中心（深圳市輸血醫(yī)學(xué)研究所）
• 主分類號(hào): C12Q1/6888
• 分類號(hào): C12Q1/6888;C12Q1/6869;G16B30/00;G16B20/20
• 代理公司: 深圳市康弘知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44247
• 代理人: 孫潔敏

1.一種基于高通量測(cè)序分析人類血型基因型的方法，特征在于，包括以下步驟：

S1，獲取或采集人血液樣本的基因組DNA；

S2，對(duì)所述基因組DNA進(jìn)行高通量測(cè)序；

S3，對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理后利用序列比對(duì)軟件進(jìn)行比對(duì)，并利用變異檢測(cè)軟件進(jìn)行變異檢測(cè)；

S4，克隆得到突變基因，并導(dǎo)入到K562細(xì)胞中進(jìn)行過表達(dá)再用Western-Blot驗(yàn)證抗原型別；

S5，通過關(guān)聯(lián)分析得到血型基因型分析數(shù)據(jù)。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述變異選自SNP、CNV、Indel和SV中的至少一種。

3.根據(jù)權(quán)利要求2任一所述的方法，其特征在于，步驟S3中所述比對(duì)是針對(duì)GYPA、GYPB、GYPE基因進(jìn)行的。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于，步驟S4中進(jìn)一步包括利用Blood Typer軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行GPA、GPB、GPE融合分子表型相關(guān)抗原進(jìn)行預(yù)測(cè)的步驟。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法，其特征在于，步驟S3中還包括對(duì)融合基因GYP(A-B-A)、GYP(B-A-B)、GYP(A-B)、GYP(A-B)的全長(zhǎng)序列進(jìn)行比對(duì)和變異檢測(cè)。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的方法，其特征在于，所述全長(zhǎng)序列包括外顯子、內(nèi)含子以及UTR區(qū)域序列。

7.根據(jù)權(quán)利要求1-6任一所述的方法，其特征在于，在步驟S3前進(jìn)一步包括對(duì)測(cè)序序列進(jìn)行質(zhì)量控制的步驟。

8.權(quán)利要求1所述方法使用的試劑在制備用于分析人類血型基因型的試劑盒中的應(yīng)用。

9.一種基于高通量測(cè)序分析人類血型基因型的系統(tǒng)，其特征在于，所述系統(tǒng)包括：

數(shù)據(jù)存儲(chǔ)元件，用于存儲(chǔ)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)；

數(shù)據(jù)處理元件，與數(shù)據(jù)存儲(chǔ)元件連接，用于對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行包括序列比對(duì)、變異檢測(cè)、基因注釋的處理；

血型基因型數(shù)據(jù)庫(kù)元件，與數(shù)據(jù)處理元件連接，用于存在血型基因型數(shù)據(jù)，

其中，當(dāng)數(shù)據(jù)處理元件發(fā)現(xiàn)新的血型基因型時(shí)，將該血型基因型上傳至血型基因型數(shù)據(jù)庫(kù)元件，完成血型基因型數(shù)據(jù)庫(kù)的更新。

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述血型基因型數(shù)據(jù)庫(kù)是指MNS血型基因型數(shù)據(jù)庫(kù)。