[發明專利]一種同一樣品的轉錄組和基因組同時建立測序文庫的構建方法在審
| 申請號： | 202010181548.6 | 申請日： | 2020-03-16 |
| 公開（公告）號： | CN111454942A | 公開（公告）日： | 2020-07-28 |
| 發明（設計）人： | 張曉魯 | 申請（專利權）人： | 張曉魯 |
| 主分類號： | C12N15/11 | 分類號： | C12N15/11;C40B50/06 |
| 代理公司： | 北京輕創知識產權代理有限公司 11212 | 代理人： | 王丹 |
| 地址： | 250012 山東省濟*** | 國省代碼： | 山東;37 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 同一 樣品 轉錄 基因組 同時 建立 序文 構建 方法 | ||
1.一種RNA引物，其特征在于，所述RNA引物的序列為CGATTGAGGCCGGTAATACGACTCACTATAGGG_GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC_NNNNNNNN_CATCACGC_TTTTTTTTTV，其中：
序列CGATTGAGGCCGGTAATACGACTCACTATAGGG為T7啟動子；
序列GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC為RA5即Illumina測序平臺識別引物；
序列NNNNNNNN為特異分子識別碼(UMI)；
序列CATCACGC為樣品識別碼(SB，sample barcode)，為可變序列；
序列TTTTTTTTTV是多聚T尾。
2.一種DNA引物，其特征在于，所述DNA引物的序列為CGATTGAGGCCGGTAATACGACTCACTATAGGG_GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC_NNNNNNNN_CATCACGC_CATG，其中：
序列CGATTGAGGCCGGTAATACGACTCACTATAGGG為T7啟動子；
序列GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC為RA5即Illumina測序平臺識別引物；
序列NNNNNNNN為特異分子識別碼(UMI)；
序列CATCACGC為樣品識別碼(SB，sample barcode)，為可變序列；
序列CATG為內切酶Nlalll識別序列。
3.一種RA3連接物，其特征在于，所述RA3連接物的序列為5’TGGAATTCTCGGGTGCCAAGG。
4.一種RTP反轉錄引物，其特征在于，所述RTP反轉錄引物的序列為5’GCCTTGGCACCCGAGAATTCCA。
5.一種PCR擴增反應體系中的引物，其特征在于，包括RP1共用引物和RPI含索引序列引物，其中：
所述RP1共用引物的序列為：
5’AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA；
所述RPI含索引序列引物的序列為：
5’CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCT
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