[發明專利]一種病理切片組織區域快速配準算法在審
| 申請號: | 202010151108.6 | 申請日: | 2020-03-05 |
| 公開(公告)號: | CN111292315A | 公開(公告)日: | 2020-06-16 |
| 發明(設計)人: | 陳杰;鄭眾喜;王柄智;楊一明 | 申請(專利權)人: | 四川大學華西醫院 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/30 |
| 代理公司: | 成都高遠知識產權代理事務所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李安霞;曾克 |
| 地址: | 610000 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 病理 切片 組織 區域 快速 算法 | ||
本發明公開一種病理切片組織區域快速配準算法,包括以下步驟:S100、從數字切片A1中獲取縮略圖a1,從數字切片A2中獲取縮略圖a2;S200、從縮略圖a1中分割出組織區域圖b1,從縮略圖a2中分割出組織區域圖b2;S300、以組織區域圖b1為模板,以組織區域圖b1和組織區域圖b2的互信息度量為目標函數,從旋轉角度、尺度變換、是否翻轉三個維度搜索最優變換矩陣,使得組織區域圖b1和變換后的組織區域圖b2互信息度量最大,得到粗配準結果c1;S400、以組織區域圖b1作為模板,以粗配準結果c1作為初始化圖像,優化組織區域圖b1和粗配準結果c1中的相似性度量,即可快速收斂至最優解,得到精細配準結果。本發明配準流程泛化能力更好,配準效率更高。
技術領域
本發明涉及圖像匹配技術領域,尤其涉及一種病理切片組織區域快速配準算法。
背景技術
臨床上,病理科組織學免疫組化染色會從同一個組織上取多張切片,用不同的染色劑進行染色,醫生閱片時都是在腦海中做配準。這種方法在切片染色過淡時很難在腦海中有效配準,醫生需要反復對比才能在腦海中將區域重疊起來。
目前已有的方案是直接在取數字掃描切片上的圖像執行配準,但不同的切片通常存在旋轉、翻轉、位移和輕微形變情況。直接配準方法既耗時長,又不能保證能正確配準。
發明內容
本發明旨在提供一種病理切片組織區域快速配準算法,配準流程泛化能力更好,配準效率更高。
為達到上述目的,本發明是采用以下技術方案實現的:
本發明公開一種病理切片組織區域快速配準算法,包括以下步驟:
S100、從數字切片A1中獲取縮略圖a1,從數字切片A2中獲取縮略圖a2;
S200、從縮略圖a1中分割出組織區域圖b1,從縮略圖a2中分割出組織區域圖b2;
S300、以組織區域圖b1為模板,以組織區域圖b1和組織區域圖b2的互信息度量為目標函數,從旋轉角度、尺度變換、是否翻轉三個維度搜索最優變換矩陣,使得組織區域圖b1和變換后的組織區域圖b2互信息度量最大,得到粗配準結果c1;
S400、以組織區域圖b1作為模板,以粗配準結果c1作為初始化圖像,優化組織區域圖b1和粗配準結果c1中的相似性度量,即可快速收斂至最優解,得到精細配準結果。
優選的,步驟S200中,分割算法包括閾值分割算法、區域生長分割算法、基于深度學習的分割算法。
優選的,步驟S300中,最優變換矩陣的確定方法包括以下步驟:
S3111、將組織區域圖b2旋轉角度p,得到組織區域圖b2′1,比較組織區域圖b2′1與組織區域圖b1,得到互信息度量k1;
S3112、將組織區域圖b2′1旋轉角度p,得到組織區域圖b2′2,比較組織區域圖b2′2與組織區域圖b1,得到互信息度量k2;
……
S311i、將組織區域圖b2′i-1旋轉角度p,得到組織區域圖b2′i,比較組織區域圖b2′i與組織區域圖b1,得到互信息度量ki;
……
S311n、將組織區域圖b2′n-1旋轉角度p,得到組織區域圖b2′n,比較組織區域圖b2′n與組織區域圖b1,得到互信息度量kn;
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