[發(fā)明專利]一種病理切片組織區(qū)域快速配準(zhǔn)算法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010151108.6 | 申請日: | 2020-03-05 |
| 公開(公告)號: | CN111292315A | 公開(公告)日: | 2020-06-16 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 陳杰;鄭眾喜;王柄智;楊一明 | 申請(專利權(quán))人: | 四川大學(xué)華西醫(yī)院 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/30 |
| 代理公司: | 成都高遠(yuǎn)知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李安霞;曾克 |
| 地址: | 610000 四*** | 國省代碼: | 四川;51 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 病理 切片 組織 區(qū)域 快速 算法 | ||
1.一種病理切片組織區(qū)域快速配準(zhǔn)算法,其特征在于包括以下步驟:
S100、從數(shù)字切片A1中獲取縮略圖a1,從數(shù)字切片A2中獲取縮略圖a2;
S200、從縮略圖a1中分割出組織區(qū)域圖b1,從縮略圖a2中分割出組織區(qū)域圖b2;
S300、以組織區(qū)域圖b1為模板,以組織區(qū)域圖b1和組織區(qū)域圖b2的互信息度量為目標(biāo)函數(shù),從旋轉(zhuǎn)角度、尺度變換、是否翻轉(zhuǎn)三個維度搜索最優(yōu)變換矩陣,使得組織區(qū)域圖b1和變換后的組織區(qū)域圖b2互信息度量最大,得到粗配準(zhǔn)結(jié)果c1;
S400、以組織區(qū)域圖b1作為模板,以粗配準(zhǔn)結(jié)果c1作為初始化圖像,優(yōu)化組織區(qū)域圖b1和粗配準(zhǔn)結(jié)果c1中的相似性度量,即可快速收斂至最優(yōu)解,得到精細(xì)配準(zhǔn)結(jié)果。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的配準(zhǔn)算法,其特征在于:步驟S200中,分割算法包括閾值分割算法、區(qū)域生長分割算法、基于深度學(xué)習(xí)的分割算法。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的配準(zhǔn)算法,其特征在于:步驟S300中,最優(yōu)變換矩陣的確定方法包括以下步驟:
S3111、將組織區(qū)域圖b2旋轉(zhuǎn)角度p,得到組織區(qū)域圖b2′1,比較組織區(qū)域圖b2′1與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量k1;
S3112、將組織區(qū)域圖b2′1旋轉(zhuǎn)角度p,得到組織區(qū)域圖b2′2,比較組織區(qū)域圖b2′2與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量k2;
……
S311i、將組織區(qū)域圖b2′i-1旋轉(zhuǎn)角度p,得到組織區(qū)域圖b2′i,比較組織區(qū)域圖b2′i與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量ki;
……
S311n、將組織區(qū)域圖b2′n-1旋轉(zhuǎn)角度p,得到組織區(qū)域圖b2′n,比較組織區(qū)域圖b2′n與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量kn;
S312、從互信息度量k1~互信息度量kn中選取最大互信息度量kmax,確定相對應(yīng)的最適合的旋轉(zhuǎn)角度,獲得組織區(qū)域圖b2_1,
其中1<i<n,n*p=360°。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的配準(zhǔn)算法,其特征在于:步驟S300中,最優(yōu)變換矩陣的確定方法還包括以下步驟:
S3211、將組織區(qū)域圖b2_1變換倍率q,得到組織區(qū)域圖b2_1′1,比較組織區(qū)域圖b2_1′1與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量x1;
……
S321h、將組織區(qū)域圖b2_1′h-1變換倍率q,得到組織區(qū)域圖b2_1′h,比較組織區(qū)域圖b2_1′h與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量xh;
……
S321m、將組織區(qū)域圖b2_1′m-1變換倍率q,得到組織區(qū)域圖b2_1′m,比較組織區(qū)域圖b2_1′m與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量xm;
S322、從互信息度量x1~互信息度量xm中選取最大互信息度量xmax,確定相對應(yīng)的最適合的變換倍率,獲得組織區(qū)域圖b2_2。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的配準(zhǔn)算法,其特征在于:步驟S300中,最優(yōu)變換矩陣的確定方法還包括以下步驟:
S331、翻轉(zhuǎn)組織區(qū)域圖b2_2,得到組織區(qū)域圖b2_2′,比較組織區(qū)域圖b2_2′與組織區(qū)域圖b1,得到互信息度量y,比較互信息度量y和最大互信息度量xmax,得到對應(yīng)的粗配準(zhǔn)結(jié)果c1。
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