[發明專利]甲狀腺結節相關rDNA甲基化標志物及其應用

有效

• 申請號: 202010122224.5
• 申請日: 2020-02-27
• 公開（公告）號: CN110982907B
• 公開（公告）日: 2020-07-03
• 發明（設計）人: 蘇志熙;劉蕊;馬成城;徐汪洋
• 申請（專利權）人: 上海鹍遠生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6883;C12N15/11;G16B20/00
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 陶啟長;韋東

1.一種鑒定甲狀腺結節良惡性的試劑盒，包含檢測DNA甲基化的引物或探針和任選的核酸分子，所述試劑盒還包含檢測DNA甲基化所需的其他試劑，其中，

所述檢測DNA甲基化的引物或探針是特異性檢測以下（1）-（15）所示的rDNA位點的甲基化水平的引物或探針：

（1）1112、1116、1119、1130和1141，

（2）2565、2568、2571、2582、2584和2586，

（3）2650、2659、2661、2670、2673、2678、2684、2688、2698和2708，

（4）4491、4496、4507、4533、4535、4556、4583、4587、4597、4604和4607，

（5）5773、5783、5785、5790和5798，

（6）7089、7102、7115、7117、7120、7122、7124、7126、7131、7138、7145和7148，

（7）8553、8565、8568、8576和8583，

（8）8680、8690、8694、8698、8702、8718和8724，

（9）9323、9326、9328、9332和9335，

（10）9339、9352、9368、9371和9377，

（11）21720、21727、21740和21757，

（12）36572、36596、36604、36620、36622和36630，

（13）36985、36988和36996，

（14）38500、38502、38554、38571、38588、38596和38602，

（15）38957、38974、38980、38982、39004和39012，

所述rDNA位點的堿基編號對應于參考基因組Genebank號U13369.1，

或

所述檢測DNA甲基化的引物或探針是特異性檢測以下區域的甲基化水平的引物或探針：rDNA的1111-1141bps，rDNA的2564-2586bps，rDNA的2649-2708bps，rDNA的4490-4607bps，rDNA的5772-5798bps，rDNA的7088-7148bps，rDNA的8552-8583bps，rDNA的8679-8724bps，rDNA的9322-9335bps，rDNA的9338-9377bps，rDNA的21719-21757bps，rDNA的36571-36630bps，rDNA的36984-36996bps，rDNA的38499-38602bps，rDNA的38956-39012bps，所述rDNA的堿基編號對應于參考基因組Genebank號U13369.1，

所述核酸分子包括（1）-（15）所示的rDNA位點：

（1）1112、1116、1119、1130和1141，

（2）2565、2568、2571、2582、2584和2586，

（3）2650、2659、2661、2670、2673、2678、2684、2688、2698和2708，

（4）4491、4496、4507、4533、4535、4556、4583、4587、4597、4604和4607，

（5）5773、5783、5785、5790和5798，

（6）7089、7102、7115、7117、7120、7122、7124、7126、7131、7138、7145和7148，

（7）8553、8565、8568、8576和8583，

（8）8680、8690、8694、8698、8702、8718和8724，

（9）9323、9326、9328、9332和9335，

（10）9339、9352、9368、9371和9377，

（11）21720、21727、21740和21757，

（12）36572、36596、36604、36620、36622和36630，

（13）36985、36988和36996，

（14）38500、38502、38554、38571、38588、38596和38602，

（15）38957、38974、38980、38982、39004和39012，

所述rDNA位點的堿基編號對應于參考基因組Genebank號U13369.1，

或

所述核酸分子包括以下區域：rDNA的1111-1141bps，rDNA的2564-2586bps，rDNA的2649-2708bps，rDNA的4490-4607bps，rDNA的5772-5798bps，rDNA的7088-7148bps，rDNA的8552-8583bps，rDNA的8679-8724bps，rDNA的9322-9335bps，rDNA的9338-9377bps，rDNA的21719-21757bps，rDNA的36571-36630bps，rDNA的36984-36996bps，rDNA的38499-38602bps，rDNA的38956-39012bps，其中，所述核酸分子長度為10bp-40kb，所述rDNA的堿基編號對應于參考基因組Genebank號U13369.1。