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[發明專利]一種與水稻葉色變異、早衰、耐逆相關的基因、該基因編碼的蛋白質及其用途有效

專利信息
申請號: 202010105658.4 申請日: 2020-02-20
公開(公告)號: CN111893122B 公開(公告)日: 2022-05-24
發明(設計)人: 朱麗;錢前;陳冬東;王小琦;曾大力;張光恒;胡江;陳光;沈蘭;張強;任德勇;郭龍彪;董國軍;高振宇 申請(專利權)人: 中國水稻研究所
主分類號: C12N15/29 分類號: C12N15/29;C07K14/415;C12N15/82;A01H5/00;A01H5/12;A01H6/46
代理公司: 杭州杭誠專利事務所有限公司 33109 代理人: 王江成;何俊
地址: 310000 浙江*** 國省代碼: 浙江;33
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 水稻 變異 早衰 相關 基因 編碼 蛋白質 及其 用途
【說明書】:

發明涉及植物基因工程,公開了一種與水稻葉色變異、早衰、耐逆相關的基因、該基因編碼的蛋白質及其用途,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID No:1、SEQ ID No:2所示。本發明利用圖位克隆技術克隆水稻OsYPD1基因,以及利用轉基因互補實驗鑒定該基因的功能;同時利用該基因編碼產物研究對水稻衰老及耐逆的影響,可用于提高水稻的耐逆能力。

技術領域

本發明涉及植物基因工程,尤其涉及一種與水稻葉色變異、早衰、耐逆相關的基因、該基因編碼的蛋白質及其用途。

背景技術

模式識別受體(PRR),如TLR(Toll-like receptor),NLR(nucleotide-bindingdomain,leucine-rich repeat containing),CLR(C-type lectin receptor),RLR(RIG-I-like receptor)是宿主免疫系統的重要組成部分,其中NOD(nucleotide oligomerizationdomain)樣受體NLRs是與病原體相關的分子模式(PAMPs)和損害/危險相關的分子模式(DAMPs)引起的免疫和炎癥相關的模式識別受體。使用標準命名法將NLRs根據其域結構和系統發育關系分類為NLRA/CIITA,NLRB/NAIP,NLRC,NLRP和NLRX1子家族。NLRC是最大和最重要的組之一,包括NLRC1/NO D1,NLRC2/NOD2,NLRC3/NOD3,NLRC4/IPAF和NLRC5。其中NLRC3(也稱為CLR16.2或NOD3)是含有CARD(caspase-recruitment domain)結構域的NOD樣受體家族3的簡稱,具有三個特征結構域:一個可變的N末端效應子結構域,負責通過蛋白質-蛋白質相互作用觸發下游信號通路;一個用于自我調節和寡聚的中央核苷酸結合寡聚域NACHT(NAIP,CIITA,HET-E和TP1),又稱為NBD或NOD結構域(nucleotide-bindingdomain);以及一個富含亮氨酸的重復序列(LRR)配體結合特異性所需的C末端。在哺乳動物中的研究發現NLRC3具有炎癥及腫瘤信號通過檢查點的功能,既可負調節NF-K B活化及IFN-1(type 1 interferon)的產生來削弱炎癥、免疫反應,也可通過抑制P13K-mTOR信號軸的活化影響細胞的增殖來發揮抗腫瘤的功能。此外,NLRC3還可以對細胞質DNA、di-cGMP和DNA病毒產生負調節STING依賴性的先天性免疫激活,并降低1型干擾素和其他細胞因子的產生。

植物中關于NLRC3的研究很少,只在豆類植物中有為數不多的報道,如在豌豆(pisum sativum L.)中NOD3和NOD5兩個共生基因的結合促進了植株的結瘤、活性固氮和高產,但是在關于水稻未見相關報道。

發明內容

本發明提供了一種與水稻葉色變異、早衰、耐逆相關的基因、該基因編碼的蛋白質及其用途。本發明利用圖位克隆技術克隆水稻OsYPD1基因,以及利用轉基因互補實驗鑒定該基因的功能;同時利用該基因編碼產物研究對水稻衰老及耐逆的影響,可用于提高水稻的耐逆能力。

本發明的具體技術方案為:

第一方面,本發明提供了一種與水稻葉色變異、早衰、耐逆相關的基因,,該基因命名為OsYPD1,所述基因的核苷酸序列如SEQ ID No:1、SEQ ID No:2所示。

備注說明:SEQ ID No:1為cDNA全長,SEQ ID No:2為gDNA全長。

優選地,所述基因的核苷酸序列還包括在SEQ ID No:1、SEQ ID No:2所示的核苷酸序列中添加、取代,插入或缺失一個或多個核苷酸而生成的與SEQ ID No:1、SEQ ID No:2所示核苷酸序列具有至少80%同源性的突變體、等位基因或衍生物。

第二方面,本發明提供了一種上述基因編碼的蛋白質,所述蛋白質具有如SEQ IDNo:3所示的氨基酸序列。

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