[發明專利]豬GATB基因作為仔豬死亡率相關的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202010092413.2
• 申請日: 2020-02-14
• 公開（公告）號: CN111304335B
• 公開（公告）日: 2022-07-29
• 發明（設計）人: 朱猛進;趙書紅;安美景;李新云;項韜;劉小磊;馬云龍;余梅;劉向東;趙云翔;李家連;管石勝
• 申請（專利權）人: 廣西揚翔股份有限公司;華中農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201
• 代理人: 黃瓊

本發明提出了與仔豬死亡率相關的SNP標記，所述SNP標記選自SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第404位核苷酸，為堿基C或T。利用該分子標記可準確預測不同基因型群體豬之間死亡率性狀的差別，準確、高效地選育出母豬繁殖能力佳的優良豬品種，具有簡單、快捷、靈敏度高和特異性好等突出優點。在豬育種工作中，該分子標記可作為死亡率性狀的可靠標記，便于進行早期選擇，從而縮短世代間隔，提高選擇強度，提高選種效率和準確性。

技術領域

本發明涉及SNP標記及其應用。具體地，本發明涉及豬GATB基因作為仔豬死亡率相關的分子標記及其應用。更具體地，本發明涉及仔豬死亡率相關的SNP標記及其應用。

背景技術

隨著我國居民生活水平的提高，人們對肉類食物的需求逐漸增加。在人們對肉類需求增長的推動下，我國養殖業增長迅速。2019年10月14日發布的《中國的糧食安全》白皮書中顯示2018年中國豬、牛、羊肉的人均占有量為46.8公斤，比1996年增加了16.6公斤，增長55％。在我國養殖業提供各類肉品中，豬肉是最大宗的肉類消費品，約占消費肉類的63％左右。根據2012年的年鑒數據，生豬產值占了農業總產值的18％，是我國單項產值最大的農產品，產值規模相當于水稻、小麥和玉米等主要作物的產值總和。不過，目前我國居民人均肉類消費水平仍遠低于歐美發達國家，我國養豬生產效率遠不能完全滿足我國居民對肉類消費日益增加的需求。

繁殖性狀是影響養殖效益的重要經濟性狀，直接制約母豬的繁殖力和養殖場的收益。對繁殖性狀進行遺傳改良，提高豬的繁殖性能是提高養殖效益有效途徑。母豬的總產仔數、死胎數、斷奶仔豬數、窩產仔豬體重及性別比例等是衡量母豬繁殖性能的重要指標，并受到諸多因素的影響。母豬第一胎的繁殖性能通常表現不佳，提高第一胎的繁殖能力可有效提高母豬的繁殖性能。母豬繁殖能力主要體現為產仔數的構成，包括總產仔數、產活子數、弱仔數、死仔數、木乃伊數等，其中由總產仔數、死仔數、木乃伊數構建的死亡率指標是度量母豬繁殖性能的常用指標之一，仔豬死亡率等于母豬第一胎次分娩當日的總死亡仔數除以總出生仔數，其中總死亡數等于死胎數加木乃伊個體數。通過育種從遺傳上改良母豬的死亡率性狀可從根本上提高母豬的繁殖效率。死亡率性狀是低遺傳力性狀，常規育種手段進展緩慢，挖掘豬死亡率的分子標記，通過分子輔助選擇可加快豬死亡率性狀的改良進程。

然而，目前針對仔豬死亡率的SNP標記仍有待研究。

發明內容

本發明旨在至少在一定程度上解決現有技術中存在的技術問題。為此，本發明提出了與仔豬死亡率相關的SNP標記、用于檢測該SNP標記的引物組和試劑盒及其應用、預測仔豬死亡率的方法和系統以及豬選育系統。由此，利用該分子標記可準確預測不同基因型群體豬之間死亡率性狀的差別，準確、高效地選育出母豬繁殖能力佳的優良豬品種，具有簡單、快捷、靈敏度高和特異性好等突出優點。在豬育種工作中，該分子標記可作為死亡率性狀的可靠標記，便于進行早期選擇，從而縮短世代間隔，提高選擇強度，提高選種效率和準確性。

其中，需要說明的是，SNP(single nucleotide polymorphism,SNP，即單核苷酸多態性)是1996年由美國麻省理工學院的人類基因組研究中心學者Lander提出的一類分子遺傳標記，主要是指基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。SNP表現出的多態性僅涉及到單個堿基的變異，表現是有轉換、顛換、插入和缺失等。

在本發明的一個方面，本發明提出了一種與仔豬死亡率相關的SNP標記。根據本發明的實施例，所述SNP標記選自SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第401位核苷酸，為堿基C或T。