[發明專利]一種快速檢測犬瘟熱病毒(CDV)的RDA方法及試劑盒在審
| 申請號: | 202010081179.3 | 申請日: | 2020-02-06 |
| 公開(公告)號: | CN112301151A | 公開(公告)日: | 2021-02-02 |
| 發明(設計)人: | 文荻琛;羅寶花;劉華勇;陳翀 | 申請(專利權)人: | 廣州普世君安生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 510000 廣東省廣州市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 快速 檢測 犬瘟熱 病毒 cdv rda 方法 試劑盒 | ||
1.一種用于檢測犬瘟熱病毒(CDV)的探針,其特征在于,所述探針核苷酸序列如SEQ IDNO .1或SEQ ID NO .2所示。
2.如權利要求1所述的檢測犬瘟熱病毒的探針,其特征在于,所述核苷酸序列為SEQ IDNO .1的探針,其5’端標記發光基團,3’端標記淬滅基團,第5-10位堿基中任一位置用四氫呋喃殘基(THF)替代。
3.如權利要求1所述的檢測犬瘟熱病毒的探針,其特征在于,所述核苷酸序列為SEQ IDNO .2的探針,其5’端起第29位堿基T標記發光基團,第31位堿基用四氫呋喃殘基(THF)替代,第32位堿基標記淬滅基團,3’端進行C3-spacer阻斷修飾。
4.一組用于檢測犬瘟熱病毒的靶標序列、引物對及探針,其特征在于,所述探針為權利要求1-3 任一所述探針,所述引物對核苷酸序列如SEQ ID NO .3和SEQ ID NO .4所示,所述靶標序列如SEQ ID NO .5所示。
5.一種檢測犬瘟熱病毒的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括核酸提取試劑、恒溫擴增反應模塊、陽性對照和陰性對照,以及權利要求1-3任一所述的探針及權利要求4所述的引物對。
6.如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于,所述的恒溫擴增反應模塊為RDA或RPA恒溫擴增反應混合試劑的凍干粉試劑;所述RDA恒溫擴增反應混合試劑的凍干粉試劑包括核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示的重組酶KX。
7.如權利要求6所述的試劑盒,其特征在于,所述的RDA恒溫擴增反應混合試劑的凍干粉試劑包括重組酶KX 60-600 ng/μL、KY蛋白16-192 ng/μL、單鏈結合蛋白gp32 100-1000ng/μL、鏈置換DNA聚合酶3-100 ng/μL、反轉錄酶200U、核酸外切酶30~200U、肌酸激酶0.1-0.8 mg/ml、磷酸肌酸25-75 mM、Tris緩沖液20~100mM、PEG 2.5%-10%、醋酸鉀或醋酸鈉0-150 mM、dATP 1-5 mM、dNTPs 150-600 nM、DTT 1-12 mM、所述探針150nM-600nM、所述引物對150-600nM。
8.如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于,所述的核酸提取試劑包括Buffer A、Buffer B;所述Buffer A為樣本裂解液,含有Tris-HCL緩沖體系、NaOH、SDS、EDTA、異硫氰酸胍、Tween80、曲拉通;所述Buffer B含有Tris緩沖體系、氯化鉀、氯化鎂;所述陽性對照為含有犬瘟熱病毒靶標基因的質粒,所述陰性對照為空載體pUC57質粒。
9.一種非疾病診斷目的檢測犬瘟熱病毒的檢測方法,其特征在于,包含以下步驟:
提取待測樣品的核酸,以待測樣品的核酸為模板,在犬瘟熱病毒的引物對、探針及RDA凍干粉試劑、Buffer A和Buffer B存在下進行實時熒光RDA反應,根據實時熒光RDA擴增曲線分析待測樣品;其中所述探針的核苷酸序列如SEQ ID NO .1或SEQ ID NO .2所示; 其中反應溫度為25-42℃,反應時間大于10分鐘。
10.如權利要求9所述的檢測方法,其特征在于,所述反應溫度為39℃,所述反應時間為30分鐘。
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