[發(fā)明專利]一種與非綜合征型多生牙診斷相關(guān)的SNP標(biāo)志物及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010068651.X
• 申請日: 2020-01-21
• 公開（公告）號: CN111139295B
• 公開（公告）日: 2022-11-22
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 潘永初;楊帆
• 申請（專利權(quán)）人: 南京醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責(zé)任公司 32218
• 代理人: 杜靜;徐冬濤

本專利公開了一種與非綜合征型多生牙易感性輔助診斷相關(guān)的SNP標(biāo)志物及其應(yīng)用，所述SNP標(biāo)志物為rs2682818，并在此基礎(chǔ)上開發(fā)了其在非綜合征型多生牙易感性診斷試劑盒中的應(yīng)用。本專利所述的標(biāo)志物和應(yīng)用可使得非綜合征型多生牙的診斷更加快速簡便高效，并為發(fā)現(xiàn)可能具有治療價值的新型小分子藥物靶標(biāo)提供依據(jù)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于基因工程及生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，涉及一種與非綜合征型多生牙診斷相關(guān)的SNP標(biāo)志物及其相關(guān)試劑盒的應(yīng)用。

背景技術(shù)

多生牙(Supernumerary teeth)，是一種常見的先天性發(fā)育缺陷，在人群中其發(fā)病率約0.5％-3.8％。在不同的患者中，多生牙的發(fā)生具有數(shù)目、位置和形態(tài)等方面的特異性，因其特異性所造成的危害也大不相同。多生牙的發(fā)生不僅會對患者的美觀、容貌造成影響甚至?xí)斐慑e頜畸形或影響牙齒的正常萌出。

多生牙分類：根據(jù)是否伴有全身其他組織器官畸形，多生牙可分為兩類：綜合征型多生牙(Syndromic supernumerary teeth)和非綜合征型多生牙(non-syndromicsupernumerary teeth)。大體而言，非綜合征型多生牙常以單顆的形式出現(xiàn)，而多顆多生牙常常是多種綜合征型疾病的一種伴發(fā)癥狀。綜合征型多生牙常常可在唇腭裂、顱骨鎖骨發(fā)育不全、遺傳性腸息肉的患者中發(fā)現(xiàn)。

基因多態(tài)性(Genetic polymorphism)是指在一個生物群體中，同時和經(jīng)常存在兩種或多種不連續(xù)的變異型(Varient)或基因型(Genotype)或等位基因(Allele)，亦稱遺傳多態(tài)性。在已識別的遺傳變異中，單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphisms，SNPs)是最為常見的變異類型，主要是指由于單個核苷酸的變異所引起的基因組DNA序列的變化。SNP一般只涉及到單個堿基的變異，這種變異可由單個堿基的轉(zhuǎn)換(Transition)、顛換(Transversion)或缺失(Deletion)等所引起，占所有己知多態(tài)性的90％以上。SNP在人類基因組中廣泛存在，估計其總數(shù)超過300萬個。

多生牙的致病機(jī)制非常復(fù)雜目前仍不明確，但遺傳易感性在多生牙的發(fā)病中扮演者重要的角色。MicroRNA(miRNA)是一種由20-22個核苷酸組成的非編碼RNA，其廣泛的參與顱頜面部的發(fā)育。目前已經(jīng)確認(rèn)了幾個與多生牙相關(guān)的基因，但miRNA在多生牙的發(fā)病中所發(fā)揮的作用尚不明確。不同個體具有不盡相同的遺傳易感性，這種遺傳易感性往往與個體基因組中存在的遺傳變異相關(guān)，大部分是由SNPs引起。因此，探尋miRNA SNPs與多生牙的關(guān)聯(lián)來進(jìn)一步尋找其易感標(biāo)志，具有潛在的生物和臨床意義。

發(fā)明內(nèi)容

針對上述技術(shù)問題，發(fā)明人發(fā)現(xiàn)了rs2682818位點C等位基因與非綜合征型多生牙的相關(guān)性，并據(jù)此開發(fā)了其在非綜合征型多生牙易感性的診斷試劑盒中的應(yīng)用。

本發(fā)明的目的之一是提出一種與非綜合征型多生牙輔助診斷相關(guān)的SNP標(biāo)志物。

本發(fā)明的目的之二是提供檢測上述SNP標(biāo)志物的特異性引物對和探針。

本發(fā)明的目的之三是提供上述SNP標(biāo)志物在制備非綜合征型多生牙診斷試劑盒中的應(yīng)用。

本發(fā)明的目的之四是提供上述特異性引物對和探針在制備非綜合征型多生牙診斷試劑盒中的應(yīng)用。

本發(fā)明的目的之五是提供非綜合征型多生牙輔助診斷試劑盒。

發(fā)明人通過提供一組與非綜合征型多生牙高度相關(guān)的高特異性和敏感性的SNP，并研制出可便于臨床應(yīng)用的非綜合征型多生牙輔助診斷試劑盒，為非綜合征型多生牙的篩查和診斷提供數(shù)據(jù)支持。

本發(fā)明的目的是通過下列技術(shù)方案實現(xiàn)的：

一種與非綜合征型多生牙輔助診斷相關(guān)的SNP標(biāo)志物rs2682818。