[發明專利]一種可視化編輯upset韋恩圖的生成方法及系統在審
| 申請號: | 201911191849.0 | 申請日: | 2019-11-28 |
| 公開(公告)號: | CN110970092A | 公開(公告)日: | 2020-04-07 |
| 發明(設計)人: | 夏昊強;周煌凱;高川;陶勇;羅玥;程祖福;邢燕;曾川川 | 申請(專利權)人: | 廣州基迪奧生物科技有限公司 |
| 主分類號: | G16B45/00 | 分類號: | G16B45/00 |
| 代理公司: | 廣州容大專利代理事務所(普通合伙) 44326 | 代理人: | 劉新年 |
| 地址: | 510000 廣東省廣州市廣州國*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 可視化 編輯 upset 韋恩圖 生成 方法 系統 | ||
本發明涉及高通量測序生物信息領域,具體涉及一種可視化編輯upset韋恩圖的生成方法及系統。通過獲取繪制upset韋恩圖實時請求數據;對獲取到的實時請求數據進行解析處理;根據解析處理得到的數據,生成可視化編輯upset韋恩圖。可以實現通過簡單的任務編號、上傳需要繪制upset韋恩圖的數據文件及參數設置這些簡單的操作,實現自動繪圖,大大解決了用戶畫圖難的困擾,提高了工作效率。再者,可實現用戶在查看結果時可以通過點擊柱狀圖柱子即可查看對應的結果信息,也可以直接進行相應參數的修改,圖片結果會實時得到修改,直到用戶滿意便可進行圖片下載保存,這樣的結果可編輯性強、圖形美觀。
技術領域
本發明涉及高通量測序生物信息領域,具體涉及一種可視化編輯upset韋恩圖的生成方法及系統。
背景技術
韋恩圖(Venn diagram),在1880年由英國哲學家和數學家John Venn提出。在高通量測序數據分析中廣泛應用,常被用于展示不同樣本間共有的或特有的基因。常見的韋恩圖一般用于處理5個以下分組,,當處理組增加到5個以上,雖然可以繪制出不同形式的韋恩圖。但是,結果可讀性很差,用戶很難從圖中解讀到想要的信息。因此,有了upsetR包用來畫韋恩圖解讀樣本處理組多的情況。然而,該工具繪制出的韋恩圖是靜態的,具有無法實時編輯、時效性差的弊端。
發明內容
針對無法實時編輯、時效性差的技術問題,本發明提供一種可視化編輯upset韋恩圖的生成方法、系統、平臺及存儲介質,實現可實時編輯,時效性好的目的。
本發明具體通過以下技術方案實現:
一種可視化編輯upset韋恩圖的生成方法,所述的方法,具體包括如下步驟:
獲取繪制upset韋恩圖實時請求數據;
對獲取到的實時請求數據進行解析處理;
根據解析處理得到的數據,生成可視化編輯upset韋恩圖。
進一步地,所述的實時請求數據包括:用戶命名的任務編號、繪圖數據文件和是否去重復性的參數設置信息。
進一步地,于步驟獲取繪制upset韋恩圖實時請求數據中,還包括如下步驟:
判斷是否去重復性的參數設置。
進一步地,于步驟對獲取到的實時請求數據進行解析處理中,還包括如下步驟:
通過解析處理得到的任務編號和繪圖參數設置信息生成配置文件和繪圖任務執行命令。
進一步地,于步驟根據解析處理得到的數據,生成可視化編輯upset韋恩圖中,還包括如下步驟:
將解析處理得到的數據統計分類,并對數據的集合關系進行計算,生成相對應的結果文件;
將結果文件實時存儲于云端,并對存儲狀態實時提醒。
進一步地,于步驟根據解析處理得到的數據,生成可視化編輯upset韋恩圖之后,還包括如下步驟:
對生成可視化編輯upset韋恩圖進行實時展示和繪圖交互;
所述的實時展示和繪圖交互具體包括對生成的upset韋恩圖進行預覽、修改和下載。
為實現上述目的,本發明還提供一種可視化編輯upset韋恩圖的生成系統,所述的系統具體包括:
獲取單元,用于獲取繪制upset韋恩圖實時請求數據;
解析處理單元,用于對獲取到的實時請求數據進行解析處理;
生成單元,用于根據解析處理得到的數據,生成可視化編輯upset韋恩圖。
進一步地,所述的系統還包括:
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