[發明專利]一種可以改善全基因組甲基化測序偏向性的建庫方法有效
| 申請號: | 201910851085.7 | 申請日: | 2019-09-10 |
| 公開(公告)號: | CN112553298B | 公開(公告)日: | 2023-06-23 |
| 發明(設計)人: | 羅慧娟;楊琴;羅甜;于源;吳逵;李旺勝;辜倫達;李南南;陳小芳 | 申請(專利權)人: | 深圳華大生命科學研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/6806 | 分類號: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
| 代理公司: | 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 | 代理人: | 何葉喧 |
| 地址: | 518083 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 可以 改善 基因組 甲基化 偏向 方法 | ||
1.一種制備甲基化測序文庫的方法,依次包括如下步驟:
(1)在同一體系內進行雙鏈DNA片段的末端修復和加A;在末端修復和加A的反應體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNA?PolymeraseI;
(2)連接甲基化修飾接頭;
(3)進行亞硫酸鹽處理。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于:所述方法還包括如下步驟:
(4)PCR擴增。
3.如權利要求2所述的方法,其特征在于:所述方法還包括如下步驟:
(5)單鏈環化。
4.一種制備甲基化測序文庫的方法,包括末端修復和加A的步驟,其特征在于:
在同一體系內進行雙鏈DNA片段的末端修復和加A;在末端修復和加A的反應體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNA?Polymerase?I。
5.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復和加A的方法,其特征在于:
在同一體系內進行雙鏈DNA片段的末端修復和加A;在末端修復和加A的反應體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNA?Polymerase?I。
6.一種制備甲基化測序文庫的方法,包括末端修復的步驟,其特征在于:
在末端修復的體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNAPolymerase?I。
7.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復的方法,其特征在于:
在末端修復的體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNAPolymerase?I。
8.一種制備甲基化測序文庫的試劑盒,包括組件1、組件2和組件3;
所述組件1用于末端修復和加A;所述組件1包括dNTP和DNA?PolymeraseI;所述dNTP由dATP、dTTP和dGTP組成;
所述組件2用于連接甲基化修飾接頭;
所述組件3用于進行亞硫酸鹽處理。
9.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復和加A的試劑盒,包括dNTP和DNAPolymerase?I;所述dNTP由dATP、dTTP和dGTP組成。
10.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復的試劑盒,包括dNTP和DNA?PolymeraseI;所述dNTP由dATP、dTTP和dGTP組成。
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