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[發明專利]一種可以改善全基因組甲基化測序偏向性的建庫方法有效

專利信息
申請號: 201910851085.7 申請日: 2019-09-10
公開(公告)號: CN112553298B 公開(公告)日: 2023-06-23
發明(設計)人: 羅慧娟;楊琴;羅甜;于源;吳逵;李旺勝;辜倫達;李南南;陳小芳 申請(專利權)人: 深圳華大生命科學研究院
主分類號: C12Q1/6806 分類號: C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245 代理人: 何葉喧
地址: 518083 廣東*** 國省代碼: 廣東;44
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 可以 改善 基因組 甲基化 偏向 方法
【權利要求書】:

1.一種制備甲基化測序文庫的方法,依次包括如下步驟:

(1)在同一體系內進行雙鏈DNA片段的末端修復和加A;在末端修復和加A的反應體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNA?PolymeraseI;

(2)連接甲基化修飾接頭;

(3)進行亞硫酸鹽處理。

2.如權利要求1所述的方法,其特征在于:所述方法還包括如下步驟:

(4)PCR擴增。

3.如權利要求2所述的方法,其特征在于:所述方法還包括如下步驟:

(5)單鏈環化。

4.一種制備甲基化測序文庫的方法,包括末端修復和加A的步驟,其特征在于:

在同一體系內進行雙鏈DNA片段的末端修復和加A;在末端修復和加A的反應體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNA?Polymerase?I。

5.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復和加A的方法,其特征在于:

在同一體系內進行雙鏈DNA片段的末端修復和加A;在末端修復和加A的反應體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNA?Polymerase?I。

6.一種制備甲基化測序文庫的方法,包括末端修復的步驟,其特征在于:

在末端修復的體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNAPolymerase?I。

7.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復的方法,其特征在于:

在末端修復的體系中,加入的脫氧核糖核苷酸為dATP、dTTP和dGTP,加入的酶包括DNAPolymerase?I。

8.一種制備甲基化測序文庫的試劑盒,包括組件1、組件2和組件3;

所述組件1用于末端修復和加A;所述組件1包括dNTP和DNA?PolymeraseI;所述dNTP由dATP、dTTP和dGTP組成;

所述組件2用于連接甲基化修飾接頭;

所述組件3用于進行亞硫酸鹽處理。

9.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復和加A的試劑盒,包括dNTP和DNAPolymerase?I;所述dNTP由dATP、dTTP和dGTP組成。

10.一種制備甲基化測序文庫中進行末端修復的試劑盒,包括dNTP和DNA?PolymeraseI;所述dNTP由dATP、dTTP和dGTP組成。

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