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[發明專利]一種檢測BCORL1基因內含子7基因突變的引物和方法在審

專利信息
申請號: 201910529910.1 申請日: 2019-06-19
公開(公告)號: CN110218773A 公開(公告)日: 2019-09-10
發明(設計)人: 劉趙玲;裘振亞;王淑一 申請(專利權)人: 濟南艾迪康醫學檢驗中心有限公司
主分類號: C12Q1/6858 分類號: C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通專利事務所有限公司 33100 代理人: 黃素萍
地址: 250013 山東*** 國省代碼: 山東;37
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 基因內含子 引物 檢測結果 種檢測 再生障礙性貧血 測序引物 輔助檢查 輔助診斷 基因突變 突變檢測 突變位點 位點突變 預后 擴增 突變 診斷 參考 疾病 發現
【說明書】:

發明公開了一種檢測BCORL1基因內含子7區域51318 A>AG位點突變的引物和方法,其包括(i)擴增BCORL1基因內含子7序列的引物;采用Sanger測序技術和測序引物。采用Sanger測序技術,可快速發現此突變位點。利用本發明完成的檢測結果準確,可以輔助檢查該區域的突變情況。本發明可快速地將BCORL1基因內含子7區域51318 A>AG突變檢測出來。利用本發明完成的檢測結果準確,可以輔助診斷AML和再生障礙性貧血,對疾病的診斷和預后有重要的參考意義。

技術領域

本發明屬生命科學和生物技術領域,特別涉及檢測BCORL1基因內含子7 基因突變的引物和檢測方法。

背景技術

BCORL1基因位于X染色體Xq25-q26.1細胞帶,大約在129.14至129.19Mb 之間,含有13個外顯子,編碼1711個氨基酸,是一個轉錄共抑制因子。在大部 分人正常組織中BCORL1呈現低表達或表達缺失,僅僅在睪丸和前列腺組織呈 現高表達。

BCORL1基因的功能研究發現,其與Ⅱ類組蛋白脫乙酰基酶(histonedeacetylase,H D A C)存在相互作用,如HDAC4、HDAC5和HDAC7,BCOR1 通過結合啟動子區域特定位點抑制E—cadherin基因轉錄,另外,BCORL1也 可以與c端結合蛋白(C—terminalbinding protein,CtBP)協同作用,發揮E —cadherin轉錄抑制功能。E—cadherin表達受損NSCIC、胃癌、肝細胞癌和卵 巢癌等腫瘤侵襲轉移相關,而在包括NSCLC在內的多種腫瘤中,E—cadherin 啟動子甲基化狀態與其基因表達調控相關。提示BCORL1是一個腫瘤相關促進 基因。

80%BCORL1基因突變發生在原始細胞,細胞系中的所有BCORL1突變都 會截斷編碼蛋白,從而引起無義突變、剪接位點突變或插入或缺失。所有BCORL1 截斷突變都被預測會導致缺乏LXXLL核受體募集模體和C端的多肽嚴重縮短。 BCORL1突變在AML發病機制中起重要作用,在6%的急性髓性白血病(AML) 患者以及21%的AML細胞系中的存在BCORL1基因突變,BCORL1是一個 新的候選腫瘤促進基因。

除此之外,BCORL1基因突變還和再生障礙性貧血(AA)有關,研究結果 顯示,AA突變最常累及的5個基因為PIGA、BCOR/BCORL1、DNMT3A和 ASXL1。BCOR、BCORL1和PIGA基因突變在AA患者中更為顯著,而JAK2、 RUNX1、TET2和TP53基因突變在AA中則相對少見。并且,AA患者基因突 變在位點分布上與MDS/AML有高度重疊,主要表現為移碼、無義和剪接突變。因此,對再生障礙性貧血的患者檢測BCORL1基因突變,有助于了解疾病進程, 而且AA高度特異性突變(如BCOR、BCORL1和PIGA突變)通常提示對免疫 抑制療法有好的效果并預后良好,生存率高。

由此表明,BCORL1基因突變的檢測對再生障礙性貧血疾病進程演變及預后 觀測有重要的作用,尤其是在成人急性髓系白血病中的預后判斷及治療藥物的選 擇具有重要的指導意義。

發明內容

本發明的目的是提供一種檢測BCORL1基因內含子7突變熱點的引物,采 用PCR技術,可用于快速檢測患者體內BCORL1基因內含子7突變位點的情況。 所述檢測BCORL1基因內含子7位點突變情況的引物,包括:

擴增BCORL1基因內含子7的引物,其堿基序列為:

BCORL1-Int7-F:TTTCCTGTTTCTTGCCTTCA

BCORL1-Int7-R:TTCCCATTCTGCAAATCCAC。

進一步地,還包括測序引物,其堿基序列為:

檢測BCORL1基因內含子7的測序引物堿基序列為:

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