[發(fā)明專利]一種鑒定甜瓜品種真實性的方法及其專用SNP引物組合

有效

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• 申請日: 2019-01-28
• 公開（公告）號: CN109666756B
• 公開（公告）日: 2020-11-10
• 發(fā)明（設計）人: 溫常龍;張建;楊靜靜;羅江;劉偉倫;楊明珠
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

本發(fā)明公開了一種鑒定甜瓜品種真實性的方法及其專用SNP引物組合。本發(fā)明所提供的SNP引物組合由32個引物組組成。每個引物組由3條引物序列組成，用于擴增一個SNP位點。32個引物組中各個引物的核苷酸序列依次如序列表中序列1至序列96所示。本發(fā)明提供的SNP引物組合可用于對甜瓜品種在種子或幼苗期進行早期鑒定，保證品種的真實性，切實保護生產者和育種家的權益，并為甜瓜種質資源和新品種保護提供技術支持。本發(fā)明提供的方法既可以對未知甜瓜品種進行鑒定，也可以對已知品種的真實性進行鑒定。本發(fā)明提供的方法具有高通量、準確、低成本、操作簡單、節(jié)約人力、物力等有點，具有十分廣闊的應用前景。

技術領域

本發(fā)明屬于生物技術領域，具體涉及一種鑒定甜瓜品種真實性的方法及其專用引物組合。

背景技術

甜瓜是我國重要的蔬菜作物，栽培面積已達50.1萬公頃，占全國蔬菜栽培面積的2.2％。我國的甜瓜收獲面積占世界總收獲面積的45％以上，產量約占世界總產量的50％。甜瓜產業(yè)的發(fā)展為實現(xiàn)農民增收和提高居民的生活水平發(fā)揮了重要作用。依據(jù)《非主要農作物品種登記辦法》，2017年4月農業(yè)部公布了第一批非主要農作物品種登記目錄，甜瓜位列其中。目前，全國通過鑒定、認定、登記的品種達500多個，但是市場上的甜瓜品種數(shù)量遠遠超過這一數(shù)字。由于各省市之間品種審定相互不協(xié)調，甜瓜的品種管理未能有效跟進。甜瓜育種企業(yè)較小且分散，存在較多假冒偽劣品種，其中多為衍生、派生近似品種。加之良種生產基地管理不嚴，盜育、套購品種、同名異種現(xiàn)象現(xiàn)象嚴重，種子生產質量事故時有發(fā)生。根據(jù)《非主要農作物品種登記指南》的要求，品種特性說明和品種DUS測試報告中涉及的有關性狀如有明確關聯(lián)基因，可以直接提交DNA檢測結果。因此，建立一套基于DNA指紋有效進行甜瓜品種資源真實性和純度鑒定的標準顯得尤為重要。

近年來，SNP作為第三代分子標記，以其數(shù)量多、分布廣、遺傳穩(wěn)定等優(yōu)點受到廣泛重視。隨著高通量測序技術的發(fā)展和測序成本的降低，獲得了大量甜瓜重測序數(shù)據(jù)。基于分析甜瓜變異組信息，可以挖掘更加可靠高效的SNP位點。采用等位基因競爭性特異PCR法，并設計其特異引物，最終獲得樣本在SNP位點的基因型。

目前，我國還沒有專用于甜瓜品種鑒定的DNA分子標記方法。目前，其它作物多采用SSR分子標記。但是SSR檢測方式極易導致不真實、假陽性、假陰性結果；不能適應自動化、高通量、大規(guī)模的要求。與SSR標記相比，SNP具有多個方面的優(yōu)勢：變異清晰穩(wěn)定容易檢測，真實性準確性高；每個作物均有數(shù)以百萬計SNP可供選擇；適宜于高通量、低成本、自動化快速檢測；SNP分型無需對照品種，以準確的堿基呈現(xiàn)結果，可減少人為誤差。

發(fā)明內容

本發(fā)明的目的是鑒定甜瓜品種。