[發(fā)明專利]用于基于微滴的單細胞條形編碼的方法和系統(tǒng)

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201880008233.2
• 申請日: 2018-01-30
• 公開（公告）號: CN110214186A
• 公開（公告）日: 2019-09-06
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 卡米拉·貝爾霍欽;拉吉夫·巴拉德瓦杰;克里斯多佛·辛德森;邁克爾·史諾-萊文;比爾·林;安東尼·馬卡若維茨;普拉納夫·帕特爾;凱瑟琳·法伊弗;安德魯·D·普萊斯;穆罕默德·拉希米倫吉;托拜厄斯·丹尼爾·惠勒;尹沂峰
• 申請（專利權(quán)）人: 10X基因組學(xué)有限公司
• 主分類號: C12N15/09
• 分類號: C12N15/09;C12Q1/6806
• 代理公司: 北京安信方達知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11262
• 代理人: 賀淑東

1.一種用于加工或分析來自細胞的一種或多種組分的方法，所述方法包括：

(a)提供多個細胞珠粒和多個條形碼珠粒，其中(i)所述多個細胞珠粒的細胞珠粒包含所述細胞的所述一種或多種組分，所述一種或多種組分包含核酸分子，并且(ii)所述多個條形碼珠粒的條形碼珠粒包含多個核酸條形碼分子以用于對所述核酸分子進行條形編碼；以及

(b)將所述多個細胞珠粒和所述多個條形碼珠粒分配到多個分區(qū)中，其中在分配后，所述多個分區(qū)的分區(qū)包含所述細胞珠粒和所述條形碼珠粒。

2.如權(quán)利要求1所述的方法，其還包括對所述核酸分子進行一種或多種反應(yīng)。

3.如權(quán)利要求2所述的方法，其中所述一種或多種反應(yīng)包括核酸修飾、核酸擴增、核酸插入、核酸裂解、逆轉(zhuǎn)錄或其任何組合。

4.如權(quán)利要求3所述的方法，其中所述核酸修飾包括連接、消化、甲基化、隨機誘變、亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化、尿嘧啶水解、核酸修復(fù)、加帽、脫帽或其任何組合。

5.如權(quán)利要求3所述的方法，其中所述核酸擴增包括等溫擴增或聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。

6.如權(quán)利要求3所述的方法，其中所述核酸插入包括轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的插入、CRISPR/Cas9介導(dǎo)的插入或其任何組合。

7.如權(quán)利要求3所述的方法，其中所述核酸裂解包括轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的裂解、CRISPR/Cas9介導(dǎo)的裂解或其任何組合。

8.如權(quán)利要求2所述的方法，其中所述一種或多種反應(yīng)在所述分區(qū)中進行。

9.如權(quán)利要求2所述的方法，其中所述一種或多種反應(yīng)在所述分區(qū)外進行。

10.如權(quán)利要求2所述的方法，其中所述一種或多種反應(yīng)在(a)之前進行。

11.如權(quán)利要求2所述的方法，其中所述一種或多種反應(yīng)在(a)之后進行。

12.如權(quán)利要求1所述的方法，其還包括使用所述多個核酸條形碼分子來由所述核酸分子產(chǎn)生帶條形碼的核酸分子。

13.如權(quán)利要求12所述的方法，其中產(chǎn)生所述帶條形碼的核酸分子包括核酸擴增。

14.如權(quán)利要求12所述的方法，其中產(chǎn)生所述帶條形碼的核酸分子包括連接。

15.如權(quán)利要求12所述的方法，其還包括從所述分區(qū)釋放所述帶條形碼的核酸分子或其衍生物。

16.如權(quán)利要求12-15中任一項所述的方法，其還包括對所述帶條形碼的核酸分子或其衍生物進行測序。

17.如權(quán)利要求16所述的方法，其還包括在所述測序之前，使所述帶條形碼的核酸分子或其衍生物進行核酸擴增。

18.如權(quán)利要求17所述的方法，其中所述核酸擴增是等溫擴增或聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。

19.如權(quán)利要求18所述的方法，其中所述聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。

20.如權(quán)利要求1所述的方法，其中所述細胞珠粒包含所述細胞，并且使包含所述細胞的所述細胞珠粒經(jīng)受足以裂解所述細胞以產(chǎn)生所述一種或多種組分的條件。

21.如權(quán)利要求20所述的方法，其中使所述細胞珠粒經(jīng)受所述足以裂解所述分區(qū)中的所述細胞的條件。