[發明專利]一種混合庫基因編輯T1代煙株篩選方法

有效

• 申請號: 201811482766.2
• 申請日: 2018-12-05
• 公開（公告）號: CN109406729B
• 公開（公告）日: 2021-03-16
• 發明（設計）人: 李雪梅;高茜;曾婉俐;向海英;楊光宇;米其利;李晶;黃海濤;宋春滿
• 申請（專利權）人: 云南中煙工業有限責任公司
• 主分類號: G01N33/00
• 分類號: G01N33/00;G01N35/00;C12Q1/6869
• 代理公司: 北京市領專知識產權代理有限公司 11590
• 代理人: 陳有業;任文娟

本發明公開了一種混合庫基因編輯T1代煙株篩選方法，包括：(1)使用掌上電腦采集樣品信息并與服務器終端進行無線連接；(2)根據掌上電腦與服務器終端無線連接的結果對煙葉樣品進行管理，實時完成需進行煙葉樣品采集的煙株的篩選、煙葉樣品的采集、簽收、處理、存儲、派樣、檢測、驗余樣品存儲和驗余樣品處置的操作；并將檢測結果反饋給煙株種植人員，從而完成混合庫基因編輯T1代煙株篩選。本發明的方法可以達到對相似的海量的混合庫基因編輯T1代煙株的高效、精準的篩選。

技術領域

本發明涉及計算機軟件領域，具體涉及一種用于基因編輯育種中的高效準確混合庫基因編輯T1代的海量煙株篩選方法。

背景技術

基因編輯育種技術已被廣泛用于各種植物的基因組修飾中，如擬南芥、水稻和煙草等。隨著煙草基因編輯育種工廠的建成和素材創制的快速推進，海量基因編輯素材被創制出來，這些編輯素材在煙株表型篩選上成為關注重點，但相似煙株表型的煙葉化學成分及生理生化指標上具有差異。因此如何對海量的編輯素材進行煙株的高效精準篩選成為一個亟待解決的問題。

由于煙株的篩選涉及煙株選擇、煙葉樣品采集及處理分析反饋等多個步驟，包括需要煙葉樣品采集的煙株選擇、煙株采樣標記、特殊表型記錄、煙葉采集裝袋、煙葉凍存、煙葉冷凍干燥、煙葉磨碎、煙葉粉末存儲、檢測和驗余樣品的處理，最終根據煙葉的檢測結果的反饋對海量的煙草煙株重新篩選等，以上流程的大部分工作通常在遠離電腦端進行，傳統采用人工用記號筆將煙株編碼抄寫至樣品袋或者樣品管上，再逐步將編碼錄入電腦端，這些操作對人員素質要求高，極容易產生各類差錯，嚴重影響樣品管理過程進而影響煙葉編輯素材的高效精確篩選。同時采樣及前處理過程存在較大的隨意性，若不進行統一管理則會給后續的檢測帶來不穩定性。這些都嚴重影響煙草基因編輯育種工廠的建成和素材創制的快速推進。

為解決上述問題，提出本發明。

發明內容

本發明公開了一種混合庫基因編輯T1代煙株篩選方法，本發明的方法可以對煙葉樣品采集的煙株的篩選、煙葉樣品的采集、簽收、處理、存儲、派送、驗余樣品處理進行高效準確便捷的管理，從而完成混合庫基因編輯T1代的海量煙株高效準確篩選。本發明的技術方案如下：

本發明公開了一種混合庫基因編輯T1代煙株篩選方法，其特征在于，包括：

(1)使用掌上電腦采集樣品信息并與服務器終端進行無線連接；

(2)根據掌上電腦與服務器終端無線連接的結果對煙葉樣品進行管理，實時完成需進行煙葉樣品采集的煙株的篩選、煙葉樣品的采集、簽收、處理、存儲、派樣、檢測、驗余樣品存儲和驗余樣品處置的操作；并將檢測結果反饋給煙株種植人員，從而完成混合庫基因編輯T1代煙株篩選。

優選地，所述步驟(2)，其包括：

(21)對基因編輯后的煙株T0代種子進行點種和編碼，在并在苗期進行DNA測序，將煙株的DNA測序結果及對應的煙株編碼上傳至服務器終端；所述T0代種子為基因編輯再生苗煙株的種子，所述T1代煙株為T0代種子種出來的苗煙株；

(22)觀察哪些煙株已經達到現蕾期，使用掌上電腦對現蕾期煙株編碼進行掃描，根據煙株編碼對應的DNA測序結果和是否為首次采集對煙株進行篩選是否進行煙葉采集，從而完成煙株的篩選操作；

(23)采集煙葉樣品裝入樣品袋中并封口，通過藍牙連接便攜式打印機進行樣品編碼并打印，將打印后的樣品編碼貼在樣品袋上并上傳至服務器終端，從而完成煙葉樣品采集的操作；

(24)煙葉樣品處理部門對采集的煙葉樣品進行處理，然后存儲在編碼對應的固定位置，并采用掌上電腦掃描樣品編碼將存儲位置上傳至服務器終端，從而完成煙葉樣品處理和存儲操作；

(25)煙葉樣品派送部門將存儲的煙葉樣品派送給相應的檢測人員并上傳至服務器終端，從而完成煙葉樣品派送操作；