[發明專利]瓢雞無尾基因及檢測瓢雞無尾性狀的方法、引物、試劑盒

在審

• 申請號: 201811333356.1
• 申請日: 2018-11-09
• 公開（公告）號: CN109295052A
• 公開（公告）日: 2019-02-01
• 發明（設計）人: 史憲偉;王欣;陳多珍;李楊;楊向東;羅袁山
• 申請（專利權）人: 云南農業大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6888
• 代理公司: 北京眾合誠成知識產權代理有限公司 11246
• 代理人: 苗艷榮

1.一種瓢雞無尾基因，其特征在于，所述瓢雞無尾基因及其位置克隆為IRX1；所述IRX1的基因檢測標記，其為Mbo II標記和Ava II標記，其中Mbo II標記為SEQ ID No.1所示序列5’端起2540位SNP的G或A；Ava II標記為SEQ ID No.1所示序列5’端起4524位SNP的C或A。

2.一種應用權利要求1所述瓢雞無尾基因的檢測瓢雞無尾性狀的方法，其特征在于，所述檢測瓢雞無尾性狀的方法通過檢測IRX1基因的Mbo II標記和Ava II標記，確定瓢雞的無尾和有尾性狀。

3.如權利要求2所述的檢測瓢雞無尾性狀的方法，其特征在于，所述檢測瓢雞無尾性狀的方法具體包括：Mbo II標記的GG基因型與GA基因型為無尾性狀，AA基因型為有尾性狀。MboⅡ檢測標記的GG基因型為500bp一個片段，AA基因型為252bp、248bp的2個片段，GA基因型為500bp、250bp、248bp的3個片段；Ava II標記的AA基因型與AC基因型為無尾性狀，CC基因型為有尾性狀。AvaⅡ檢測標記的AA基因型為639bp、177bp 2個片段，CC基因型為318bp、321bp和177bp的3個片段，CA基因型為639bp、318bp、321bp和177bp的4個片段。

4.如權利要求3所述的檢測瓢雞無尾性狀的方法，其特征在于，Hap5和Hap8是無尾雞性狀特有單倍型，Hap3、Hap4、Hap7、Hap9是有尾性狀特有單倍型，Hap1是無尾性狀優勢單倍型，Hap2是有尾性狀優勢單倍型。其中，Hap1的SNP組合為CTACAGCCC，Hap2的SNP組合為CTGCAGCAC，Hap3的SNP組合為CTGCCGCAC，Hap4的SNP組合為CGGCCGCAC，Hap5的SNP組合為CGGTAGAAC，Hap7的SNP組合為CGGTCGCAA，Hap8的SNP組合為CGGTCAAAA，Hap9的SNP組合為CGGTCACAA。

5.一種鑒定權利要求1所述的IRX1基因檢測標記的引物和檢測標記，其特征在于，所述引物的核苷酸為SEQ ID No.2～7；IRX1基因檢測標記Mbo II的識別堿基為SEQ ID No.8，IRX1基因檢測標記Ava II的識別堿基為SEQ ID No.9。

6.一種包含權利要求5所述引物和檢測標記的試劑盒。

7.一種如權利要求1所述IRX1的基因檢測標記的雞選育方法。