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[發明專利]一種用于區別肝癌和非肝癌的腸道微生物基因標志物及其應用在審

專利信息
申請號: 201811297644.6 申請日: 2018-11-01
公開(公告)號: CN109371147A 公開(公告)日: 2019-02-22
發明(設計)人: 任志剛;李昂 申請(專利權)人: 任志剛;李昂
主分類號: C12Q1/689 分類號: C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 杭州中成專利事務所有限公司 33212 代理人: 朱瑩瑩
地址: 450052 河*** 國省代碼: 河南;41
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摘要:
搜索關鍵詞: 非肝癌 肝癌 腸道微生物 基因標志物 微生物基因 生物醫藥技術 微生物基因組 區別能力 人體腸道 普適性 富集 應用 驗證 地域
【說明書】:

發明屬于生物醫藥技術領域,具體涉及一種區別肝癌和非肝癌的腸道微生物基因標志物及其應用。本發明提供了一種用于區別肝癌和非肝癌的腸道微生物基因標志物,由SEQ ID NO:1?30所示的30種微生物基因組成,所述微生物基因在人體腸道中富集。本發明的微生物基因區別模型在肝癌和非肝癌患者中實現了良好的區別能力,也驗證了該區別模型在中國不同地域中的可行性、適用性和普適性。

技術領域

本發明屬于生物醫藥技術領域,具體涉及一種區別肝癌和非肝癌的腸道微生物基因標志物及其應用。

背景技術

肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)在全球惡性腫瘤中發病率位居第六,死亡率位居第二。我國是肝癌大國,也是全球肝癌發病率最高的國家,在常見腫瘤中僅次于肺癌,居第二位。由于乙肝病毒和丙肝病毒的持續感染及其引起的肝硬化的流行,我國肝癌的發病情況嚴重。目前肝癌發病人數占全球的55%,而死亡人數約占全世界肝癌死亡人數的45%,對我國人民健康構成嚴重威脅。由于肝癌起病隱匿,早期診斷困難,大多數患者在確診時已達肝癌晚期,預后極差。即便是手術切除后也易復發,缺乏有效的治療藥物和手段。因此,建立區別肝癌和非肝癌的診斷模型,實現肝癌的早期診斷,對于肝癌的早期發現、早期診斷和早期治療具有重大意義。

人體腸道微生態系統與健康和疾病密切相關。人體腸道內定植著數目龐大(1014)、結構復雜(超過1000種細菌)的微生物群落(約1.5公斤)。其細胞總量幾乎是人體自身細胞數量的10倍,基因總量是人類自身基因的150倍。腸道菌群和宿主共生并共進化過程中,在調節宿主的消化吸收、免疫反應、代謝等方面發揮重要作用。腸道微生態失調促進慢性疾病的發生發展,包括肝硬化、肝細胞肝癌、胰腺癌和結直腸癌等。

腸道微生物中關健功能菌可成為人類疾病的新型生物標志物。腸道微生態的特征或者基于腸道微生物建立的區別模型作為特定疾病或腫瘤的區分工具正越來越多被廣泛報道和認可。腸道菌群的“腸型(Enterotypes)”可反映人對疾病的易感性,提示腸道菌群具有潛在的預警和診斷作用。Qin J等率先使用宏基因組學報道了腸道微生態與2型糖尿病的相關性,指出23個菌種可能成為區分2型糖尿病的腸道微生物標志物。Qin N,Li A等(2014年Nature雜志)通過宏基因組測序技術解析了中國人群肝硬化患者腸道微生態結構,在微生物基因和功能水平上,鑒定了肝硬化特異性的15個標記物,創建了一個高準確度的肝硬化患者區分指數。Ren Z等指出,腸道微生態對肝移植急性排斥反應更為敏感,腸道微生態變化可用來預測肝移植后早期急性排斥反應,也可成為肝移植后改善急性排斥損傷的輔助性靶標。Wang Z等(Nature,2011)指出依賴于腸道微生態的卵磷脂代謝促進了心血管疾病的進展,這一發現為心血管疾病新型的診斷方法和治療策略提供了理論基礎。Oh PL等(AJT,2012)發現腸道微生態的變化與小腸移植排斥緊密相關,可成為一個潛在的移植排斥的診斷標記物。Yu J等在不同民族患者中揭示并驗證了結直腸癌的微生物標志物,指出微生物標志物作為一種可支付的、無創的結直腸癌的早期診斷標志物。因而,腸道微生物可能是不同疾病診斷的有力工具。然而,用于區別肝癌和非肝癌的腸道微生物模型還未曾報道過。

發明內容

本發明提供了一種用于區別肝癌和非肝癌的腸道微生物基因標志物,由SEQ IDNO:1-30所示的30種微生物基因組成,所述微生物基因在人體腸道中富集。

另外本發明還提供了一種用于檢測試劑,包括用于檢測SEQ ID NO:1-30所示的30種微生物基因的引物,序列如下:

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