[發(fā)明專利]一種用于輔助檢測小麥高單穗小穗數(shù)性狀的標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201811259162.1
• 申請(qǐng)日: 2018-10-26
• 公開（公告）號(hào): CN109811074B
• 公開（公告）日: 2022-08-09
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 龍海;李濤;鄧光兵;張海莉;梁俊俊;余懋群
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國科學(xué)院成都生物研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 成都瑞創(chuàng)華盛知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 51270
• 代理人: 鄧瑞;辜強(qiáng)

本發(fā)明的目的在于提供一種用于輔助檢測小麥高單穗小穗數(shù)性狀的標(biāo)記及其應(yīng)用，該SNP標(biāo)記位于六倍體普通小麥基因組的3D染色體上第553937825位核苷酸，該SNP標(biāo)記在高單穗小穗數(shù)小麥材料中堿基為G，在低穗粒數(shù)材料中堿基為A。本發(fā)明的有益效果是該標(biāo)記為共線性標(biāo)記，通過酶切帶型可準(zhǔn)確進(jìn)行分型；通過對(duì)164個(gè)個(gè)體進(jìn)行分型檢測，準(zhǔn)確率到達(dá)85％。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于小麥遺傳育種技術(shù)領(lǐng)域，涉及一種用于輔助檢測小麥高單穗小穗數(shù)性狀的SNP（Single Nucleotide Polymorphism)標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

小麥屬于禾本科(Gramineae)，小麥族(Triticeae)，小麥屬(Triticum)，是世界上最重要和栽培范圍最廣的糧食作物之一，為全世界約35%的人口提供了重要的能量攝入及蛋白質(zhì)來源。然而隨著人口增長，氣候變化、可用耕地的減少，糧食危機(jī)正在變的越來越嚴(yán)重，因此小麥的高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)始終是世界各國的研究重點(diǎn)。單位面積穗數(shù)，單穗粒數(shù)，千粒重是小麥產(chǎn)量構(gòu)成的三大要素。因此，穗粒數(shù)高低與小麥產(chǎn)量關(guān)系密切，也是小麥品種遺傳改良的主要目標(biāo)之一。穗粒數(shù)是由單穗小穗數(shù)和平均小穗粒數(shù)共同決定。高單穗小穗數(shù)的小麥材料具有更好的籽粒產(chǎn)量潛力，因此是高產(chǎn)小麥品種選育過程中重點(diǎn)關(guān)注的性狀。然而，與許多產(chǎn)量相關(guān)性狀一樣，單穗小穗數(shù)往往受多基因控制，并且受到各種環(huán)境條件影響。因此，使用傳統(tǒng)育種方法進(jìn)行選擇往往工作量大，效率低下。

隨著高通量測序技術(shù)、基因芯片檢測技術(shù)的發(fā)展，以及隨之而來的小麥基因組學(xué)方面的重大突破，為數(shù)量性狀位點(diǎn)的精細(xì)解析和分子標(biāo)記的開發(fā)提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)，也為基于分子標(biāo)記輔助選擇進(jìn)行小麥遺傳改良提供了可能。在本研究中，我們利用自主選育的具有高單穗小穗數(shù)的小麥品種K1（兩年三個(gè)環(huán)境平均單穗小穗數(shù)為24.8）與較低穗粒數(shù)高千粒重品種CM42(兩年三個(gè)環(huán)境平均單穗小穗數(shù)為21.9)進(jìn)行雜交，構(gòu)建了DH群體。利用QTL定位和集群分離法（BSA)在3D染色體上定位到一個(gè)來源于K1且控制高單穗小穗數(shù)的基因位點(diǎn)。目前尚未在該區(qū)段發(fā)現(xiàn)已知的高單穗小穗數(shù)基因位點(diǎn)報(bào)道，因此其可能是一個(gè)新的基因位點(diǎn)。我們進(jìn)一步將所獲得的連鎖的SNP位點(diǎn)轉(zhuǎn)化為基于酶切位點(diǎn)識(shí)別的CAPS標(biāo)記對(duì)具有164個(gè)DH家系進(jìn)行篩選，獲得一個(gè)與高單穗小穗數(shù)緊密連鎖的分子標(biāo)記。因此，該標(biāo)記在分子標(biāo)記輔助選擇中具有重要的應(yīng)用前景。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于提供一種用于輔助檢測小麥高單穗小穗數(shù)性狀的標(biāo)記及其應(yīng)用，解決了目前采用常規(guī)育種方法工作量大、周期長、效率低、穩(wěn)定性差等問題。

發(fā)明的方案之一是提供了一種與小麥高單穗小穗數(shù)性狀相關(guān)的SNP標(biāo)記，該SNP標(biāo)記位于六倍體普通小麥（Triticum aestivum L.) 基因組的3D染色體上第553937825位核苷酸，其側(cè)翼序列如SEQ ID NO.1：

SEQ ID NO.1：