[發明專利]染色體1p/19q雜合性缺失的檢測方法、試劑盒及引物組有效
| 申請號： | 201810842077.1 | 申請日： | 2018-07-27 |
| 公開（公告）號： | CN109022579B | 公開（公告）日： | 2020-07-28 |
| 發明（設計）人： | 呂紅;曹藝馨;石宇鵬;宋超;余榮;洪軻;任用 | 申請（專利權）人： | 北京先聲醫學檢驗實驗室有限公司;江蘇先聲醫學診斷有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6886 | 分類號： | C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京中企訊專利代理事務所(普通合伙) 11677 | 代理人： | 熊亮 |
| 地址： | 100094 北京市海淀*** | 國省代碼： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 染色體 19 雜合性 缺失 檢測 方法 試劑盒 引物 | ||
1. 一種染色體1p/19q雜合性缺失的檢測方法，所述方法為非疾病的診斷治療方法，基于MassArray質譜平臺進行，其特征在于，通過檢測1號染色體短臂1p的第一區域及具有19號染色體長臂19q的第二區域的SNP位點完成；所述檢測針對1號染色體短臂1p的23個有效位點：rs2038366，rs59317557，rs3737577，rs10875362，rs2031958，rs859104，rs933032，rs2455638，rs212961，rs79887225，rs586057，rs624971，rs16866144，rs1329113，rs11247639，rs4970520，rs2473287，rs7512426，rs809972，rs797257，rs4908744，rs6426368，rs9426469，針對19號染色體長臂19q的12個有效位點：rs67421541，rs12611404，rs10407280，rs4803502，rs1674139，rs6070，rs1807277，rs1457093，rs8108384，rs11666952，rs36624，rs437229；其中rs933032，rs4970520，rs1329113，rs586057，rs624971，rs2038366，rs8108384，rs6426368，rs1457093，rs7512426，rs67421541，rs36624，rs79887225為第一組， rs797257，rs2031958，rs16866144，rs10407280，rs12611404，rs10875362，rs212961，rs437229，rs2473287，rs1674139，rs859104，rs11666952，rs11247639，rs4908744，rs9426469，rs4803502為第二組，rs3737577，rs6070，rs809972，rs1807277，rs2455638，rs59317557為第三組；上述有效位點的PCR上游引物序列分別如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.35所示；下游引物序列分別如SEQ IDNO.36至SEQ ID NO.70所示；單堿基延伸引物序列分別如SEQ ID NO.71至SEQ ID NO.105所示。
2.一種用于腦膠質瘤檢測的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包括檢測染色體1p/19q的雜合性缺失的針對1號染色體短臂1p的SNP位點 rs2038366，rs59317557，rs3737577，rs10875362，rs2031958，rs859104，rs933032，rs2455638，rs212961，rs79887225，rs586057，rs624971，rs16866144，rs1329113，rs11247639，rs4970520，rs2473287，rs7512426，rs809972，rs797257，rs4908744，rs6426368和rs9426469的擴增引物和單堿基延伸引物；以及針對19號染色體長臂19q的12個有效位點：rs67421541，rs12611404，rs10407280，rs4803502，rs1674139，rs6070，rs1807277，rs1457093，rs8108384，rs11666952，rs36624和rs437229的擴增引物和單堿基單堿基延伸引物；所述擴增引物包括PCR上游引物及PCR下游引物，其中，所述PCR上游引物序列分別如SEQ ID NO.1至SEQ IDNO.35所示；所述PCR下游引物序列分別如SEQ ID NO.36至SEQ ID NO.70所示；所述單堿基延伸引物序列分別如SEQ ID NO.71至SEQ ID NO.105所示。
3.一種引物組，其特征在于，包括擴增引物和單堿基延伸引物，所述擴增引物包括PCR上游引物及PCR下游引物，所述PCR上游引物序列分別如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.35所示；所述PCR下游引物序列分別如SEQ ID NO.36至SEQ ID NO.70；所述單堿基延伸引物序列分別如SEQ ID NO.71至SEQ ID NO.105所示。
4.權利要求3所述的引物組在用于制備檢測腦膠質瘤的試劑盒中的應用。
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