[發(fā)明專利]用于定量檢測EB病毒核酸的數字PCR試劑盒及檢測方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810737842.3 | 申請日: | 2018-07-06 |
| 公開(公告)號: | CN110684863A | 公開(公告)日: | 2020-01-14 |
| 發(fā)明(設計)人: | 嚴曉鋒;劉鳳麟;熊慧 | 申請(專利權)人: | 蘇州云泰生物醫(yī)藥科技有限公司;武漢百泰基因工程有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 11390 北京和信華成知識產權代理事務所(普通合伙) | 代理人: | 胡劍輝 |
| 地址: | 215130 江蘇省蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 數字PCR 探針 試劑盒 核酸 病毒核酸檢測 檢測EB病毒 定量檢測 發(fā)明試劑 反向引物 核酸分子 兩端標記 效率差異 熒光基團 正向引物 靈敏性 質控品 檢測 引物 標準化 | ||
本發(fā)明屬于病毒核酸檢測領域,具體涉及一種用于定量檢測EB病毒核酸的數字PCR試劑盒及檢測方法。本發(fā)明試劑盒含有數字PCR反應液和質控品;數字PCR反應液中含有用于檢測EB病毒核酸的引物和探針,包括由SEQ ID NO:1所示的正向引物、由SEQ ID NO:2所示的反向引物、由SEQ ID NO:3所示的探針;探針的兩端標記有熒光基團。本發(fā)明的試劑盒及檢測方法可實現對核酸分子的絕對定量,從而避免了由PCR擴增效率差異所導致的偏差,具有更高的精確度、靈敏性和重復性,易于標準化。
技術領域
本發(fā)明屬于病毒核酸檢測領域,具體涉及一種用于定量檢測EB病毒核酸的數字PCR試劑盒及檢測方法。
背景技術
人類是EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)惟一天然宿主,EB病毒的全世界人感染率超過90%。原發(fā)感染通常發(fā)生在幼年時期,并且無癥狀,表現為隱性感染;但如果感染發(fā)生在青少年或成年,則可能導致感染性單核細胞增多癥。據報道,我國95%以上人群在3~5歲時已感染了EBV。原發(fā)感染后,病毒可以長期持續(xù)性存在,呈潛伏感染狀態(tài),在大多數病例中無癥狀。EB病毒主要經唾液傳播,但也有報道經血液和性活動傳播。EB病毒感染細胞有兩種形式:即潛伏性感染和增殖性感染。在潛伏性感染中,病毒以環(huán)狀游離體和/或整合型形式存在。在一定條件下,如免疫功能低下或某些物理化學因素的作用(紫外線、丁酸、巴豆油及尿嘧啶等),EB病毒可以從潛伏狀態(tài)變?yōu)樵鲋碃顟B(tài)。
我國是鼻咽癌的高發(fā)國家,其發(fā)病率占頭頸部腫瘤的首位。已有大量的實驗研究表明,EB病毒與鼻咽癌關聯(lián)密切,放療前血漿EBVDNA檢測對NPC的臨床分期和判斷預后有重要的臨床意義,放療結束時血漿EBV DNA檢測對殘留病灶和總生存判斷同樣具有重要意義,并對放療后腫瘤轉移復發(fā)有監(jiān)測作用。傳統(tǒng)的EB病毒相關抗體的檢測是診斷及監(jiān)測患者病情最常用的方法,但是它的敏感性和特異性較差。目前的熒光定量PCR對原有核酸只能進行相對定量,需要依靠標準曲線或參照基因來測定核酸量,且對病毒是否為陽性的檢測存在不確定的檢測結果,導致多次檢測,或者檢測結果不準確。ddPCR技術的引入為直接和真實地反映患者體內病毒復制水平,為我們在腫瘤的診斷、治療和判斷預后方面提供了一種新的非侵入性手段。
數字PCR技術是近年興起的第三代PCR絕對定量技術,與實時熒光定量PCR技術相比,數字PCR不依賴于擴增曲線的閾值(CT)進行定量,不受擴增效率的影響,也不必采用標準曲線,具有很好的準確度和重現性,可以實現絕對定量分析。在現階段的低豐度因子檢測中,實時熒光定量PCR技術都因受到背景DNA或雜質的干擾,使得檢測靈敏度及精確性都達不到精準定量的要求,而數字PCR檢測系統(tǒng)通過微滴化處理,使得稀有檢測片段從大量的復雜背景中分離出來,從而提高檢測的靈敏度和精確性。
鑒于此,特提出本發(fā)明。
發(fā)明內容
本發(fā)明的發(fā)明目的在于提出一種用于定量檢測EB病毒核酸的數字PCR試劑盒及檢測方法。
本發(fā)明的又一發(fā)明目的在于提出一種采用數字PCR檢測EB病毒核酸的引物和探針。
為了完成本發(fā)明的目的,采用的技術方案為:
本發(fā)明涉及一種用于定量檢測EB病毒核酸的數字PCR試劑盒,所述試劑盒含有數字PCR反應液和質控品;所述數字PCR反應液中含有用于檢測EB病毒核酸的引物和探針,所述用于檢測EB病毒核酸的引物和探針包括由SEQ ID NO:1所示的正向引物、由SEQ ID NO:2所示的反向引物、由SEQ ID NO:3所示的探針;所述探針的兩端標記有熒光基團。
可選的,SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的5’端標記有FAM、3’端標記有BHQ。
可選的,所述數字PCR反應液中還含有數字PCR緩沖液。
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