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[發(fā)明專利]一種人HLA-B*5801基因型的試劑盒及方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 201810431020.2 申請日: 2018-05-08
公開(公告)號: CN108531599A 公開(公告)日: 2018-09-14
發(fā)明(設(shè)計)人: 倪曉龍;李亞波;李春鳳;歐陽云 申請(專利權(quán))人: 杭州泰領(lǐng)生物技術(shù)有限公司
主分類號: C12Q1/6886 分類號: C12Q1/6886
代理公司: 杭州千克知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 33246 代理人: 冷紅梅
地址: 310051 浙江省杭*** 國省代碼: 浙江;33
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 試劑盒 通用熒光探針 連接反應 基因型 檢測 單核苷酸多態(tài)性位點 鏈式反應 基因型檢測 耐熱連接酶 反應控制 反應終止 聚合反應 快速檢測 連接探針 酶混合液 匹配連接 通用引物 陽性對照 一步聚合 陰性對照 核苷酸 混合液 敏感度 人HLA 探針 匹配
【說明書】:

發(fā)明提供一種快速檢測人HLA?B*5801基因型的試劑盒及檢測方法,所述試劑盒主要包括:通用引物、通用熒光探針和連接探針,以及連接反應及聚合反應混合液,酶混合液,陰性對照和陽性對照,本發(fā)明特點為通過一種新型的耐熱連接酶反應控制單核苷酸多態(tài)性位點的特異性,只有匹配連接探針的核苷酸才能完成連接反應,并啟動下一步聚合酶鏈式反應,并可通過通用熒光探針檢測到HLA?B*5801基因型,如果不匹配,則無法完成連接,反應終止,所有的檢測過程可在同一個反應體系中完成,相對傳統(tǒng)方法對于HLA?B*5801基因型檢測具有更好的特異性和敏感度。

(一)技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及一種快速檢測人HLA-B*5801基因的PCR的試劑盒,以及檢測人HLA-B*5801基因的方法,屬基因診斷領(lǐng)域。

(二)背景技術(shù)

別嘌呤醇是一種次黃嘌呤氧化酶抑制劑,能夠減少尿酸合成并降低血中尿酸濃度,是治療痛風的首選藥物。臨床用于治療:高尿酸血癥;慢性痛風患者;痛風石尿酸性腎結(jié)石或尿酸性腎病。但該藥易引起嚴重的皮膚不良反應,包括較輕微的藥疹,及嚴重的剝落性皮炎、中毒性表皮壞死松解癥等,有較高的致死率。

人類白細胞抗原(HLA)是1組位于第6號染色體上的基因,是迄今已知基因中等位基因多態(tài)性最高的基因復合體,是人類最復雜的遺傳多態(tài)系統(tǒng),其分布存在明顯的種群特性。1989年,Chan等首次報道了HLA與別嘌呤醇引起不良反應相關(guān)性的研究,結(jié)果顯示中國南方人群中,A*33和B*58為此類不良反應的高風險因素。2005年,Hung等進一步發(fā)現(xiàn)別嘌呤醇引起嚴重皮膚不良反應的患者中全部攜帶B*5801位點,而在未出現(xiàn)不良反應的患者中其攜帶率僅10%。由于中國漢族人、泰國人、韓國人的HLA-B*5801基因陽性率遠高于白人(高達15%),因此以上人種使用別嘌呤醇藥物前需檢測HLA-B*5801基因是否攜帶,避免患者誤用別嘌呤醇而誘發(fā)嚴重副反應的風險。

目前用于HLA-B*5801基因檢測的方法主要有以下幾種:

(1)PCR-SBT法:即直接測序法;其可直接獲得DNA序列,鑒定所有存在的多態(tài)性,為最直接、最直觀的方法;但是,由于目的基因序列的特殊性、引物設(shè)計等多種因素,測序結(jié)果會出現(xiàn)套峰,不利于結(jié)果的判讀,使得PCR-SBT法存在著模棱兩可的結(jié)果,必要時需要人工判讀堿基序列(Adams Et Al.,2004),且測序技術(shù)需要用到造價昂貴的測序儀,醫(yī)院內(nèi)通常不會配備;

(2)PCR-SSP法:即序列特異性引物法;其根據(jù)各等位基因的核苷酸序列,設(shè)計出一套針對每一等位基因特異性的或組特異性的引物,此即為序列特異性引物;所述SSP只能與某一等位基因特異性片段的堿基序列互補性結(jié)合,通過PCR特異性地擴增該基因片段,從而達到分析基因多態(tài)性的目的;所述PCR-SSP法也是臨床上使用最普及的方法。但此種方法操作復雜,耗時較長,且易發(fā)生污染,每批次操作差異較大,無法進行穩(wěn)定快速的批量化操作。

(三)發(fā)明內(nèi)容

針對上述問題,本發(fā)明提供了一種快速檢測人HLA-B*5801基因型的試劑盒及方法。

本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:

一種人HLA-B*5801基因型的試劑盒,所述試劑盒由通用引物、通用熒光探針和連接探針,以及連接反應及聚合反應試劑(酶buffer、dNTP等),酶混合液,陰性對照和陽性對照組成;

所述通用引物序列如下:

上游引物:5’-GACTCCAATCGAGCATGCAAAC-3’

下游引物:5’-TTCGGAACTATTGTCATGGTCCAA-3’

通用熒光探針序列如下:

5’-FAM-CTGCTGGACCCAGCACCGTACCA-BHQ1-3’;

連接探針1序列如下:

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