[發(fā)明專利]一種準確簡便鑒定沼澤山雀性別的引物及鑒定方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201810288034.3 | 申請日: | 2018-04-03 |
| 公開(公告)號: | CN108315443A | 公開(公告)日: | 2018-07-24 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 萬冬梅;張雷;王娟;張海旺;王偉榮;崇凌志;韓梅 | 申請(專利權(quán))人: | 遼寧大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12Q1/6879;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 沈陽杰克知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 21207 | 代理人: | 金春華 |
| 地址: | 110000 遼寧*** | 國省代碼: | 遼寧;21 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 沼澤 引物 基因組總DNA 擴增產(chǎn)物 條帶 瓊脂糖凝膠電泳檢測 分子生物學(xué)領(lǐng)域 凝膠成像儀 帶型判斷 可重復(fù)性 特異序列 儀器要求 帶型 擴增 拍照 記錄 | ||
本發(fā)明涉及一種準確簡便鑒定沼澤山雀性別的引物及鑒定方法。提取沼澤山雀的基因組總DNA;2)以基因組總DNA為模板,利用引物2550F和RevP1進行PCR擴增反應(yīng),獲得擴增產(chǎn)物;將獲得擴增產(chǎn)物進行2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,用Dolphin?Doc凝膠成像儀進行拍照記錄,根據(jù)帶型判斷沼澤山雀的性別:雌性為兩條帶長度分別為447bp和635bp,雄性為一條帶長度為447bp。本發(fā)明利用對CHD基因在W,Z染色體上的特異序列的擴增所產(chǎn)生的不同帶型來判斷沼澤山雀的性別,無需特殊儀器要求,鑒定方法簡便易行,快速準確,可重復(fù)性強,為今后對沼澤山雀分子生物學(xué)領(lǐng)域進一步深入探究奠定了基礎(chǔ)。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種準確簡便的鑒定沼澤山雀性別的方法,屬于分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù)
性別是鳥類最重要的特征之一,雌雄個體的鳥類往往在生理,行為等方面具有差別。鳥類的性別鑒定,特別是性別的早期鑒定對鳥類的遺傳疾病防治,種群結(jié)構(gòu)和群體遺傳學(xué)分析等有著非常重要的意義。全世界約有50%的鳥類為雌雄同型鳥,很難通過外部特征進行性別鑒定。通過外科手術(shù)(剖腹和鏡檢)直接觀察生殖腺進行鑒定,不適用于體積較小的鳥類,而且均會對鳥類造成傷害甚至導(dǎo)致不育。細胞水平的性別鑒定主要是對W染色體進行觀察,雌性的性染色體一條大(Z),一條小(W),而雄性個體為兩條較大的(Z)染色體,但是在實際應(yīng)用中存在一定的困難,鳥類的染色體數(shù)量大,而且對染色體的大小劃分容易造成人為差異。
沼澤山雀是一種單態(tài)性鳥,無論在幼鳥還是成鳥時期,都很難從外觀形態(tài)或其他行為上區(qū)分雌雄。因此,開發(fā)一種準確簡便的沼澤山雀性別鑒定方法,對后續(xù)的分子研究極為重要。
發(fā)明內(nèi)容
為了解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明提供一種準確簡便的,可操作性強的沼澤山雀性別鑒定方法。
本發(fā)明采用的技術(shù)方案是:一種準確簡便鑒定沼澤山雀性別的引物,所述的引物的DNA序列為:
2550F 5’-GTTACTGATTCGTCTACGAGA-3’
RevP1 5’-TGAGGAAACAAGCACTGGAC-3’
一種準確簡便鑒定沼澤山雀性別的方法,包括如下步驟:
1)提取沼澤山雀的基因組總DNA;
2)以基因組總DNA為模板,利用權(quán)利要求1所述的引物進行PCR擴增反應(yīng),獲得擴增產(chǎn)物;
PCR擴增反應(yīng)程序為:94℃/7min;94℃/30s,58℃/30s,72℃/45s,30個循環(huán);72℃/7min,4℃保存。
3)將獲得擴增產(chǎn)物進行2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,用Dolphin-Doc凝膠成像儀進行拍照記錄,根據(jù)帶型判斷沼澤山雀的性別。帶型判斷標準為:雌性為兩條帶,雄性為一條帶,即雌性為兩條帶,長度分別為447bp和635bp,雄性為一條帶,長度為447bp。
本發(fā)明的有益效果是:本發(fā)明的方法,樣本簡單(如羽毛、血液樣本)、采樣量低、可非損傷性取樣、雙陽性檢驗。本發(fā)明的方法主要是基因水平的性別鑒定技術(shù),使得鑒定結(jié)果更為可靠,可廣泛應(yīng)用于鳥類的性別鑒定。自染色體螺旋蛋白基因(Chromobox-helicase-DNA binding gene,CHD)是鳥類性染色體上同源區(qū)的基因,該基因在演化的過程中相對保守。在Z和W染色體上各有一個拷貝,該拷貝外顯子序列相似,但內(nèi)含子序列長度存在差異。因此,本發(fā)明根據(jù)內(nèi)含子序列兩側(cè)的側(cè)翼序列設(shè)計引物,在PCR的結(jié)果中,雄性可以擴增出1個條帶,雌性可以擴增出兩個條帶,因而,可以根據(jù)PCR電泳結(jié)果中的條帶數(shù)判定鳥類的性別。本發(fā)明利用對CHD基因在W,Z染色體上的特異序列的擴增所產(chǎn)生的不同帶型來判斷沼澤山雀的性別,無需特殊儀器要求,鑒定方法簡便易行,快速準確,可重復(fù)性強,為今后對沼澤山雀分子生物學(xué)領(lǐng)域進一步深入探究奠定了基礎(chǔ)。
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