[發明專利]與地中海水牛優良泌乳性狀相關的單倍型組合與應用

有效

• 申請號: 201810248057.1
• 申請日: 2018-03-24
• 公開（公告）號: CN108504745B
• 公開（公告）日: 2021-05-28
• 發明（設計）人: 滑國華;孫暉;鄧廷賢;楊利國;魏鵬飛;邵寶順;張燊;杜超
• 申請（專利權）人: 華中農業大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京智為時代知識產權代理事務所(普通合伙) 11498
• 代理人: 王加嶺

本發明屬于家畜分子標記篩選技術領域。具體涉及與地中海水牛優良泌乳性狀相關的單倍型組合與應用。所述的分子標記從地中海水牛中克隆得到，篩選得到12個與泌乳性狀關聯的SNP標記，利用一個或其組合標記組成的單倍型對地中海水牛泌乳性狀進行關聯分析。ACSL1基因12個SNP標記的序列如SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:12所示。本發明還涉及ACSL1_SNP1至ACSL1_SNP12位點基因型的檢測引物的開發和優良單倍型組合序列的應用，所述單倍型組合序列與地中海水牛高峰奶量、270d產奶量和270d乳蛋白量的性狀顯著相關。本發明為地中海水牛的標記輔助選擇提供了新的遺傳標記資源。

技術領域

本發明屬于水牛分子標記篩選和輔助選擇技術領域。具體涉及與地中海水牛優良泌乳性狀相關的SNP標記及其單倍型組合與應用。本發明篩選到與地中海水牛泌乳性狀關聯的位于ACSL1基因上的12個SNP標記(簡稱為ACSL1_SNP1至ACSL1_SNP12)，本發明利用一種具有優良泌乳性狀的ACSL1_SNP1-12位點上的單倍型組合對地中海水牛泌乳性狀進行關聯分析應用。

背景技術

水牛是全球第二大產奶家畜，是我國南方地區重要的畜種之一。水牛奶富含高乳脂、乳蛋白、礦物質和維生素等營養成分，其營養價值遠超于荷斯坦奶牛所產的奶。盡管水牛奶享譽著“乳中之王”的美名，但因其自身的產奶量低，極大地限制了水牛作為奶畜的應用價值。截至目前，水牛尚未形成專門化的乳用品種，即使是產奶量較高的地中海水牛(產奶指數5左右)，距專門化乳用品種(MPI7)尚有一定差距。因此，培育高乳品質、高產奶量的水牛新品種是當今水牛育種工作的一大重點。借鑒荷斯坦奶牛育種成功的經驗，利用分子育種技術，對產奶性狀進行遺傳改良，培育出專門化的乳用品種，是水牛育種工作的重要方向。

水牛的產奶性狀主要包括產奶量、乳脂量、乳蛋白量、乳脂率和乳蛋白率。基于這五種產奶性狀，利用標記輔助選擇(Marker Assisted Selection，MAS)技術，通過對產奶性狀基因或與之連鎖的遺傳標記的選擇，實現對控制性狀的數量性狀基因座(QuantitativeTrait Loci，QTL)的選擇，尋找對產奶性狀有明顯效應的主效基因，進而應用于水牛產奶性狀的改良，對于培育專門化乳用品種具有重要意義。(杜超,魏鵬飛,郭妮妮,等.水牛產奶性狀分子標記研究進展[J].中國畜牧雜志,2017,53(5):10-16.)

全基因組關聯分析(Genome-Wide Association Study，GWAS)是應用基因組中數以百萬計的單核苷酸多態性(Single Nucleotide Ploymorphism，SNP)為分子遺傳標記，進行全基因組水平上的對照分析或相關性分析。隨著高密度SNP標記的高通量檢測技術的發展,全基因組關聯分析已成為鑒定畜禽經濟性狀基因的重要途徑。Cosenza等研究了175頭意大利地中海水牛的CSN1S1基因的單核苷酸多態性，結果發現3個SNP位點，分別位于第17外顯子(c.628CT)和第19外顯子(c.882GA，c.977AG)，其中，c.628CT導致了絲氨酸突變為亮氨酸，該SNP位點與乳蛋白率顯著相關，且CC基因型個體乳蛋白率顯著高于CT與TT基因型個體。(Cosenza G,Pauciullo A,Macciotta N P P,et al.Mediterranean riverbuffalo CSN1S1gene:search for polymorphisms and associationstudies[J].AnimalProduction Science,2014,55(5):1007–1027.)因此，可利用該位點的C等位基因在產奶性狀的優勢表型，固定優勢C等位基因，人工選育出具有優良泌乳性狀的水牛。