[發明專利]一種用于鑒定翡翠貽貝的SNP分子標記

有效

• 申請號: 201810247626.0
• 申請日: 2018-03-23
• 公開（公告）號: CN108315437B
• 公開（公告）日: 2021-07-27
• 發明（設計）人: 陳丹丹;李榮華;陳興強;王春琳;母昌考;宋微微;葉央芳;劉磊;史策
• 申請（專利權）人: 寧波大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 北京科億知識產權代理事務所(普通合伙) 11350
• 代理人: 湯東鳳

本發明提供一種用于鑒定翡翠貽貝的snp分子標記，位于核苷酸序列為SEQ ID NO:1的基因片段的第76位和第89位，其中第76位核苷酸為A/C，第89位核苷酸為A/G。本發明篩選獲得了能夠鑒別翡翠貽貝的SNP位點，通過檢測該SNP位點，利用高分辨率熔解曲線方法可以對翡翠貽貝進行基因分型。本發明從分子水平對翡翠貽貝品種進行鑒定，擺脫了靠表型進行鑒別的局限性。

技術領域

本發明屬于種群鑒定技術領域，具體涉及一種用于鑒定翡翠貽貝的SNP分子標記。

背景技術

貽貝屬于軟體動物門(Mollusca)，雙殼綱(Bivalvia)，異柱目(Anisomyaria)，貽貝科(Mytilidae)，廣泛分布于溫帶和亞北極地區的潮間帶。貽貝的世界年產量1985年為40多萬噸，近10年來，中國人工培育貽貝苗成功，華北華東沿海地區已進行大規模人工養殖，2015年總產量達到84.5萬余噸，位居貝類養殖產量的前列，其中主要以養殖和出口的紫貽貝(Mytilus edulis)、厚殼貽貝(Mytilus coruscus)和翡翠貽貝(Perna viridis)這三種經濟貝類為主。

該科生物在我國已發現的有近50個種，分為18個屬。而浙江沿海地帶有代表性的主要種屬有貽貝屬(Genus Mytilus Linnaeus)、隔貽貝屬(Genus Septifer Recluz)、肌蛤屬(Genus Musclus Roding)、股貽貝屬(Genus perna Retzius)、毛貽貝屬(GenusTrichomya Ihering)、偏頂蛤屬(Genus Modiolus Lamarck)、黑蕎麥蛤屬(GenusVignadula KurodaHabe)、石蟶屬(Genus Lithophaga Roding)等。

目前對貽貝屬分類常采用貝殼形狀、鉸合齒等外部形態特征，但是貽貝品種間在浮游期、稚貝期外形相似，且自然雜交個體、脫殼販賣個體、表型受環境塑造后的個體，單憑外形較難區分。而且，隨著分子標記輔助遺傳育種在水產領域中的廣泛應用，也需要開發一套高效實用的貽貝品種鑒定方法，為貽貝的生產育苗、科學研究和市場整頓提供有力的依據。

發明內容

本發明的目的是提供一種用于鑒定翡翠貽貝的snp分子標記，通過檢測該分子標記，可以有效的將翡翠貽貝(Perna viridis)與目前主要養殖的紫貽貝(Mytilus edulis)和厚殼貽貝(Mytilus coruscus)區分開，從而有效的進行翡翠貽貝的雜交和品系提純的研究。

本發明所提供的SNP標記，位于核苷酸序列為SEQ ID NO:1的基因片段的第76位和第89位，其中第76位核苷酸為A/C，第89位核苷酸為A/G；

其中SEQ ID NO:1的基因片段的序列如下：

GCATTCGTATTACGGTGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGCCGTAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTCAGAGGTTCGAAGACGATCAGATACCGT；

本發明再一個方面提供一種鑒定翡翠貽貝的方法，是通過檢測上述的SNP位點來實現；

其中一種實施例的具體記載，是采用高分辨率溶解曲線法進行，通過PCR引物對待檢測個體的核酸樣品進行擴增后，再進行基因分析確定的；

所述的PCR引物是用于擴增包含上述SNP位點的核苷酸片段；

其中一種具體的引物，其上游引物的序列如下：

5′-GCATTCGTATTACGGTGTT-3′(SEQ ID NO:2)、

下游引物的序列如下：

5′-ACGGTATCTGATCGTCTTCG-3′(SEQ ID NO:3)。