[發(fā)明專利]檢測食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌和gyrA基因的引物、試劑盒和方法

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201810176257.0
• 申請日: 2018-03-02
• 公開（公告）號(hào): CN108315449A
• 公開（公告）日: 2018-07-24
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 吳冰;蔡先全;李蓉;邱德義
• 申請（專利權(quán)）人: 蔡先全
• 主分類號(hào): C12Q1/689
• 分類號(hào): C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/145
• 代理公司: 中山市興華粵專利代理有限公司 44345
• 代理人: 吳劍鋒

1.一種檢測食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌及gyrA基因的引物，其特征在于該引物和探針組合的序列分別為:

上游引物recAF:tgggagattctcacgttggtc

下游引物recAR:gcttgcttaaatggaggagca

探針recAP:acaacaccaggtggtagagcgt

上游引物gyrAF:tggtgaggaaaaagaaccagt

下游引物gyrAR:tgtgtcttgcatttttgtgtgt

探針gyrAP:ggaccagatttccctacagcagga。

2.一種檢測食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌及gyrA基因的數(shù)字PCR檢測試劑盒，其特征在于該試劑盒中20.0μL反應(yīng)體系包括以下組分:其中2×ddPCR Super Mix 10.0μL，上、下游引物各1.0μL、探針各1.0μL，DNA模板4.0μL。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的試劑盒，其特征在于所述的上游引物recAF與上游引物gyrAF的含量比例為0.1-1:1。

4.根據(jù)權(quán)利要求2或3所述的試劑盒，其特征在于所述的下游引物recAR與下游引物gyrAR的含量比例為0.1-1:1。

5.一種檢測食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌及gyrA基因的方法，其特征在于包括以下步驟:

A、提取樣品DNA；

B、將各反應(yīng)組分加入如權(quán)利要求2所述的20.0μl反應(yīng)體系，然后加入70.0μl礦物油，混勻后轉(zhuǎn)移到微滴發(fā)生器上自動(dòng)產(chǎn)生微滴；同時(shí)分別取所述試劑盒中的陽性質(zhì)控、和陰性質(zhì)控，按照與步驟A相同的方法處理，得到相應(yīng)的DNA模板；

C、將制備數(shù)字PCR混合液制作為油包水PCR微反應(yīng),并全部轉(zhuǎn)移到96孔反應(yīng)板PCR反應(yīng)管中；再將96孔反應(yīng)板在封膜儀上封膜，并置于普通PCR儀進(jìn)行PCR反應(yīng)；

D、打開微滴熒光檢測器應(yīng)用軟件，將PCR反應(yīng)結(jié)束后的96孔反應(yīng)板直接插入設(shè)備，檢測每PCR反應(yīng)管中微滴的PCR反應(yīng)情況,最后根據(jù)珀松分布定律算出待測基因的拷貝數(shù)。

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的檢測方法，其特征在于步驟C中PCR擴(kuò)增的反應(yīng)程序按以下步驟進(jìn)行:

(1)94℃預(yù)變性3min；

(2)94℃變性10s，57.6℃退火1min，共進(jìn)行40個(gè)循環(huán)；

(3)98℃酶熱失活10min；

(4)4℃停止反應(yīng)。

7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的檢測方法，其特征在于步驟A所述的提取樣品DNA:挑取經(jīng)可疑的單個(gè)菌落,加入200μl滅菌重蒸水中,制備產(chǎn)氣莢膜梭菌菌懸液,將其置于干式恒溫器上100℃加熱20min,然后于12000r/min離心10min,取上清液分裝Eppendorf管,作為擴(kuò)增反應(yīng)的DNA粗制模板，溶解于50μL的TE溶液中。