[發明專利]不同體積數字PCR定量分析方法在審
| 申請號: | 201810070368.3 | 申請日: | 2018-01-24 |
| 公開(公告)號: | CN110066856A | 公開(公告)日: | 2019-07-30 |
| 發明(設計)人: | 盛廣濟 | 申請(專利權)人: | 思納福(北京)醫療科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6851 | 分類號: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京華進京聯知識產權代理有限公司 11606 | 代理人: | 趙永輝 |
| 地址: | 100094 北京市海淀區*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 數字PCR 定量分析 核酸擴增反應 置信區間 標準差 微液滴 檢測 個數量級 耗材成本 起始拷貝 核酸 獲知 | ||
通過不同體積數字PCR的定量分析方法,可以獲得的ln(c)相應的標準差σ以及置信區間。通過ln(c)相應的標準差σ以及置信區間可以得到待測核酸擴增反應液的核酸濃度為c,因此也可以獲知所述待測核酸擴增反應液中含有的DNA起始拷貝數目。所述不同體積數字PCR的定量分析方法可以利用少于200個微液滴實現5個數量級的檢測動態范圍,提高了數字PCR檢測儀器的檢測動態范圍。并且,其性能可以和擁有12000個微液滴的單一體積數字PCR相媲美,節省了儀器的成本,耗材成本降低。
技術領域
本發明涉及數字PCR定量分析領域,特別是涉及一種不同體積數字PCR定量分析方法。
背景技術
數字PCR(Digital PCR,dPCR)是一種核酸分子絕對定量技術。相較于qPCR,數字PCR可讓你能夠直接數出DNA分子的個數,是對起始樣品的絕對定量。定量PCR是依靠標準曲線或參照基因來測定核酸量,而數字PCR則讓你能夠直接數出DNA分子的個數,是對起始樣品的絕對定量。但是,目前數字PCR定量檢測無論是微孔式還是液滴式的數字PCR技術,采用的都是是單一體積數字PCR技術。
單一體積數字PCR的定量上限主要取決于反應單元的體積和數量,檢測下限與樣本總體積相關。單一體積數字PCR的定量分析方法需要連續對待測核酸擴增反應液進行稀釋,增加了試劑的用量和交叉污染的風險,操作步驟繁瑣。因此,單一體積數字PCR的定量分析方法縮小了數字PCR檢測儀器的檢測動態范圍,從而無法提高檢測靈敏度。
發明內容
基于此,有必要針對單一體積數字PCR的定量檢測方法靈敏度低的問題,提供一種檢測動態范圍大的的不同體積數字PCR定量分析方法。
本發明提供一種不同體積數字PCR的定量分析方法,包括:
S4310:獲取所有微液滴體積v1,v2,...vm,所述體積為v1,v2,...vm依次對應的微液滴的數目n1,n2,…,nm,以及所述體積為v1,v2,...vm依次對應的微液滴核酸擴增后的陰性微液滴數目b1,b2,…,bm;
S4320:根據所有微液滴核酸擴增后的相關參數v1、v2,...vm,n1,n2,…,nm,b1,b2,…,bm,構建關于待測核酸擴增反應液濃度c的聯合二項分布函數f(c);
S4330:根據聯合二項分布函數f(c),求使得所述聯合二項分布函數f(c)取極值時c的值;
S4340:將所述聯合二項分布函數f(c)轉化為關于ln(c)的聯合二項分布函數F(Λ),獲得關于ln(c)的標準差以及置信區間;
S4350:根據ln(c)的標準差以及置信區間,獲取所述待測核酸擴增反應液濃度c的標準差以及置信區間。
在其中一個實施例中,所述S4310包括:
S4311:將含有目標核酸的樣品溶液微滴化,獲得多個不同體積v1,v2,...vm的微液滴,所述微液滴體積為v1,v2,...vm依次對應的微液滴的數目n1,n2,…,nm;
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