[發明專利]一種用于抗病刺參選育的遺傳分子標記組合及其應用

有效

• 申請號: 201810039072.5
• 申請日: 2018-01-16
• 公開（公告）號: CN108165637B
• 公開（公告）日: 2018-11-02
• 發明（設計）人: 廖梅杰;王印庚;李彬;劉安然;榮小軍;陳貴平;范瑞用;張正
• 申請（專利權）人: 中國水產科學研究院黃海水產研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京科億知識產權代理事務所(普通合伙) 11350
• 代理人: 湯東鳳

本發明公開了一種用于抗病刺參選育的遺傳分子標記組合及其應用。屬于水產遺傳育種領域。所述標記組合為3個與刺參抗燦爛弧菌侵染相關的SNP標記SNP88、SNP112和SNP126，3個標記的優勢基因型分別為SNP88(CC)、SNP112(AA)、SNP126(TT)；應用該遺傳標記進行育種操作步驟包括(1)親本DNA提取及分型；(2)親本選擇；(3)子代苗種繁育3個部分。本發明為從遺傳上提高刺參抗燦爛弧菌侵染這一經濟性狀提供了有效的分子標記，用該遺傳標記對刺參進行標記輔助選擇，開展抗病育種，可以提高刺參抗燦爛弧菌侵染的能力，從根本上降低刺參腐皮綜合征的發病率，對提高養殖成活率和養殖效益具有重要意義。

技術領域

本發明屬于水產遺傳育種領域，具體地涉及一種用于抗病刺參選育的遺傳分子標記組合及其應用。

背景技術

刺參屬于棘皮動物門Echinodermata、海參綱Holothuroidea，是我國北方重要的海珍品之一。近年來，我國刺參養殖得以長足發展，規模拓展迅猛，直接經濟產值約300億元，是我國海水養殖產業中單一產值最大的物種，為沿海漁業經濟結構的調整和漁民就業及增產增收提供了重要途徑。但是隨著刺參產業規模的不斷拓展，種質退化、生長緩慢、養殖周期長、抵御環境變化能力差、病害頻發等一系列制約或潛在制約產業發展的瓶頸問題也日益凸顯。其中最突出的是環境承載力過大和海參種質退化導致的病害頻發、養殖成活率低等現象。刺參病害頻繁發生，每年造成約30億元的經濟損失，給刺參產業造成了重創，因而刺參種質退化已成為制約刺參養殖健康發展的瓶頸，一方面直接影響到養殖者的增產增收和產業效益，另一方面也關系到第五次養殖浪潮的可持續發展。通過提高刺參自身抵抗力抵御病害是刺參健康養殖最有效的方法。因此，對刺參進行遺傳改良，培育出具有抗病力強等優良性狀的新品種，是刺參養殖業健康發展的重要保證。

在刺參產業發展過程中，長期的流行病學研究結果表明，影響刺參養殖業的主要疾病種類有苗期的爛邊病、爛胃病、化板病以及養成期的腐皮綜合征(亦稱化皮病)等。國內已發現的養殖刺參主要疾病的病原以細菌為主，其中弧菌是刺參病害的主要致病菌，燦爛弧菌是保苗和養殖期重大疾病——腐皮綜合征(化皮病)的主要致病原。該病原引發的腐皮綜合征給我國的刺參養殖造成了巨大損失，致使產業發展面臨著前所未有的挑戰。因此，選育具有抗燦爛弧菌等優勢性狀的新品種對于抵抗產業風險，重拾養殖業者信心，提高產業效益具有重要的現實意義。

刺參的良種選育工作相對于其他經濟水產生物開展的較晚，目前的選育方式仍以選擇育種和雜交育種為主，其他如分子輔助育種、基因組選擇育種等核心育種技術研究尚處于初級階段。

為了開發刺參抗病分子標記，申請人構建了刺參高密度遺傳連鎖圖譜，利用方差分析及復合區間作圖對抗燦爛弧菌侵染性狀進行QTL定位，選擇抗病QTL區段且可適于引物設計的SNP位點，應用所設計的引物在擴大的群體里進行SNP標記驗證，篩選出抗病性狀相關位點、位點的優勢基因型及優勢二倍型，并在選育實踐中進行了生產性驗證，最終得到了可用于刺參抗病分子標記輔助選擇育種的標記組合和優勢基因型。

利用該方法建立了刺參分子輔助育種方法，并將其應用到刺參良種選育過程，培育抗病刺參新品種，將有效解決刺參養殖產業目前面臨的種質退化和病害等瓶頸問題，且有力推動刺參養殖良種化進程。

發明內容

本發明要解決的技術問題是提供一種用于抗病刺參選育的遺傳分子標記組合及其應用，包括分子標記引物及相關標記的優勢基因型和優勢二倍型，并將其用于刺參抗病材料的選育。

本發明是按如下技術方案實現的：

一種用于抗病刺參選育的遺傳分子標記組合,其中遺傳分子標記組合包含3個與刺參抗燦爛弧菌侵染相關的SNP標記SNP88、SNP112和SNP126；這3個遺傳標記的抗病優勢基因型分別為SNP88(CC)、SNP112(AA)、SNP126(TT)。