[發明專利]用于樣品分析的裝置和方法

有效

• 申請號: 201780056500.9
• 申請日: 2017-09-14
• 公開（公告）號: CN109715646B
• 公開（公告）日: 2023-02-10
• 發明（設計）人: S·洛朗松;M·A·海登;J·B·赫夫;A·費希爾;J·魯濱遜;S·R·霍萊茨-麥科馬克
• 申請（專利權）人: 雅培實驗室
• 主分類號: C12Q1/6853
• 分類號: C12Q1/6853;C07H21/02;C12N15/09
• 代理公司: 中國貿促會專利商標事務所有限公司 11038
• 代理人: 譚瑋

公開了包括與檢測組件集成的樣品制備組件的集成裝置。所述樣品制備組件可為數字微流體模塊或表面聲波模塊，所述模塊用于將樣品液滴與試劑液滴組合且用于進行額外樣品制備步驟，產生含有指示所述樣品中所關注分析物的存在或不存在的珠粒/顆粒/標記的液滴?？赏ㄟ^將所述液滴移動到所述裝置的所述檢測組件來檢測所述珠粒/顆粒/標記，所述檢測組件包括井陣列。此處公開的檢測模塊可用于檢測所關注分析物，所述分析物可能已經通過擴增、分離或其它技術富集。

相關申請的交叉引用

本申請要求2016年9月15日提交的美國臨時專利申請第62/395,255號的權益，所述申請以全文引用的方式并入本文中。

背景技術

分析物分析通常通過執行人工地或使用復雜的機器人技術進行的樣品制備步驟來進行。在樣品制備之后，所制備的樣品中分析物的測定進一步涉及使用昂貴和復雜的系統，所述系統用于將所制備的樣品輸送到隨后進行所制備的樣品中分析物的分析的機器。

可用于制備樣品并測定所制備的樣品的集成裝置在分析物分析的領域中是高度需要的。這類集成裝置將提供低成本選項且將顯著地增加進行分析物分析的簡易性，尤其在臨床應用，例如定點照護應用中。

因此，對用于進行分析物分析的集成裝置存在興趣。

發明內容

提供了一種用于檢測樣品中靶核酸的存在的方法。在某些實施例中，所述方法包括：通過擴增來擴增樣品中的靶核酸以產生擴增產物，其中擴增將標簽并入到擴增產物中，其中擴增包含少于15個擴增循環；在包含特異性結合到標簽的結合成員的多個捕獲物體上捕獲擴增產物，從而產生包含捕獲物體-擴增產物的復合物；可檢測地標記復合物中的擴增產物以產生可檢測標記復合物；將捕獲物體空間上分隔到多個井中，其中井被定大小以使每個井含有不超過一個捕獲物體；以及檢測多個井中可檢測標記復合物的存在。

在某些實施例中，擴增包含少于14個擴增循環、少于13個擴增循環、少于11個擴增循環或少于10個擴增循環。在某些實施例中，擴增包含5到15個擴增循環、5到13個擴增循環、6到15個擴增循環、6到10個擴增循環、8到15個擴增循環、8到13個擴增循環、8到10個擴增循環、2到10個擴增循環、3到10個擴增循環、4到10個擴增循環、5到10個擴增循環或3到5個擴增循環。每個擴增循環使擴增循環開始時存在的靶核酸的數量加倍。在某些情況下，擴增產生隨后檢測的約6000個靶核酸分子。在某些情況下，通過擴增循環產生且通過本文所描述的方法可檢測的靶核酸分子的數量為少于10000個，例如9000個、8000個、7000個、6000個、5000個、4000個、3000個、1000個，例如10,000到100個、8000到3000個、7000到5000個或6500到5500個。本發明方法可用于檢測在擴增之前樣品中存在的低到100、50、30、10或5個靶核酸。在某些實施例中，本發明方法適用于檢測樣品中的少量靶核酸分子，例如在僅15輪或更少輪擴增之后樣品中的5到100個或5到50個分子。

在某些實施例中，一種用于檢測樣品中靶核酸的存在的方法包括：通過擴增來擴增樣品中的靶核酸以產生擴增產物，其中擴增將標簽并入到擴增產物中，其中擴增進行了少于30分鐘或少于10分鐘；在包含特異性結合到標簽的結合成員的多個捕獲物體上捕獲擴增產物，從而產生包含捕獲物體-擴增產物的復合物；可檢測地標記復合物中的擴增產物以產生可檢測標記復合物；將捕獲物體空間上分隔到多個井中，其中井被定大小以使每個井含有不多于一個捕獲物體；以及檢測多個井中可檢測標記復合物的存在。

在某些實施例中，擴增進行了少于9分鐘、少于8分鐘、少于7分鐘、少于6分鐘、少于5分鐘、少于4分鐘、少于3分鐘、少于2分鐘、少于1分鐘或少于30秒。